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Schistosoma mansoni
cluster # 6544 cluster # 6544       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6544#0 length = 1256 sequences # 4  
consensusID : consensus_6544#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1256
fasta sequence 
                              [TGTAAAGTCCCGTTTACATTGAGTAACATCGAGTTGTTTATTTATATATATACAAGTACGCTTTACTTTTTGGGGTTGTTAAGTGAAAAAGGATCCGTTTTCGGAGTTATCTGTTGCTTTTTGATTTTCTTTTCTCTGTGTCTCTATCGTTGCGTCCTTTCCTGGAAGGTATTACGTTTGTCCAACAACCATTTTCTACGCCTTTTGTTAGATGCACGTCTACCAGCATGCTTATCTTTGTACGGTTTGTATATTACTTGGCTTCTCAGTGTATGTTTTTATCTAGGTTCACATATTTTTACAAGAACGTTCATTTCTGTTCCTAATACTATCCTTTGTACTGGTATTTTTCTCCTACATGTCCATGTTAGTTTGATCCTGGCTTCTATTAAGCTTTTGATCTTACCCGTCAAAAGTTGCAATTTGTACAGAGTGATTTCTACTTCATTTTTATCTATGGAAGTAGTTAGTTTTCTTCTTATTTTATCTTATTCTGCGTGGAAATTCTATCTAAGCGAGTCATCTCTTATGCACCTAGGATACGCTGAAATATCGAGTCATGTCATTTTCTTAACTGTTATATTTTGTATTCTATATATCTATGAAAATTTGTTGCCGTCATTACAGTTGGAATTATTTTCTATGGACAGAATTACTATTTTACCTTCTGATTCTTGTAGTCTGTGCACTTTACCATTGTTTCAACCTAGTATCTTGACATCAGATGTTACTCTCAACTTCAGTGGCGAATGCCAGCACTTAATGCATATGTCATGTGCACAAATTTCGGAATCGATCTCATTTCCTTGCTTGCGATGTTCTGCTGAATCTTTCATCTGTGTACAGGATACCCATAATAATTCGGTGACTTTCAATGAATTACACTCTAGCTATGCTAACTCTGAAGTATCTAATACCTCACATTCACCTAGAAGAATGTTCACTCGAGCTCTTCCATTTACTGATGATAAAGATGTAGATTTAAGCGTTTACTTAAATTCGTCTCAATTCAATAAAAGCAATATAAGCCGAACATTACGCAGACTGGATGGATCCAGTTCTTCTTTGTTTTCTGTTGATGACGATGTTGACAACGACGTTTTATCAACAGATAGTGCTGAATGGAATTATAATAATCCTAGTTACGAATCAGATATAAGCAGCTTTGAAAACAAAACATAATATTCAGCATTATCCACTTATTTATTGGCTTTTAAAACGAATATTTTTACATCATTTTTTTCTGGGAAACAAGA]

[-] EMBL CD066483             [TGTAAAGTCCCGTTTACATTGAGTAACATCGAGTTGTTTATTTATATATATACAAGTACGCTTTACTTTTTGGGGTTGTTAAGTGAAAAAGGATCCGTTTTCGGAGTTATCTGTTGCTTTTTGATTTTCTTTTCTCTGTGTCTCTATCGTTGCGTCCTTTCCTGGAAGGTATTACGTTTGTCCAACAACCATTTTCTACGCCTTTTGTTAGATGCACGTCTACCAGCATGCTTATCTTTGTACGGTTTGTATATTACTTGGCTTCTCAGTGTATGTTTTTATCTAGGTTCACATATTTTTACAAGAACGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD079125             [                                                                                                                                                                                                                        CGTCTACCCGCATGCTTATCTTTGTACGGTTTGTATATTACTTGGCTTCTCAGTGTATGTTTTTATCTAGGTTCACATATTTTTACAAGAACGTTCATTTCTGTTCCTAATACTATCCTTTGTACTGGTATTTTTCTCCTACATGTCCATGTTAGTTTGATCCTGGCTTCTATTAAGCTTTTGATCTTACCCGTCAAAAGTTGCAATTTGTACAGAGTGATTTCTACTTCATTTTTATCTATGGAAGTAGTTAGTTTTCTTCTTATTTTATCTTATTCTGCGTGGAAATTCTATCTAAGCGAGTCATCTCTTATGCACCTAGGATACGCTGAAATATCGAGTCATGTCATTTTCTTAACTGTTATATTTTGTATTCTATATATCTATGAAAATTTGTTGCCGTCATTACAGTTGGAATTATTTTCTATGGACAGAATTACTATTTTACCTTCTGATTCTTGTAGTCTGTGCACTTTACCATTGTTTCAACCTAGTATCTTGACATCAGATGTTACTCTCAACTTCAGTGGCGAATGCCAGCACTTAATGCATATGTCATGTGCACAAATTTCGGAATCGATCTCATTTCCTTGCTTGCGATGTTCTGCTGAATCTTTCATCTGTGTACAGGATACCCATAATAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD167394             