cluster # 6468

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Schistosoma mansoni
cluster # 6468 cluster # 6468 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6468#0 length = 360 sequences # 4

consensusID : consensus_6468#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 360
fasta sequence

                              [GATAACCTTATTCATAGGATTATACTTACTTGCATTTGATATTCTTATTCACTTTAACTACCAACTGCTGACAACATACATGTTTGTTTATTTTTCTGATTTATTTTTTCCCTGCTTTGTTTAACAATTATGCCAGTCAACGTTTTTCACGTATATCCACACACACCCACTCAATTTATAAATAATACTATCTTATAGAGTTGTGTGAAGA-TGTATTATTTCTGTGAATAATTTTATTTG-TTTATTGTTTTTGGACGTTCCTTTATTTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCCAATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGATTATCCACACACATAAG]

[-] EMBL CD177803             [GATAACCTTATTCATAGGATTATACTTACTTGCATTTGATATTCTTATTCACTTTAACTGCCAACTGCTGACAACATACATGTTTGTTTATTTTTCTGATTTATTTTTTCCCTGCTTTGTTTAACAATTATGCCAGTCAACGTTTTTCACGTATATCCACACACACCCACTCAATTTATAAATAATACTATCTTATAGAGTTGTGTGAAGA TGTATTATTTCTGTGAATAATTTTATTTG TTTATTGTTTTTGGACGTTCCTTTATTTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCCAATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGATTATCC           ]
[+] EMBL CD093512             [   AACCTTATTCATAGGATTATACTTACTTGCATTTGATATTCTTATTCACTTTAACTACCAACTGCTGACAACATACATGTTTGTTTATTTTTCTGATTTATTTTTTCCCTGCTTTGTTTAACAATTATGCCAGTCAACGTTTTTCACGTATATCCACACACACCCACTCAATTTATAAATAATACTATCTTATAGAGTTGTGTGAAGA TGTATTATTTCTGTGAATAA TTTACTTG TTTATTGTTTTCGGACGTTCCTTTATGTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCCAATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGATTATCCACACACATAA ]
[-] EMBL CD093493             [    ACCTTATTCATAGGATTATACTTACTTGCATTTGATATTCTTATTCACTTTAACTACCAACTGCTGACAACATACATGTTTGTTTATTTTTCTGATTTATTTTTTCCCTGCTTTGTTTAACAATTATGCCAGTCAACGTTTTTCACGTATATCCACACACACCCACTCAATTTATAAATAATACTATCTTATAGAGTTGTGTGAAGA TGTATTATTTCTGTGAATAATTTTATTTG TTTATTGTTTTCGGACGTTCCTTTATGTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCCAATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGA TATCCACACACATAAG]
[-] EMBL CD171501             [                                                                                                                                                                                                               AAGATTGTATTATTTCTGTGAATAATTTTATTTGTTTTATTGTTTTTGGACGTTCCTTTATTTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCCAATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGATTATCC           ]




>consensus_6468#0
GATAACCTTATTCATAGGATTATACTTACTTGCATTTGATATTCTTATTCACTTTAACTA
CCAACTGCTGACAACATACATGTTTGTTTATTTTTCTGATTTATTTTTTCCCTGCTTTGT
TTAACAATTATGCCAGTCAACGTTTTTCACGTATATCCACACACACCCACTCAATTTATA
AATAATACTATCTTATAGAGTTGTGTGAAGATGTATTATTTCTGTGAATAATTTTATTTG
TTTATTGTTTTTGGACGTTCCTTTATTTATTTCTATATTCTCTTTAAGAGTTTGCTATCC
AATCTTCTTGCCAGTCACTCTCCCTGTTTTTGTCTCATTTTGATTATCCACACACATAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case