These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6492#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 739 fasta sequence [GCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCCATACAATTTTTTTTATTTTTTATATTCACTGAATTTCAACTGTTTCAATTTTGAAAAATTCGTTGAATTTAGTTTTTGAAAAAAAAGAGGTTTGATTATTTAATGGCAGTTTTCGTCATTGTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCA-GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTTTCATAGATATATAAAATTGGAAGCTCTGGCGGGAGATTTAAAGGGATTGGATTGAATGAGAATNTCNGTTGNTTACTCATCACT] [+] EMBL AI977604 [GCAGTACGGTAATGCAGCTGCATGGCATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTCCATACAATTTTTTTTATTTTTTATATTCACTGAATTTCAACTGTTTCAATTTTGAAAAATTCGTTGAATTTAGTTTTTGAAAAAAAAGAGGTTTGATTATTTAATGGCAGTTTTCGTCATTGTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTT ] [+] EMBL CD134674 [ GTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGGGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTTTCATAGATATATAAAATTGGAAGCTCTGGCGGGAGATTTAAAGGGATTGGATTGAATGAGAATNTCNGTTGNTTACTCATCACT] [+] EMBL CD134776 [ GTTGTTGTAGACGTCGTCGAGATGTGACACTTTTTTTTACGTATGTATGTGTATACTACAATTTTAATGGCTTCAATATTCATAATAATTAAAGGTAATTAACAGTAATTAATTAATTAAGTAGTATAATAAGAACAGTGATAAAAACCAGTTCATCGTAGTAAACATAGAACTATTAGCTAGTTTATAATTGTATATATAAAGAAAAAGAATGATTAATATTTTATTTCAGTAAATGATACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGGGAGAAAGCA GCAAAATTAACTAGTGTAGTGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAAGTGATATCTATATGTAGATATCAATTATTGATGTGTGTGTCTGTGAAAAAGAGAGAAGAAATTCAGTGTGTGTATATATATATATACTTATGGATGTTTGTGAATTCTCATAGATATATAAAATTGGAAGCT ] [-] EMBL AI390075 [ ACATTTTCATTAAAAATACAATCAGCAGTACAGTAAGAAGGAGAGAAAGCAGGCAAAATTAACTAGTGTAATGGAAAAGTTAGATTTGACAAATGTTTCCTTTCTTTTTCCAAGTATATATTCACCAAATTGATATCTATATGTAGATATCAATTATGGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||