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Schistosoma mansoni
cluster # 6576 cluster # 6576       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6576#0 length = 895 sequences # 4  

consensusID : consensus_6576#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 895
fasta sequence
                              [AATACTTACCGTACATTCCAGCAGCACTTACCACGTCCTACACCTATCGAATGGAGACGTCCTGACGAATATTTGCTATGTTAGTTCGCCGGAAAGTGTATTTTCTGAAGGACCTTATTCAATTGTCATTTGGCTCATTCAATTGATTCAAGAGAAATGTAAAGCAACAAATTTTTCTAATCAGCATACTGATAATCAAAATAACATTAGTAGTTCACAAGATATGTATATTCAACGTTTACAATCTTGTTTGATTTATATGGATTTATGGAATAAAGGTTATTATATTAGTACATCCACTATGAAAATGGGTGGTGATTTCCTGGTTTATCAAGGTGATCCACTTTTATATCATGGTAGTCATATTATTACAATTTGTAAACCAACAGATTCATTTTCCAATTCACTATTATTGGCTAAACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGAAATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAAGAATAACACATTATGAAATTAAGAATGATAATGACAATGATGATAGTGCTGTAGATCCTCAAGCCATTGTTGGTGAACACTCAAAATTATCTGTACAATCAAAAGAAATTACGTCCAATGAAGGTACTCGTAATAATTGTAATAATAACATTAATGAAATACAACCTAATGTAATTTACTTATCCCTTCAGTATATGTCTTCACATTCTAGTAATCCAACATTTTCAAAATCATTATGATGTATGAAAA-AAATTGTTTTTACCTTTGTTTTTATTATTCAGTATATTTTCGTAAATGAGAATGATCAAAGAAAAAATACATATTTTCATAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTA]

[+] EMBL CD068141             [AATACTTACCGTACATTCCAGCAGCACTTACCACGTCCTACACCTATCGAATGGAGACGTCCTGACGAATATTTGCTATGTTAGTTCGCCGGAAAGTGTATTTTCTGAAGGACCTTATTCAATTGTCATTTGGCTCATTCAATTGATTCAAGAGAAATGTAAAGCAACAAATTTTTCTAATCAGCATACTGATAATCAAAATAACATTAGTAGTTCACAAGATATGTATATTCAACGTTTACAATCTTGTTTGATTTATATGGATTTATGGAATAAAGGTTATTATATTAGTACATCCACTATGAAAATGGGTGGTGATTTCCTGGTTTATCAAGGTGATCCACTTTTATATCATGGTAGTCATATTATTACAATTTGTAAACCAACAGATTCATTTTCCAATTCACTATTATTGGCTAAACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGAAATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAAGAATAACACATTATGAAATTAAGCATGATAATGACAATGATGATAGTGCTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL AI976066             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGATTTCCTGGTTTATCAAGGTGATCCACTTTTATATCATGGTAGTCATAATATTACAATTTGTAAACCAACAGATTCATTTTCCAATTCACTATTATTGGCTAAACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGAAATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAAGAATAACACATTATGAAATTAAGAATGATAATGACAATGATGATAGTGCTGTAGATCCTCAAGCCATTGTTGGTGAACACTCAAAATTATCTGTACAATCAAAAGAAATTACGTCCAATGAAGGTACTCGTAATAATTGTAATAATAACATTAATGAAATACAACCTAATGTAATTTACTTATCCCTTCAGTATATGTCTTCACATTCTAGTAATCCAACATTTTCAAAATCATTATGATGTATGAAAA AAATTGTTTTTACCTTTGTTTTTATTATTCAGTATATTTTCGTAAATGAGAATGATCAAAGAAAAAATACATA                                                                ]
[-] EMBL AI975251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAT CACTTTTATATCATGGTAGTCATATTATTACAATTTGTAAACCAACAGATTCATTTTCCAATTCACTATTATTGGCTAAACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGAAATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAATAATAACACATTATGAAATTAAGAATGATAATGACAATGATGATAGTGCTGTAGATCCTCAAGCCATTGTTGGTGAACACTCAAAATTATCTGTACAATCAAAAGAAATTACGTCCAATGAAGGTACTCGTAATAATTGTAATAATAACATTAATGAAATACAACCTAATGTAATTTACTTATCCCTTCAGTATATGTCTTCACATTCTAGTAATCCAACATTTTCAAAATCATTATGATGTATAAAAACAGATTGTTTTTACCTTTGTTTTTGTTATTCAGTATATTTTCGTAAATGAGAATGATTAAAGAAAAAATACATATTTTCATAAAAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTA]
[-] EMBL BF936997             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCACTATTATTGGCTAAACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGAAATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAAGAATAACACATTATGAAATTAAGAATGATAATGACAATGATGATAGTGCTGTAGATCCTCAAGCCATTGTTGGTGAACACTCAAAATTATCTGTACAATCAAAAGAAATTACGTCCAATGAAGGTACTCGTAATAATTGTAATAATAACATTAATGAAATACAACCTAATGTAATTTACTTATCCCTTCAGTATATGTCTTCACATTCTAGTAATCCAACATTTTCAAAATCATTATGATGTATGAAAA AAATTGTTTTTACCTTTGTTTTTATTATTCAGTATATTTTCGTAAATGAGAATGATCAAAGAAAAAATACATA                                                                ]


>consensus_6576#0 AATACTTACCGTACATTCCAGCAGCACTTACCACGTCCTACACCTATCGAATGGAGACGT CCTGACGAATATTTGCTATGTTAGTTCGCCGGAAAGTGTATTTTCTGAAGGACCTTATTC AATTGTCATTTGGCTCATTCAATTGATTCAAGAGAAATGTAAAGCAACAAATTTTTCTAA TCAGCATACTGATAATCAAAATAACATTAGTAGTTCACAAGATATGTATATTCAACGTTT ACAATCTTGTTTGATTTATATGGATTTATGGAATAAAGGTTATTATATTAGTACATCCAC TATGAAAATGGGTGGTGATTTCCTGGTTTATCAAGGTGATCCACTTTTATATCATGGTAG TCATATTATTACAATTTGTAAACCAACAGATTCATTTTCCAATTCACTATTATTGGCTAA ACTACGTATTGCAAATGGTTTGAAAAAAATACTTGTTCTAGCTACAGTTAGTAATATTGA AATGTTTACTAGAAAATTTACAATTCAAAGAATAACACATTATGAAATTAAGAATGATAA TGACAATGATGATAGTGCTGTAGATCCTCAAGCCATTGTTGGTGAACACTCAAAATTATC TGTACAATCAAAAGAAATTACGTCCAATGAAGGTACTCGTAATAATTGTAATAATAACAT TAATGAAATACAACCTAATGTAATTTACTTATCCCTTCAGTATATGTCTTCACATTCTAG TAATCCAACATTTTCAAAATCATTATGATGTATGAAAAAAATTGTTTTTACCTTTGTTTT TATTATTCAGTATATTTTCGTAAATGAGAATGATCAAAGAAAAAATACATATTTTCATAA AAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)