Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6550 cluster # 6550       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6550#0 length = 1164 sequences # 4  
consensusID : consensus_6550#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1164
fasta sequence 
                              [CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAATCCAAACTTTTCTGTCCAATTGTGTCCAATGGGTTTCGCTGATATTGAACAATGTTAATTTGCATTTCTTCTTTTCCGTAATTATTGACTAGTCCTCCCAGTCTCACACATTGTTCGGACATTTGACTAAGCTAAATTGTTTTTGGTGCTCAGGATGTCAGAAGAAGAAACTGTCTCGAGACTTCCTAAGAATCTCCGCTTTAACCATGAAACATCAAAATTCTTATGAAAGAACATCACTCAACTTCCAGGCCGGAGTTCGAAATGTGTAATTTTTTAATCTAGTTAACATTTGTACCGAGGTTCTATTCTACAGGATGGGATCGCCAACTTCATGCCAAACACTCCTCCTTAACCCAGATATATCATGGGCGATAACCATAGAACAGCTAAAGCAATAACCGAAATAAAAATTAATGTGAATTGTCTAGATAAACTACCTTCCTCCAAACTACGGTCTTCCAAATGGACAAGGACTATTTGCATACAAAATCTATTTCAAATCTGCTGAAATATGACGACTAATTTCAGTATTAAATGATTCGTTAACAATAATCGAAATTCATGAAATCAAATGATCATTATTAACTAATCATCCTGGAAGATGACCTCATCGTTATGCAATATTCTAACTATTGATGTTTATAGGCCACCAGTTATCCACTGTT-GGGTTGCAGTTCCTGACCTCTATTGATGAAAACTATTTTGGATATGATTCGGAATACTTTAAACTAAGTGATCGGTTTATTTGTTGTTCGAAGTGTATGGTCGTGTTTCCACGAGGCAACATTTTGTTGCTTGTCATAACCTTTGAATTGTTTGTAAAGTGAGATCGCTAAACAAACACATCAATGATTGAATGAAACGCTCACCACCACACTAACTTTCTTTGACCTTGTATGACTATGTTTTGTTTTATCCACCAATCACAATTTTATGTTCATTCTAAAACTATATTCGCCTTGTTGACTCATTTTTCCTATTCTCTAGTTACTGTTCGGTATGTCATTTATGTCTCTCCTTTTCCCTATGTAATAGACTGTACTGTTTATTTGCATACTAACGTTGTTAATTTACATTTTAGAAACAGATAAAGTTTATCAAGCCAAATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD080181             [CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAATCCAAACTTTTCTGTCCAATTGTGTCCAATGGGTTTCGCTGATATTGAACAATGTTAATTTGCATTTCTTCTTTTCCGTAATTATTGACTAGTCCTCCCAGTCTCACACATTGTTCGGACATTTGACTAAGCTAAATTGTTTTTGGTGCTCAGGATGTCAGAAGAAGAAACTGTCTCGAGACTTCCTAAGAATCTCCGCTTTAACCATGAAACATCAAAATTCTTATGAAAGAACATCACTCAACTTCCAGGCCGGAGTTCGAAATGTGTAATTTTTTAATCTAGTTAACATTTGTACCGAGGTTCTATTCTACAGGATGGGATCGCCAACTTCATGCCAAACACTCCTCCTTAACCCAGATATATCATGGGCGATAACCATAGAACAGCTAAAGCAATAACCGAAATAAAAATTAATGTGAATTGTCTAGATAAACTACCTTCCTCCAAACTACGGTCTTCCAAATGGACAAGGACTATTTGCATACAAAATCTATTTCAAATCTGCTGAAATATGACGACTAATTTCAGTATTAAATGATTCGTTAACAATAATCGAAATTCATGAAATCAAATGATCATTATTAACTAATCATCCTGGAAGATGACCTCATCGTTATGCAATATTCTAACTATTGATGTTTATAGGCCACCAGTTATCCACTGTTGGGGTTGCAGTTCCTGACCTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD074985             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACCGAAATAAAAATTAATGTGAATTGTCTAGATAAACTACCTTCCTCCAAACTACGGTCTTCCAAATGGACAAGGACTATTTGCATACAAAATCTATTTCAAATCTGCTGAAATATGACGACTAATTTCAGTATTAAATGATTCGTTAACAATAATCGAAATTCATGAAATCAAATGATCATTATTAACTAATCATCCTGGAAGATGACCTCATCGTTATGCAATATTCTAACTATTGATGTTTATAGGCCCCCAGTTATCCACTGTT GGGTTGCAGTTCCTGACCTCTATTGATGAAAACTATTTTGGATATGATTCGGAATACTTTAAACTAAGTGATCGGTTTATTTGTTGTTCGAAGTGTATGGTCGTGTTTCCACGAGGCAACATTTTGTTGCTTGTCATAACCTTTGAATTGTTTGTAAAGTGAGATCGCTAAACAAACCCATCAATGATTGAATGAAACGCTCCCCCCCCCACTAACTTTCTTTGACCTTGTATGACTATGTTTTGTTTTATCCCCCAATCACAATTTTATGTTCATTCTAAAACTATATTCGCCTTGTTGACTCATTTTTCCTATTCTCTAGTTACTGTTCGGTATGTCATTTATGTCTCTCCTTTTCCCTATGTAATAGACTGTACTGTTTATTTGCATACTAGAATTGTTAATTTACATTTTAGAAACAGATTTATTTTATC                               ]
