Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6591 cluster # 6591       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6591#0 length = 898 sequences # 4  

consensusID : consensus_6591#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 898
fasta sequence
                              [TTGAATTCTCTTCTACTGACGGATTCATTTAATAAAATGTTAACTAATCCAGATCCTATTCTTACCGAATGTTGTCAGCTACCATTGTGCACTTATGGATTAGCATTAAATTGGAGATTATTAGAGATTCTTCCACCGCCGCAAGAACTTTTAAAAGATTTAAGTCTTTTCATTGATTCATTAACGATAAAGCCATCACAGAAGACAACTTTCAATCTTCAAAGTGTTTCAAGGATATTCTTGTCGCCGTCATGTTATCTGTATTTAATAATTTTGTTAGATAGAATTCAACAGAATCCTACTCAACCGAATTATCAGTTTTCTTCAGGCTTTGGAACAGATGATAGTCTACCGCTGAAATCGAATTCCGAATCATCTACTGTAACATCCACAAATACTAGTGCCATTACGACTGGTGGTAGTAATGCTAATTTACCTCCAGTAACCAGTAGTCGATCATCGACGTCATCATCAGCTTACTCTTTATTAGATTCAAAAGCGAATCTGTTGAAAGAATTGAAGCGTTTAATTCATGCTCAGTGTTCAAGTAAACTATCAAATAAAGGTGAGTCAGAGGAAGCAAAGACTGGTGCAATTGAAGGAGACATCAATAAATTAATATCCCTAGTACATCCTATAGCCTTATTTTCATTCTTATTCGAATGTGGTTTTCTTCAAGTGAAGTCATATTCATTGGTATTAGATTCAGTCAAGAAGAGTTTCAATGGAATTACTGTTGGGCAGTTGTCTTATTTAAGTAGCTTATTTCAATTTCTAAATACCTTAACATCACAATTGTCGGTATTAAATGATTCTAAAAGCACGAAACCAATTAATACTTCCAAATCATACACTGACACTGTAGAACCTGTAAAACGTGCTGGGAAGCATAGAACAC]

