cluster # 6518

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Schistosoma mansoni
cluster # 6518 cluster # 6518 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6518#0 length = 580 sequences # 4

consensusID : consensus_6518#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 580
fasta sequence

                              [GATCTAAGGCTATATCAGCTCCACTCTTGGTTCTCACGTCCTCCATCGTCCTTCTGAACTTCGTATTGATGCAGATACGGTTGATTTATTTCTGTGTAGTGTGTATATGGGGTACAGATGATGGCTGAGTATAAAAGACCAATTATTCCCTGCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAACTATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACTAGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCACTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGATTGTTGTGCTTATGAAATAATAAGTTAGTAACAAACAAAACGTTTTCTAGAGTTAGATATGTTCTGTAAGATTGCGTTAAGTTAACCTTTAGCAGTAAAAAATATACAACCTTGTTAGTGTCTCTACGTATATAACTGATGTATATAAAACCTATGTATATAGCCTCCAAATGCCCTGGCACGGCTGAGAGTGGGGAGAGTACTCCCTCCCTCTCCAAAT]

[+] EMBL CD147393             [GATCTAAGGCTATATCAGCTCCACTCTTGGTTCTCACGTCCTCCATCGTCCTTCTGAACTTCGTATTGATGCAGATACGGTTGATTTATTTCTGTGTAGTGTGTATATGGGGTACAGATGATGGCTGAGTATAAAAGACCAATTATTCCCTGCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAACTATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACTAGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCACTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGATTGTTGTGCTTATGAAATAATAAGTTAGTAACAAACAAAACGTTTTCTAGAGTTAGATATGTTCTGTAAGATTGCGTTAAGTTAACCTTTAGCAGTAAAAA                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD147392             [GATCTAAGGCTATATCAGCTCCACTCTTGGTTCTCACGTCCTCCATCGTCCTTCTGAACTTCGTATTGATGCAGATACGGTTGATTTATTTCTGTGTAGTGTGTATATGGGGTACAGATGATGGCTGAGTATAAAAGACCAATTATTCCCTGCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAACTATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACTAGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCACTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGATTGTTGTGCTTATGAAATAATAAGTTAGTAACAAACAAAACGTTTTCTAGAGTTAGATATGTTCTGTAAGATTGCGTTAAGTTAACCTTT                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD147376             [                                                                                                                                    AAAAGACCAATTATTCCCTGCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAACTATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACTAGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCACTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGATTGTTGTGCTTATGAAATAATAAGTTAGTAACAAACAAAACGTTTTCTAGAGTTAGATATGTTCTGTAAGATTGCGTTAAGTTAACCTTTAGCAGTAAAAAATATACAACCTTGTTAGTGTCTCTACGTATATAACTGATGTATATAAAACCTATGTATATAGCCTCCAAATGCCCTGGCACGGCTGAGAGTGGGGAGAGTACTCCCTCCCTCTCCAAAT]
[-] EMBL CD147361             [                                                                                                                                                       GCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAACTATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACTAGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCACTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGATTGTTGTGCTTATGAAATCATAAGGTAGTTAC                                                                                                                                                                                            ]




>consensus_6518#0
GATCTAAGGCTATATCAGCTCCACTCTTGGTTCTCACGTCCTCCATCGTCCTTCTGAACT
TCGTATTGATGCAGATACGGTTGATTTATTTCTGTGTAGTGTGTATATGGGGTACAGATG
ATGGCTGAGTATAAAAGACCAATTATTCCCTGCGTATTCGATTTTTAATTCTCAAAAAAC
TATGTGTATTATGTACTGTGCTTCGTATCATTTTGAAATTGAGATTTCTCTAAGTAAACT
AGATTACCACGCTGAATGTCACAGCAAGCTGATGGTGTGCCCTTTGAAATCTCGTTACCA
CTTATTCGAATGCAAACCCATCGAATCAAAGTAAAATTCTGTGATCACTCCTTAGTAAGA
TTGTTGTGCTTATGAAATAATAAGTTAGTAACAAACAAAACGTTTTCTAGAGTTAGATAT
GTTCTGTAAGATTGCGTTAAGTTAACCTTTAGCAGTAAAAAATATACAACCTTGTTAGTG
TCTCTACGTATATAACTGATGTATATAAAACCTATGTATATAGCCTCCAAATGCCCTGGC
ACGGCTGAGAGTGGGGAGAGTACTCCCTCCCTCTCCAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case