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Schistosoma mansoni
cluster # 6455 cluster # 6455       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6455#0 length = 906 sequences # 4  

consensusID : consensus_6455#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 906
fasta sequence
                              [TGATAGGATTTTTATTTATCTAGGTTGCATAATGAATAATGTACTAATTGACTGTTAAAATTAACTACAATGGGCAAAATTAAACAGTCTGTCATTCAAAACTATGGTAAAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATCATAGTAAGATAACTAATGTGGTTCTAGAGTATAGGGTACCTCATTTGTTCTGTGTGAAAATGAGGTCATACAGAGCTTCTAAAATACAACCGACACTCCACGCTTGAGCTTCACAACTATCTTTACATAGCTGACCATTCGCATTTGTCAATTCCGGAAGAGAACACCACTGACTTGATTCCATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA-TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCTGTGTATCCTCCAGACGAACCAACAGAATCCCTATAAATTCCTTTATTATATAATAAGTTAGGGTCTTTTGTGCTTTCCGGAATCCAAAAGTGCGATTCGAAGGAATTTTTCAACATATTTGACCATTCTTTCCATGAAAGTTCCTTACCAGTTGCCAGTTGAACACCTGCATG]

[+] EMBL BF936379             [TGATAGGATTTTTATTTATCTAGGTTGCATAATGAATAATGTACTAATTGACTGTTAAAATTAACTACAATGGGCAAAATTAAACAGTCTGTCATTCAAAACTATGGTAAAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATCATAGTAAGATAACTAATGTGGTTCTAGAGTATAGGGTACCTCATTTGTTCTGTGTGAAAATGAGGTCATACAGAGCTTCTAAAATACAACCGACACTCCACGCTTGAGCTTCACAACTATCTTTACATAGCTGACCATTCGCATTTGTCAATTCCGGAAGAGAACACCACTGACTTGATTCCATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTATTCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL SM104                [                                                                                                tcAAACTATGGT AAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD187383             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCT                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD168947             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCTGTGTATCCTCCAGACGAACCAACAGAATCCCTATAAATTCCTTTATTATATAATAAGTTAGGGTCTTTTGTGCTTTCCGGAATCCAAAAGTGCGATTCGAAGGAATTTTTCAACATATTTGACCATTCTTTCCATGAAAGTTCCTTACCAGTTGCCAGTTGAACACCTGCATG]


>consensus_6455#0 TGATAGGATTTTTATTTATCTAGGTTGCATAATGAATAATGTACTAATTGACTGTTAAAA TTAACTACAATGGGCAAAATTAAACAGTCTGTCATTCAAAACTATGGTAAAAATTTCAAA ATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATCATAGTAA GATAACTAATGTGGTTCTAGAGTATAGGGTACCTCATTTGTTCTGTGTGAAAATGAGGTC ATACAGAGCTTCTAAAATACAACCGACACTCCACGCTTGAGCTTCACAACTATCTTTACA TAGCTGACCATTCGCATTTGTCAATTCCGGAAGAGAACACCACTGACTTGATTCCATTCT CTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACC CCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATA GTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGA AAAGTCACAGCTATCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACT CAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCA TGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCG TAGCTGATTATCTGTGTATCCTCCAGACGAACCAACAGAATCCCTATAAATTCCTTTATT ATATAATAAGTTAGGGTCTTTTGTGCTTTCCGGAATCCAAAAGTGCGATTCGAAGGAATT TTTCAACATATTTGACCATTCTTTCCATGAAAGTTCCTTACCAGTTGCCAGTTGAACACC TGCATG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)