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Schistosoma mansoni
cluster # 6549 cluster # 6549       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6549#0 length = 1077 sequences # 4  
consensusID : consensus_6549#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1077
fasta sequence 
                              [GGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACATTTCCCTAGTTAAATCCTCATAATAACGTTATGTCGGGATAATGAACAAATGAGTGGTATCTCCTAGGTATTGATTAAAGTGTATTGTTATATGTATTCTTATACTGTTTATAATTATAAGTAACTAGATCCTGAATATACTAATGTTCCTCTTATCTCAAGTTTCCATTTGACCCATTAGCTACTGTTATGCGATTTACAGTTCTTGATTTCTCCCAGACCTATTAGTTACGCACACCAATACTTACATCCCTTTTGGGATTGAACTTGTATAATAATTATTTTTGATTTATGTTGTGATGCGGTCTGATCTGCGTGTATATAAACCACATATGCCTGGAATATACGATTCGTATAGCGGAGACTGATGTATGTGTTGTGGACCAAACTGAGTGAGCTATATGAGAAGCCGTTATACAAAGGACCATTAATGTTTCGGAAGTGAGTTTGAGCGGTAAAGCTGACTACTATCGGTGGCTTAGTACAGGGGCAATGTCACATGCAACAGGGATAGTCTACAAACACATTAGACGGGTTAAACTTTGTAGGCGTTTAGGCAGCGATTTGATTGTTTATTTATGAACATGACT-AAAAAATTGTTCTCCTCATTTTCGTGATATACATTTAGGTGTATTTGCGGTTGGTTTAACTTCATATATGCCCACTTGTTTTAAAGGCTGTTGCTCGTCACGAATAATTAGTATTATCGATTATTTGCCAAGACATGGAAATATACCTTTTTATGTCTTCGCCTTTGATATTATTTTTTTTGTATTGACCATATGTTACGGGAGAACTGAAGACATTTGGCTGATTAAAACCTTTTTACTGTACATCAATTTTACTGTGTTTTTGGATGTGTTTGTTTTACTTAACCTTTGGACTTGTTTGTTTATATAATTCTTTTCGGACATTTCGGTTTCTTTTGTCATTGGTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGGTTTGTTTTGTAATTGTTATAATTATTGTTGTTAGAACGACTTTATTTGTGAATTGCGAATAAACTTGGTA]

[+] EMBL CD080855             [GGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACATTTCCCTAGTTAAATCCTCATAATAACGTTATGTCGGGATAATGAACAAATGAGTGGTATCTCCTAGGTATTGATTAAAGTGTATTGTTATATGTATTCTTATACTGTTTATAATTATAAGTAACTAGATCCTGAATATACTAATGTTCCTCTTATCTCAAGTTTCCATTTGACCCATTAGCTACTGTTATGCGATTTACAGTTCTTGATTTCTCCCAGACCTATTAGTTACGCACACCAATACTTACATCCCTTTTGGGATTGAACTTGTATAATAATTATTTTTGATTTATGTTGTGATGCGGTCTGATCTGCGTGTATATAAACCACATATGCCTGGAATATACGATTCGTATAGCGGAGACTGATGTATGTGTTGTGGACCAAACTGAGTGAGCTATATGAGAAGCCGTTATACAAAGGACCATTAATGTTTCGGAAGTGAGTTTGAGCGGTAAAGCTGACTACTATCGGTGGCTTAGTACAGGGGCAATGTCACATGCAACAGGGATAGTCTACAAACACATTAGACGGGTTAAACTTTGTAGGCGTTTAGGCAGCGATTTGATTGTTTATTTATGAACATGACT AAAAAATTGTT   CTCATTTTCGTGATATACATTTAGGTGTATTTGCGGTTGGTTTAACTTCATATATGCCCACTTGTTTTAAAGGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD166129             [                                            CATAATAACGTTATGTCGGGATAATGAACAAATGAGTGGTATCTCCTAGGTACTGATGAAAGTGTATTGTTATATGTATTCTTATGCTGTTTATAATTATAAGTAACTAGATCCTGAATATACTAATGTTCCTCTTATCTCAAGTTTCCA  CGACCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD195499             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTCGTATAGCGGAGACTGATGTATGTGTTGTGGACCAAACTGAGTGAGCTATATGAGAAGCCGTTATACAAAGGACCATTAATGTTTCGGAAGTGAGTTTGAGCGGTAAAGCTGACTACTATCGGTGGCTTAGTACAGGGGCAATGTCACATGCAACAGGGATAGTCTACAAACACATTAGACGGGTTAAACTTTGTAGGCGTTTAGGCAGCGATTTGATTGTTTATTTATGAACATGACTAAAAAAATTGTTCTCCTCATTTTCGTGATATACATTTAGGTGTATTTGCGGTTGGTTTAACTTCATATATGCCCACTTGTTTTAAAGGCTGTTGCTCGTCACGAATAATTAGTATTATCGATTATTTGCCAAGACATGGAAATATACCTTTTTATGTCTTCGCCTTTGATATTATTTTTTTTGTATTGACCATATGTTACGGGAGAACTGA                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD074859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AAGCCGTTATACAAAGGACCATTAATGTTTCGGAAGTGAGTTTGAGCGGTAAAGCTGACTACTATCGGTGGCTTAGTACAGGGGCAATGTCACATGCAACAGGGATAGTCTACAA  ACATTAGACGGGTTAAACTTTGTAGGCGTTTAGGCAGCGATTTGATTGTTTATTTATGAACATGACT AAAAAATTGTTCTCCTCATTTTCGTGATATACATTTAGGTGTATTTGCGGTTGGTTTAACTTCATATATGCCCACTTGTTTTAAAGGCTGTTGCTCGTCACGAATAATTAGTATTATCGATTATTTGCCAAGACATGGAAATATACCTTTTTATGTCTTCGCCTTTGATATTATTTTTTTTGTATTGACCATATGTTACGGGAGAACTGAAGACATTTGGCTGATTAAAACCTTTTTACTGTACATCAATTTTACTGTGTTTTTGGATGTGTTTGTTTTACTTAACCTTTGGACTTGTTTGTTTATATAATTCTTTTCGGACATTTCGGTTTCTTTTGTCATTGGTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGGTTTGTTTTGTAATTGTTATAATTATTGTTGTTAGAACGACTTTATTTGTGAATTGCGAATAAACTTGGTA]




>consensus_6549#0
GGCCAANAATTTGGCACGAGGAGACATTTCCCTAGTTAAATCCTCATAATAACGTTATGT
CGGGATAATGAACAAATGAGTGGTATCTCCTAGGTATTGATTAAAGTGTATTGTTATATG
TATTCTTATACTGTTTATAATTATAAGTAACTAGATCCTGAATATACTAATGTTCCTCTT
ATCTCAAGTTTCCATTTGACCCATTAGCTACTGTTATGCGATTTACAGTTCTTGATTTCT
CCCAGACCTATTAGTTACGCACACCAATACTTACATCCCTTTTGGGATTGAACTTGTATA
ATAATTATTTTTGATTTATGTTGTGATGCGGTCTGATCTGCGTGTATATAAACCACATAT
GCCTGGAATATACGATTCGTATAGCGGAGACTGATGTATGTGTTGTGGACCAAACTGAGT
GAGCTATATGAGAAGCCGTTATACAAAGGACCATTAATGTTTCGGAAGTGAGTTTGAGCG
GTAAAGCTGACTACTATCGGTGGCTTAGTACAGGGGCAATGTCACATGCAACAGGGATAG
TCTACAAACACATTAGACGGGTTAAACTTTGTAGGCGTTTAGGCAGCGATTTGATTGTTT
ATTTATGAACATGACTAAAAAATTGTTCTCCTCATTTTCGTGATATACATTTAGGTGTAT
TTGCGGTTGGTTTAACTTCATATATGCCCACTTGTTTTAAAGGCTGTTGCTCGTCACGAA
TAATTAGTATTATCGATTATTTGCCAAGACATGGAAATATACCTTTTTATGTCTTCGCCT
TTGATATTATTTTTTTTGTATTGACCATATGTTACGGGAGAACTGAAGACATTTGGCTGA
TTAAAACCTTTTTACTGTACATCAATTTTACTGTGTTTTTGGATGTGTTTGTTTTACTTA
ACCTTTGGACTTGTTTGTTTATATAATTCTTTTCGGACATTTCGGTTTCTTTTGTCATTG
GTTTGGTATTTGGGAGTTTTTGCTCCGGGAACCTACAAAATTGAAGGTTTGTTTTGTAAT
TGTTATAATTATTGTTGTTAGAACGACTTTATTTGTGAATTGCGAATAAACTTGGTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)