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Schistosoma mansoni
cluster # 6557 cluster # 6557       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6557#0 length = 899 sequences # 4  

consensusID : consensus_6557#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 899
fasta sequence
                              [GTACTAATTTTCAATGATAAAGTAACCGTGAATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTATCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAACGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCCTGTGGTGATGTAAAAATTATCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCAAATTTACCAGATTCAGAAAAAGACCGAATTAATAAACGATCTAATAATAATAATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCATTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTTTCATTGTTATCAGAAGGGAGTCTGGTAAAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAACTAGGATAATCAGTAAAACTATCAACATCATT]

[+] EMBL CD067146             [GTACTAATTTTCAATGATAAAGTAACCGTGAATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTATCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAACGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCCTGTGGTGATGTAAAAATTATCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI976204             [                              AATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTAGCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAAAGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCAGGTGGTGATGTAAAAATTTTCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCAAATTTACCAGATTCAGAAAAAGACCGAATTAATAAACGATCTAATAATAATAATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCATTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCT                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD067265             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCACTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTGTATCTCTCTCCATCTCTTTCATTGTTATCAGAAGGGAGTCTGGTAAAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAACTAGGATAATCAGTAAAACTATCAACATCATT]
[-] EMBL CD067015             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCTCTTTGATTGTTATAAGAAGGGAGTTTGGTAGAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAATTAGGATAATCAGTATAACTATCAAAATCATc]


>consensus_6557#0 GTACTAATTTTCAATGATAAAGTAACCGTGAATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTA TCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGAT TTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGT GGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAAC GTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCCTGTGGTGATGTAAAAATTATCAAT GAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCAAATTTACCAGATTCAGAAAAAGACCGA ATTAATAAACGATCTAATAATAATAATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAAT GATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATC ATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCA TTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTT ATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTAT GCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTTTCATTGTTATCAGAAGGGAGTC TGGTAAAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTA ATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGAT TTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAACTAGGATAATCAGTAAAACTATCAACATCATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)