cluster # 6416

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Schistosoma mansoni
cluster # 6416 cluster # 6416 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6416#0 length = 420 sequences # 4

consensusID : consensus_6416#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 420
fasta sequence

                              [TCAGGATTATGAGTATAATACT-AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA]

[+] EMBL CD164741             [TCAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACATGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTATGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATACTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTCCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATGAGACATATAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTT ]
[-] EMBL CD164720             [ CAGGATTATGAGTAT ATACTNAGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA]
[-] EMBL CD164732             [ CAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA]
[-] EMBL CD164710             [ CAGGATTATGAGTATAATACT AGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATCCTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTAGCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGAATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTTCGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACATATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATCTGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA]




>consensus_6416#0
TCAGGATTATGAGTATAATACTAGGTAAGAATAAGAAATCGATTGACGAGTTAGTAAATC
CTCATCAAATGAGGTGGTTGGGACGTGCGTTATGTATGTCCATGTAAATAGGCATAGGTA
GCTTACGAATTCCTCACGAATTTTTTTGGTCTTAATTTAACTAACTTGTTTTCTACTCGA
ATTGTATCTAATCTTTTCTATTACCACTGATGCTGTTACTACCTCTCCTATCCTTGGGTT
CGGTCTAACGACTTCGCCTCTTTGTGATAATGAAGTATAGCAACTTGAACCGATGTACAT
ATGTACCAGATTCTACGTTGTGACATCTGTATTATAAGACATAAAGTATAAACTTCGATC
TGAAGTTTATGCCTCAGCAAAGCCATTAATATACAAAGATTTAAACCAAATTTGAGCTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case