[+] EMBL CD160755             [TTGAATTCTCTTCTACTGACGGATTCATTTAATAAAATGTTAACTAATCCAGATCCTATTCTTACCGAATGTTGTCAGCTACCATTGTGCACTTATGGATTAGCATTAAATTGGAGATTATTAGAGATTCTTCCACCGCCGCAAGAACTTTTAAAAGATTTAAGTCTTTTCATTGATTCATTAACGATAAAGCCATCACAGAAGACAACTTTCAATCTTCAAAGTGTTTCAAGGATATTCTTGTCGCCGTCATGTTATCTGTATTTAATAATTTTGTTAGATAGAATTCAACAGAATCCTACTCAACCGAATTATCAGTTTTCTTCAGGCTTTGGAACAGATGATAGTCTACCGCTGAAATCGAATTCCGAATCATCTACTGTAACATCCACAAATACTAGTGCCATTACGACTGGTGGTAGTAATGCTAATTTACCTCCAGTAACCAGTAGTCGATCATCGACGTCATCATCAGCTTACTCTTTATTAGATTCAAAAGCGAATCTGTTGAAAGAATTGAAGCGTTTAATTCATGCTCAGTGTTCAAGTAAACTATCAAATAAAGGTGAGTCAGAGGAAGCAAAGACTGGTGNCATTGAAGGAGACATCAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD068967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATACTAGTGCCATTACGACTGTTGTTATTAATGCTAATTTACCTCCAGTAACCAGTAGTCGATCATCGACGTCATCATCAGCTTACTCTTTATTAGATTCAAAAGCGAATCTGTTGAAAGAATTGAAGCGTTTAATTCATGCTCAGTGTTCAAGTAAACTATCAAATAAAGGTGAGTCAGAGGAAGCAAAGACTGGTGCAATTGAAGGAGACATCAATAAATTAATATCCCTAGTACATCCTATAGCCTTATTTTCATTCTTATTCGAATGTGGTTTTCTTCAAGTGAAGTCATATTCATTGGTATTAGATTCAGTCAAGAAGAGTTTCAATGGAATTACTGTTGGGCAGTTGTCTTATTTAAGTAGCTTATTTCAATTTCTAAATACCTTAACATCACAATTGTCGGTATTAAATGATTCTAAAAGCACGAAACCAATTAATACTTCCAAATCATACACTGACACTGTAGAACCTGTAAAACGccgct               ]
[-] EMBL CD180998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCGACGTCATCATCAGCTTACTCTTTATTAGATTCAAAAGCGAATCTGTTGAAAGAATTGAAGCGTTTAATTCATGCTCAGTGTTCAAGTAAACTATCAAATAAAGGTGAGTCAGAGGAAGCAAAGACTGGTGCAATTGAAGGAGACATCAATAAATTAATATCCCTAGTACATCCTATAGCCTTATTTTCATTCTTATTCGAATGTGGTTTTCTTCAAGTGAAGTCATATTCATTGGTATTAGATTCAGTCAAGAAGAGTTTCAATGGAATTACTGTTGGGCAGTTGTCTTATTTAAGTAGCTTATTTCAATTTCTAAATACCTTAACATCACAATTGTCGGTATTAAATGATTCTAAAAGCACGAAACCAATTAATACTTCCAAATCATACACTGACACTGTAGAACCTGTAAAACGTGCTGGGAAGCATAGAACAC]
[-] EMBL CD199065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATCAATAAATTAATATCCCTAGTACATCCTATAGCCTTATTNTCATTCTTATTCGAATGTGGTTTTCTTCAAGTGAAGTCATATTCATTGGTATTAGATTCAGTCAAGAAGAGTTTCAATGGAATTACTGTTGGGCAGTTGTCTTATTTAAGTAGCTTATTTCAATTTCTAAATACCTTAACATCACAATTGTCGGTATTAAATGATTCTAAAAGCACGAAACCGATTAATACTTCCAAATCATACACTGACACTGTAGAACCTGTAAAACGTGCTGGGAAGCATAGAACA ]


>consensus_6591#0 TTGAATTCTCTTCTACTGACGGATTCATTTAATAAAATGTTAACTAATCCAGATCCTATT CTTACCGAATGTTGTCAGCTACCATTGTGCACTTATGGATTAGCATTAAATTGGAGATTA TTAGAGATTCTTCCACCGCCGCAAGAACTTTTAAAAGATTTAAGTCTTTTCATTGATTCA TTAACGATAAAGCCATCACAGAAGACAACTTTCAATCTTCAAAGTGTTTCAAGGATATTC TTGTCGCCGTCATGTTATCTGTATTTAATAATTTTGTTAGATAGAATTCAACAGAATCCT ACTCAACCGAATTATCAGTTTTCTTCAGGCTTTGGAACAGATGATAGTCTACCGCTGAAA TCGAATTCCGAATCATCTACTGTAACATCCACAAATACTAGTGCCATTACGACTGGTGGT AGTAATGCTAATTTACCTCCAGTAACCAGTAGTCGATCATCGACGTCATCATCAGCTTAC TCTTTATTAGATTCAAAAGCGAATCTGTTGAAAGAATTGAAGCGTTTAATTCATGCTCAG TGTTCAAGTAAACTATCAAATAAAGGTGAGTCAGAGGAAGCAAAGACTGGTGCAATTGAA GGAGACATCAATAAATTAATATCCCTAGTACATCCTATAGCCTTATTTTCATTCTTATTC GAATGTGGTTTTCTTCAAGTGAAGTCATATTCATTGGTATTAGATTCAGTCAAGAAGAGT TTCAATGGAATTACTGTTGGGCAGTTGTCTTATTTAAGTAGCTTATTTCAATTTCTAAAT ACCTTAACATCACAATTGTCGGTATTAAATGATTCTAAAAGCACGAAACCAATTAATACT TCCAAATCATACACTGACACTGTAGAACCTGTAAAACGTGCTGGGAAGCATAGAACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)