|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6455#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 906 fasta sequence
[TGATAGGATTTTTATTTATCTAGGTTGCATAATGAATAATGTACTAATTGACTGTTAAAATTAACTACAATGGGCAAAATTAAACAGTCTGTCATTCAAAACTATGGTAAAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATCATAGTAAGATAACTAATGTGGTTCTAGAGTATAGGGTACCTCATTTGTTCTGTGTGAAAATGAGGTCATACAGAGCTTCTAAAATACAACCGACACTCCACGCTTGAGCTTCACAACTATCTTTACATAGCTGACCATTCGCATTTGTCAATTCCGGAAGAGAACACCACTGACTTGATTCCATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA-TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCTGTGTATCCTCCAGACGAACCAACAGAATCCCTATAAATTCCTTTATTATATAATAAGTTAGGGTCTTTTGTGCTTTCCGGAATCCAAAAGTGCGATTCGAAGGAATTTTTCAACATATTTGACCATTCTTTCCATGAAAGTTCCTTACCAGTTGCCAGTTGAACACCTGCATG]
[+] EMBL BF936379 [TGATAGGATTTTTATTTATCTAGGTTGCATAATGAATAATGTACTAATTGACTGTTAAAATTAACTACAATGGGCAAAATTAAACAGTCTGTCATTCAAAACTATGGTAAAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATCATAGTAAGATAACTAATGTGGTTCTAGAGTATAGGGTACCTCATTTGTTCTGTGTGAAAATGAGGTCATACAGAGCTTCTAAAATACAACCGACACTCCACGCTTGAGCTTCACAACTATCTTTACATAGCTGACCATTCGCATTTGTCAATTCCGGAAGAGAACACCACTGACTTGATTCCATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTATTCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAA ]
[-] EMBL SM104 [ tcAAACTATGGT AAAATTTCAAAATAAAGATAACATTTTATAGATAAGGGATTGCTGAACTAGTGTTATAATAATC ]
[+] EMBL CD187383 [ CATTCTCTGATTCAGTCTGGCAAATGTTTTCTGGCATTCTGTAGTTACGTCGAGAGTGAGATGACCCCATTTTTTAGGATCAAGTTGGCCTAACATGCGAGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCT ]
[-] EMBL CD168947 [ AGCGAATTTAAGACGAGCGCGTAAATAGTATCCAGTTGGCCACAACCATTCTGGCCCTTGATGATAATTAAAACCACGAGCTATAGAAAAGTCACAGCTA TCATTTGAGTTATCATAATATCCTCGATAAGCTAAATCATCTCGACTCAAAGTGCACATACCAAATGGACCAGTTAATCGTTGTTGAGCTATTTCCAGTGCATTCCATGCCCGTTCAGGTGTAAATAATTCAGGGGCTACAACCATAGTTATAAGGAAATTGGGGCGTAGCTGATTATCTGTGTATCCTCCAGACGAACCAACAGAATCCCTATAAATTCCTTTATTATATAATAAGTTAGGGTCTTTTGTGCTTTCCGGAATCCAAAAGTGCGATTCGAAGGAATTTTTCAACATATTTGACCATTCTTTCCATGAAAGTTCCTTACCAGTTGCCAGTTGAACACCTGCATG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||