cluster # 6595

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6595 cluster # 6595 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6595#0 length = 697 sequences # 4

consensusID : consensus_6595#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 697
fasta sequence

                              [AAGTCCATTGTGGCAATTTGTAGAAAATGGCAAACAACGTTTAATTCAGCGTGTTGAAGAACTCCAATTCTCAATTGATCGCATTCGTGAAACTGATGTTAATGAATTAGCTTACCTGTTTCACTATCAAGGCAAAGACGGTGCTCGCGAAATTCGACGTTTAGCTTTCTATGTACCA-AAAATGCAATTGGCTGTGGAATCACAACCTATTACACGTACCATTCTGCGTATTAAGCTTACAATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATTGGGTATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAAACGCATGTTCAATTCAAAAACTCCACAAATTTTAAATTTCACCATTCCATTGTATGAACCTTATCCAACTCAATATTTTGTTCGTATTCTCAGTGACTGCTGGCTTGGAACTGATTCAACCTGTCCAATTCAATTGANAAGTCTCATTCTACCAAGTAGTGATCCACCTCATACAGATTTACTTAAATTACAACCATTACCAGTGACAGCATTGAAAAATGTCAATTATGAGTTATTATATGAATTTCCATATTTTAATCCTATACAAACTCAATTATTTCATACATTATATCATCAAAATGTCAATGTACTGTTAGGTGCACCTACTGGTTCCGGC]

[+] EMBL CD132854             [AAGTCCATTGTGGCAATTTGTAGAAAATGGCAAACAACGTTTAATTCAGCGTGTTGAAGAACTCCAATTCTCAATTGATCGCATTCGTGAAACTGATGTTAATGAATTAGCTTACCTGTTTCACTATCAAGGCAAAGACGGTGCTCGCGAAATTCGACGTTTAGCTTTCTATGTACCA AAAATGCAATTGGCTGTGGAATCACAACCTATTACACGTACCATTCTGCGTATTAAGCTTACAATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATTGGGTATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAAACGCATGTTCAATTCAAAAACTCCACAAATTTTAAATTTCACCATTCCATTGTATGAACCTTATCCAACTCAATATTTTGTTCGTATTCTCAGTGACTGCTGGCTTGGAACTGATTCAACCTGTCCAATTCAATTGANAAGTCTCATTCTACCAAGTAGTGATCCACCTCATACAGATTTACTTAAATT                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD133475             [ AGTCCATTGTGGCAATTTGTAGAAAATGGCAAACAACGTTTAATTCAGCGTGTTGAAGAACTCCAATTCTCAATTGATCGCATTCGTGAAACTGATGTTAATGAATTAGCTTACCTGTTTCACTATCAAGGCAAAGACGGTGCTCGCGAAATTCGACGTTTAGCTTTCTATGTACCA AAAATGCAATTGGCTGTGGAATCACAACCTATTACACGTACCATTCTGCGTATTAAGCTTACAATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATTGGGTATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAAACGCATGTTCAATTCAAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD069305             [                                                                                                                                                                          ATGTACCACATTATGCAATTGGCTGTGGAATCACAACCTATTACACGTACCATTCTGCGTATTAAGCTTACAATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATTGGGTATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAAACGCATGTTCAATTCAAAAACTCCACAAATTTTAAATTTCACCATTCCATTGTATGAACCTTATCCAACTCAATATTTTGTTCGTATTCTCAGTGACTGCTGGCTTGGAACTGATTCAACCTGTCCAATTCAATTGAAAAGTCTCATTCTACCAAGTAGTGATCCAGCTCATACAGATTTACTTAAATTACAACCATTACCAGTGACAGCATTGAAAAATGTCAATTATGAGTTATTATATGAATTTCCATATTTTAATCCTATACAAACTCAATTATTTCATACATTATATCATCAAAATGTCAATGTACTGTTAGGTGCACCTACTGGTTCCGGC]
[+] EMBL CD069115             [                                                                                                                                                                                                                          ACCATTCTGCGTATTCAGCTTACAATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATAGGGTATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAAACGCATGTTCAATTCAAAAACTCCACAAATTTTACATTTCACCATTCCATTGTATGACCCTTATCCAACTCAATATTTAGTTCGTATTCTCAGTGACTGCTGGCTTGGAACTGATTCAAACTGTCCAATTCAATTGACCAGTCTCATTCTACCAAGTAGTGATCCACCTCATACAGATT                                                                                                                                                              ]




>consensus_6595#0
AAGTCCATTGTGGCAATTTGTAGAAAATGGCAAACAACGTTTAATTCAGCGTGTTGAAGA
ACTCCAATTCTCAATTGATCGCATTCGTGAAACTGATGTTAATGAATTAGCTTACCTGTT
TCACTATCAAGGCAAAGACGGTGCTCGCGAAATTCGACGTTTAGCTTTCTATGTACCAAA
AATGCAATTGGCTGTGGAATCACAACCTATTACACGTACCATTCTGCGTATTAAGCTTAC
AATTGAACCAGATTTTGTTTGGTCAAATCAAATTCATGGATTACAACAATCTTATTGGGT
ATGGATTGAAGATCCTGATCAAGGTGTTATATTTCATTCGGAATATTGGACATTGACTAA
ACGCATGTTCAATTCAAAAACTCCACAAATTTTAAATTTCACCATTCCATTGTATGAACC
TTATCCAACTCAATATTTTGTTCGTATTCTCAGTGACTGCTGGCTTGGAACTGATTCAAC
CTGTCCAATTCAATTGANAAGTCTCATTCTACCAAGTAGTGATCCACCTCATACAGATTT
ACTTAAATTACAACCATTACCAGTGACAGCATTGAAAAATGTCAATTATGAGTTATTATA
TGAATTTCCATATTTTAATCCTATACAAACTCAATTATTTCATACATTATATCATCAAAA
TGTCAATGTACTGTTAGGTGCACCTACTGGTTCCGGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case