cluster # 6441

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Schistosoma mansoni
cluster # 6441 cluster # 6441 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6441#0 length = 532 sequences # 4

consensusID : consensus_6441#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 532
fasta sequence

                              [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACATAA]

[+] EMBL CD122347             [TTCCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAAAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACATAA]
[+] EMBL CD122406             [TTTCATTATTTCTTCTTCGTCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACAT  ]
[+] EMBL CD122389             [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTAGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACATGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAATGTATTTGT                                           ]
[+] EMBL CD122379             [TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGGATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGTGGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTTATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAATGATACTACATATTACTATAGCCATATTCACACCACCATTTGATCGACATTTTAATGGCCAATATAAACAATTCACCCGATCAATACTAAATGCAACTAATAAACAACCAGAATTAAATACAAACCATGTACCAATTAATTCCATTAATTGACACGACAACAATGAGAAGGTATCTAATTTAATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGGAATCATCC                                                         ]




>consensus_6441#0
TTTCATTATTTCTTCTTCATCATGATGATTATCAATACAATCTGAACAATGAGATAATGG
ATACATTTGATTCGATGTAGTATAGTTATTCATTATACTACTATTATCCATAAGAGTAGT
AGTAGTAATAGTATTCATAGTAGTATTGATAAAGTTAGTTAATGTCATATTTGCATTTTT
ATCAATTAAAGTTTGTAACATAGCATATGGTATACTTAATATCAATCCAATGATTACAAT
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AATAATGATGCTTTGATTAGTTATATAATATAAACCTCTTCCAAGGAAATCATCCAAAAA
TGTATTTGTTATTAAGACAAGACTGTCAGAAATAGCTAAAGTGATCACATAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case