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Schistosoma mansoni
cluster # 6492 cluster # 6492       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6492#0 length = 739 sequences # 4  

consensusID : consensus_6492#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 739
fasta sequence
                              [GCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCCATACAATTTTTTTTATTTTTTATATTCACTGAATTTCAACTGTTTCAATTTTGAAAAATTCGTTGAATTTAGTTTTTGAAAAAAAAGAGGTTTGATTATTTAATGGCAGTTTTCGTCATTGTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCA-GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTTTCATAGATATATAAAATTGGAAGCTCTGGCGGGAGATTTAAAGGGATTGGATTGAATGAGAATNTCNGTTGNTTACTCATCACT]

[+] EMBL AI977604             [GCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCCATACAATTTTTTTTATTTTTTATATTCACTGAATTTCAACTGTTTCAATTTTGAAAAATTCGTTGAATTTAGTTTTTGAAAAAAAAGAGGTTTGATTATTTAATGGCAGTTTTCGTCATTGTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTT                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD134674             [                                                                                                                                                                                    GTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGGGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTTTCATAGATATATAAAATTGGAAGCTCTGGCGGGAGATTTAAAGGGATTGGATTGAATGAGAATNTCNGTTGNTTACTCATCACT]
[+] EMBL CD134776             [                                                                                                                                                                                    GTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGGGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTCTCATAGATATATAAAATTGGAAGCT                                                           ]
[-] EMBL AI390075             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCAGGCAAAATTAACTAGTGTAATGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAATTGATATCTATATGTAGATATCAATTATGGA                                                                                                                                                                ]


>consensus_6492#0 GCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCC ATACAATTTTTTTTATTTTTTATATTCACTGAATTTCAACTGTTTCAATTTTGAAAAATT CGTTGAATTTAGTTTTTGAAAAAAAAGAGGTTTGATTATTTAATGGCAGTTTTCGTCATT GTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACA ATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAA GTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGC TAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGAT ACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCAGCAAAATTA ACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATAT TCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGA GAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTTTCATA GATATATAAAATTGGAAGCTCTGGCGGGAGATTTAAAGGGATTGGATTGAATGAGAATNT CNGTTGNTTACTCATCACT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)