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Schistosoma mansoni
cluster # 652 cluster # 652       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_652#0 length = 604 sequences # 2  

consensusID : consensus_652#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 604
fasta sequence
                              [TTTGATCTTGAAGATGGGTTTGTGCGCACAACTTGACAACTGTTTTCCGTCCAGTATACGCCGTCATGTAGGACTTATTCTTGGTATTCTGGATTTATTCTTTTTTGGAGGATATCATTATGGATTTAATTCCCTAATTGGTATTTACAAATCCTTGGGTTTATTCGCTTACAACTGCACACAATCTGGTTGTATGTACAAAGAAGATATGTTTGGAATCAGCTTTAACGTATGGTTTGTTTCACAAATGTGCCTCATTACGTTGGCCGGAATATTTATGGATAGAGTTGGATTGAGACCTTTAAAATTGGCTTCAACATTAATGTATGCTGCTGGCACTCTTTATGTTTGCTTTTACAACTGGTAAAGTGGCACCACTTTTCTTTACTGCTGGTATTCTGGTTGCACTAAGTAGTATATGCAGCCTAATTTGTAATCATCAAATTAGTTCAATGTTCCCACATTTTCGTGGAATATGCATATCACTTATTTCCGGAGCCTTTGATTCGAGTACAGTTGTAGCGTATGTTATATCGAAATATCACCCCTATTTTTCACTTCAGTGGTCATTTATATCATTATCAATAGGTTCATTCATTATGGG]

[+] EMBL BF936562             [TTTGATCTTGAAGATGGGTTTGTGCGCACAACTTGACAACTGTTTTCCGTCCAGTATACGCCGTCATGTAGGACTTATTCTTGGTATTCTGGATTTATTCTTTTTTGGAGGATATCATTATGGATTTAATTCCCTAATTGGTATTTACAAATCCTTGGGTTTATTCGCTTACAACTGCACACAATCTGGTTGTATGTACAAAGAAGATATGTTTGGAATCAGCTTTAACGTATGGTTTGTTTCACAAATGTGCCTCATTACGTTGGCCGGAATATTTATGGATAGAGTTGGATTGAGACCTTTAAAATTGGCTTCAACATTAATGTATGCTGCTGGCACTCTTTATGTTTGCTTTTACAACTGGTAAAGTGGCACCACTTTTCTTTACTGCTGGTATTCTGGTTGCACTAAGTAGTATATGCAGCCTAATTTGTAATCATCAAATTAGTTCAATGTTCCCACATTTTCGTGGAATATGCATATCACTTATTTCCGGAGCCTTTGATTCGAGTACAGTTGTAGCGTATGTTATATCGAAATATCACCCCTATTTTTCACTTCAGTGGTCATTTATATCATTATCAATAGGTTCATTCATTATGGG]
[+] EMBL CD184727             [                 GTTTGTGCGCACAACTTGACAACTGTTTTCCGTCCAGTATACGCCGTCATGTAGGACTTATTCTTGGTATTCTGGATTTATTCTTTTTTGGAGGATATCATTATGGATTTAATTCCCTAATTGGTATTTACAAATCCTTGGGTTTATTCGCTTACAACTGCACACAGTCTGGTTGTATGTACAAAGAAGATATGTTTGGAATCAGCTTTAACGTATGGCTTGTTTCACAAATGTGCCTCATTACATTGGCCGGAATATTTATGGATAGAGTTGGATTGAGACCTTTAAAATTGGCTTCAACATTAATGTATGCTGCTGGCACTC TTATGTTTGCTTTTACAACTGGTAAA                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_652#0 TTTGATCTTGAAGATGGGTTTGTGCGCACAACTTGACAACTGTTTTCCGTCCAGTATACG CCGTCATGTAGGACTTATTCTTGGTATTCTGGATTTATTCTTTTTTGGAGGATATCATTA TGGATTTAATTCCCTAATTGGTATTTACAAATCCTTGGGTTTATTCGCTTACAACTGCAC ACAATCTGGTTGTATGTACAAAGAAGATATGTTTGGAATCAGCTTTAACGTATGGTTTGT TTCACAAATGTGCCTCATTACGTTGGCCGGAATATTTATGGATAGAGTTGGATTGAGACC TTTAAAATTGGCTTCAACATTAATGTATGCTGCTGGCACTCTTTATGTTTGCTTTTACAA CTGGTAAAGTGGCACCACTTTTCTTTACTGCTGGTATTCTGGTTGCACTAAGTAGTATAT GCAGCCTAATTTGTAATCATCAAATTAGTTCAATGTTCCCACATTTTCGTGGAATATGCA TATCACTTATTTCCGGAGCCTTTGATTCGAGTACAGTTGTAGCGTATGTTATATCGAAAT ATCACCCCTATTTTTCACTTCAGTGGTCATTTATATCATTATCAATAGGTTCATTCATTA TGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)