cluster # 6429

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Schistosoma mansoni
cluster # 6429 cluster # 6429 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6429#0 length = 637 sequences # 4

consensusID : consensus_6429#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 637
fasta sequence

                              [TAGAATCATGGTTGGTCTAGCTTCTAATACCTCCAGGATCTTCATTATCACGTGA-TTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATCCAGATATATGTTTCAAATTGTTTACAAAAGCTCAATTACGTTTAGAACAAGCTGGACATGCAATTGTTCGTTTCAATTTTCCTGCACTTGTATTTCAGAGTCTTCATAATACAACATA]

[+] EMBL CD167535             [TAGAATCATGGTTGGTCTAGCTTCTAATACCTCCAGGATCTTCATTATCACGTGA TTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATC                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD167544             [                                         tgATTATCACGTGACTTTACTTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCGTCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTCACAACGGATCCTAATTCATGTGA                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD093232             [                                                                                      TGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATCGTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGATTTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATCAGCTTATGATCTATTAAATGCTGC TTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTATGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCT                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD167556             [                                                                                                                                                                                           GTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAGAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATCTATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAAGTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTACTCATTTTTCATCACGTTTAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGGATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTACGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATCCAGATATATGTTTCAAATTGTTTACAAAAGCTCAATTACGTTTAGAACAAGCTGGACATGCAATTGTTCGTTTCAATTTTCCTGCACTTGTATTTCAGAGTCTTCATAATACAACATA]




>consensus_6429#0
TAGAATCATGGTTGGTCTAGCTTCTAATACCTCCAGGATCTTCATTATCACGTGATTTAC
TTCGCCTCCTGTATCTACCATTAGATGGTTCATTTCCCCAATCAATGAGTGGTGTTCATC
GTATAAGTGCTCCTGTAACATCACTTAGTGATTTACGCACAGTGCTAGGAATGTCCGGAT
TTCGACGTTTAGTTTCATTATTAGATCCAAAAACTACCAAATGTCGATTAGCTTATGATC
TATTAAATGCTGCTTTAGAACGTGATCAACGTCAGCGTCAAATGTTACAATTTACTCAAA
GTATTAGCAAATATGATGCAAATAAAGGTTCATCATCATGTGCTCATTTTTCATCACGTT
TAACTACTGAAGCAGATCTAGATAATTTATTTGAATTAATTGATGGATTGTTAACAACGG
ATCCTAATTCATGTGAAGATCCAAATGAATTCATTGATGCACAAAGTTTAATAGCTGGTA
TGCTGCATATTCTAGGACCAAGTCCTAAAAGTCTAGATCCAGATATATGTTTCAAATTGT
TTACAAAAGCTCAATTACGTTTAGAACAAGCTGGACATGCAATTGTTCGTTTCAATTTTC
CTGCACTTGTATTTCAGAGTCTTCATAATACAACATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case