cluster # 6551

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Schistosoma mansoni
cluster # 6551 cluster # 6551 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6551#0 length = 677 sequences # 4

consensusID : consensus_6551#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 677
fasta sequence

                              [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACGGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATCCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACGCGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACTATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTATTTAAACTGAATTCAACTTCAACATAAGTATCAATATTTGAAT]

[+] EMBL CD090067             [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACGGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD090070             [TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATTATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGAAACAGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGTAGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD066733             [                                                                                                                                                                                                                      GGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGGTGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATCCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACGCGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACTATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTAT                                          ]
[-] EMBL CD148322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGATAAAAAACAGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTACTTTACGACCTTCTTTCAAATTCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGTAAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATATACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGTATTTACACGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACCATTTGATTTAACTACATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTATTTAAACTGAATTCAACTTCAACATAAGTATCAATATTTGAAT]




>consensus_6551#0
TGGTGAAACAGAAGTAGTTGCTTTATTAGAGACAGAAGGGGAATAAGAAACAGGATTATT
ATTTGCATGTTCAATTCTGATAGGTCTAGGTGAATTAGTTTGTTTTGATGAAATTGAAGA
AACGGGACTACTTGTATTTTCACTTCTGATAGATCTAGGTGAATTAGTCTGCTTTGGTGT
AGACAAAGAAGATGATGAAACAGGATTATTTTTCGGGTTTTCGATTTCGGTATGTTTAGG
TGATTCATTAATCTGTTTTGGTGCAGATAACAAAAGCCAAGGTTGTTGTTGATAAAAAAC
AGTTTCTCCACTAAGTGATTCACGTTGTCTTAACTGTACTTGTAGACGACCCCCTACTAC
TTTACGACCTTCTTTCAAATCCCCAACATGAGTTACTGTTGCCGATTGGACAAGTCCAGT
AAGAGGGATTTCAGTTATACCTAGTACACCCCAGCTTCGAAATATACCACGATTGTAATA
TACTGTTGCTTTTAGACAACGATTATTCTGAACAAATCGTCTATATGAATGACTTTTTGT
ATTTACGCGAAATTCTTTAACTGATTGACTATATATTGGTTCACTATTTGATTTAACTAC
ATTTGTAGATAACTTCATTGGTGGATTAGCATTATTTAAACTGAATTCAACTTCAACATA
AGTATCAATATTTGAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case