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAATATCGAGTCATGTCATTTTCTTAACTGTTATATTTTGTATTCTATATATCTATGAAAATTTGTTGCCGTCATTACAGTTGGAATTATTTTCTATGGACAGAATTACTATTTTACCTTCTGATTCTTGTAGTCTGTGCACTTTACCATTGCTTCAACCTAGTATCTTGACATCAGATGTTACTCTCAACTTCAGTGGCGAATGCCAGCACTTAATGCATATGTCATGCGCACCAATTTCGGAATCGATCTCATTTCCTTGCTTGCGATGTTCTGCTGAATCTTTCATCTGTGTACAGGATACCAATAATAATTCGGTGACTTTCAATGAATTACACTCTAGCTATGCTAACTCTGAAGTATCTAATACCTCACATTCACCTAGAAGAATGTTCACTCGAGCTCTTCCATTTACTGATGATAAAGATGTAGATTTAAGCGTTTACTTAAATTCGTC                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD117152             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGAATTACACTCTAGCTATGCTAACTCTGAAGTATCTAATACTTCAAATTCA CTAGAAGAATCTTCA TCAAGCTCTTCCATTTA TGATGATAAAGATGTAGATTTAAGCGTTTACTTAAATTCGGATCAATTCAATAAAAGCAATATAAGCCGAACATTACGCAGACTGGATGGATCCAGTTCTTCTTTGTTTTCTGTTGATGACGATGTTGACAACGACGTTTTATCAACAGATAGTGCTGAATGGAATTATAATAATCCTAGTTACGAATCAGATATAAGCAGCTTTGAAAACAAAACATAATATTCAGCATTATCCACTTATTTATTGGCTTTTAAAACGAATATTTTTACATCATTTTTTTCTGGGAAACAAGA]




>consensus_6544#0
TGTAAAGTCCCGTTTACATTGAGTAACATCGAGTTGTTTATTTATATATATACAAGTACG
CTTTACTTTTTGGGGTTGTTAAGTGAAAAAGGATCCGTTTTCGGAGTTATCTGTTGCTTT
TTGATTTTCTTTTCTCTGTGTCTCTATCGTTGCGTCCTTTCCTGGAAGGTATTACGTTTG
TCCAACAACCATTTTCTACGCCTTTTGTTAGATGCACGTCTACCAGCATGCTTATCTTTG
TACGGTTTGTATATTACTTGGCTTCTCAGTGTATGTTTTTATCTAGGTTCACATATTTTT
ACAAGAACGTTCATTTCTGTTCCTAATACTATCCTTTGTACTGGTATTTTTCTCCTACAT
GTCCATGTTAGTTTGATCCTGGCTTCTATTAAGCTTTTGATCTTACCCGTCAAAAGTTGC
AATTTGTACAGAGTGATTTCTACTTCATTTTTATCTATGGAAGTAGTTAGTTTTCTTCTT
ATTTTATCTTATTCTGCGTGGAAATTCTATCTAAGCGAGTCATCTCTTATGCACCTAGGA
TACGCTGAAATATCGAGTCATGTCATTTTCTTAACTGTTATATTTTGTATTCTATATATC
TATGAAAATTTGTTGCCGTCATTACAGTTGGAATTATTTTCTATGGACAGAATTACTATT
TTACCTTCTGATTCTTGTAGTCTGTGCACTTTACCATTGTTTCAACCTAGTATCTTGACA
TCAGATGTTACTCTCAACTTCAGTGGCGAATGCCAGCACTTAATGCATATGTCATGTGCA
CAAATTTCGGAATCGATCTCATTTCCTTGCTTGCGATGTTCTGCTGAATCTTTCATCTGT
GTACAGGATACCCATAATAATTCGGTGACTTTCAATGAATTACACTCTAGCTATGCTAAC
TCTGAAGTATCTAATACCTCACATTCACCTAGAAGAATGTTCACTCGAGCTCTTCCATTT
ACTGATGATAAAGATGTAGATTTAAGCGTTTACTTAAATTCGTCTCAATTCAATAAAAGC
AATATAAGCCGAACATTACGCAGACTGGATGGATCCAGTTCTTCTTTGTTTTCTGTTGAT
GACGATGTTGACAACGACGTTTTATCAACAGATAGTGCTGAATGGAATTATAATAATCCT
AGTTACGAATCAGATATAAGCAGCTTTGAAAACAAAACATAATATTCAGCATTATCCACT
TATTTATTGGCTTTTAAAACGAATATTTTTACATCATTTTTTTCTGGGAAACAAGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)