These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6557#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 899 fasta sequence [GTACTAATTTTCAATGATAAAGTAACCGTGAATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTATCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAACGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCCTGTGGTGATGTAAAAATTATCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCAAATTTACCAGATTCAGAAAAAGACCGAATTAATAAACGATCTAATAATAATAATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCATTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTTTCATTGTTATCAGAAGGGAGTCTGGTAAAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAACTAGGATAATCAGTAAAACTATCAACATCATT] [+] EMBL CD067146 [GTACTAATTTTCAATGATAAAGTAACCGTGAATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTATCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAACGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCCTGTGGTGATGTAAAAATTATCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCA ] [+] EMBL AI976204 [ AATACAGTTACCGGGAAATGTAATTCATTAGCTAATGTCAAACATAAACCAGGTGGAGGAAATCTACAAATTATCGATCAAAAACTTGATTTTTCATCTAATACACAATCGAAAGTTCGATCATTTCAAAATATCAAACATATTCCTGGTGGAGGTGATAAAAAGATACCTATTGAAAAATTAGATTTCAAAGAGAAAGCTTCACCAAAAGTTGGATCACTTGCTAATGTGAAACATAATCCAGCAGGTGGTGATGTAAAAATTTTCAATGAACATCTTCCTTGGTTAAAATATAATAAACCAAATTTACCAGATTCAGAAAAAGACCGAATTAATAAACGATCTAATAATAATAATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCATTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCT ] [-] EMBL CD067265 [ AATAATCATAGCAGTAATAGTAGTACAAATATGAATGATCTAATGAATACATCCATGATATCAGGCAGTACAACAGGACATTAAATGTATTACATCATTGTTTATGATGTTTAAGCTTGATTCATGGATCAATGATCCCTTTTTTTTATTCATTCACTGTTCTGTTAAGATTATCACCCACTTGACTTGATCCAATATGATAATAATAAGTTGTTTATGGAAAGGTTCATTCTCATATTGTTATGTCATAAGTTACAAAAGTTATGTAGTCATTATGCTCTTACTCTCTCTCTCTGTATCTCTCTCCATCTCTTTCATTGTTATCAGAAGGGAGTCTGGTAAAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAACTAGGATAATCAGTAAAACTATCAACATCATT] [-] EMBL CD067015 [ TCTCTTTGATTGTTATAAGAAGGGAGTTTGGTAGAGATTTTAGTAATTTTTTTTAGAGTTGAGATCATGAGATCATGATCTAATTTTAATTGATTCATGATCTCAACTCTTTCATTATTGACTAACACCTTCTTTGTTCCATCAAGATTTTGTTATTTACAGTAAAGTTCTATAATTAGGATAATCAGTATAACTATCAAAATCATc] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||