[-] EMBL CD076971             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GACTATTTGCATACAAAATCTATTTCAAATCTGCTGAAATATGACGACTAATTTCAGTATTAAATGATTCGTTAACAATAATCGAAATTCATGAAATCAAATGATCATTATTAACTAATCATCCTGGAAGATGACCTCATCGTTATGCAATATTCTAACTATTGATGTTTATAGGCCACCAGTTATCCACTGTT GGGTTGCAGTTCCTGACCTCTATTGATGAAAACTATTTTGGATATGATTCGGAATACTTTAAACTAAGTGATCGGTTTATTTGTTGTTCGAAGTGTATGGTCGTGTTTCCACGAGGCAACATTTTGTTGCTTGTCATAACCTTTGAATTGTTTGTAAAGTGAGATCGCTAAACAAACACATCAATGATTGAATGAAACGCTCACCACCACACTAACTTTCTTTGACCTTGTATGACTATGTTTTGTTTTATCCACCAATCACAATTTTATGTTCATTCTAAAACTATATTCGCCTTGTTGACTCATTTTTCCTATTCTCTAGTTACTGTTCGGTATGTCATTTATGTCTCTCCTTTTCCCTATGTAATAGACTGTACTGTTTATTTGCATACTAACGTTGTTAATTTACATTTTAGAAACAGATAAAGTTTAT                                ]
[-] EMBL AI394952             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cTGGTTGTAAAGTGAGATCGCTAAACAAACACATCAATGATTGAATGAAACGCTCACCACCACACTAACTTTCTTTGACCTTGTATGACTATGTTCTGTTTTATCCACCAATCACAATTTTATGTTCATTCTAAAACTATATTCGCCTTGTTGACTCATTTTTCCTATTCTCTAGTTACTGTTCGGTATGTCATTTATGTCTCTCCTTTTCCCTATGTAATAGACTGTACTGTTTATTTGCATACTAACGTTGTTAATTTACATTTTAGAAACAGATAAAGTTTATTAAGCCAAATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_6550#0
CTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAATCCAAACTTTTCTGTCCAATTGTGTCCAA
TGGGTTTCGCTGATATTGAACAATGTTAATTTGCATTTCTTCTTTTCCGTAATTATTGAC
TAGTCCTCCCAGTCTCACACATTGTTCGGACATTTGACTAAGCTAAATTGTTTTTGGTGC
TCAGGATGTCAGAAGAAGAAACTGTCTCGAGACTTCCTAAGAATCTCCGCTTTAACCATG
AAACATCAAAATTCTTATGAAAGAACATCACTCAACTTCCAGGCCGGAGTTCGAAATGTG
TAATTTTTTAATCTAGTTAACATTTGTACCGAGGTTCTATTCTACAGGATGGGATCGCCA
ACTTCATGCCAAACACTCCTCCTTAACCCAGATATATCATGGGCGATAACCATAGAACAG
CTAAAGCAATAACCGAAATAAAAATTAATGTGAATTGTCTAGATAAACTACCTTCCTCCA
AACTACGGTCTTCCAAATGGACAAGGACTATTTGCATACAAAATCTATTTCAAATCTGCT
GAAATATGACGACTAATTTCAGTATTAAATGATTCGTTAACAATAATCGAAATTCATGAA
ATCAAATGATCATTATTAACTAATCATCCTGGAAGATGACCTCATCGTTATGCAATATTC
TAACTATTGATGTTTATAGGCCACCAGTTATCCACTGTTGGGTTGCAGTTCCTGACCTCT
ATTGATGAAAACTATTTTGGATATGATTCGGAATACTTTAAACTAAGTGATCGGTTTATT
TGTTGTTCGAAGTGTATGGTCGTGTTTCCACGAGGCAACATTTTGTTGCTTGTCATAACC
TTTGAATTGTTTGTAAAGTGAGATCGCTAAACAAACACATCAATGATTGAATGAAACGCT
CACCACCACACTAACTTTCTTTGACCTTGTATGACTATGTTTTGTTTTATCCACCAATCA
CAATTTTATGTTCATTCTAAAACTATATTCGCCTTGTTGACTCATTTTTCCTATTCTCTA
GTTACTGTTCGGTATGTCATTTATGTCTCTCCTTTTCCCTATGTAATAGACTGTACTGTT
TATTTGCATACTAACGTTGTTAATTTACATTTTAGAAACAGATAAAGTTTATCAAGCCAA
ATAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)