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Schistosoma mansoni
cluster # 6624 cluster # 6624       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6624#0 length = 1671 sequences # 4  

consensusID : consensus_6624#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1671
fasta sequence
                              [AGGCGAATCTGTTTTATACTCCAAATGGATGAATTCGAGGAATACAGAAATCCACTTACTAAGCGATATGCAAGCCGTGAAATGGTGTGCAATTTCGGTGAAAAACGAAAAGTAATCCTCTGGCGCCAACTGTGGATATGGCTAGCAGAAACACAAAAAGAGCTTGGA-TTCGATATCACAGACGAACAGATTAATGAAATGAAAAGTCAAAGAGATTCAGTGGATTTCGGGACTGCCGCAGCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCTTGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAATGCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGTATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACCCATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACAAGATTTGTTATTAGATTTAGAAAATCTAGAAAGGTTGAAGAACCACACAATCCGTTTTCGTGGTGCTAAGGGTGCAGTGGGAACTCAAGCATCTTTTATGGATTTATTCCAAGGTGATCATCAAAAGGTTATCAAGTTGGACGAAATCTTAACCAAAAAGTCTGGATTCCAACGTTCTTGGTGTGTAACTGGTCAAACTTATCCAAGAAAAGTGGACATTGAAATCACTAACGCATTGTCGAATATAGGTGCAACTGTCCATAAAATATGCACCGACATACGACTACTGAGTACTTTTCACGAAGTTGAGGAACCTTTTGAAACCAAACAGATCGGTTCAAGTGCAATGCCATATAAACGTAATCCTATTCGATCAGAAAGAGCATGTTCTTTAGCACGTTATCTAATGCATATATCGACTTCCATGGTTTCTACAGTATCTGTTCAGTGGCTCGAACGTTCACTAGATGACTCAGCTATTCGTATAATTGTCCTCCCAGAAGCTTTTCTTGCAGCCGATGCATGTCTTACTTTACTACAAAATATAGCTGAAGGATTAATAGTATACCCGATGGTAATGGAAGCTAATTTAAATTCTGAACTTCCTTTCCTCGTTGTTGAACGTATTTTAGTCAAAATGGTGTCTGAAGGCGCAGCCAACCGTCAAGAATGCCATGAACGCCTTCGTAAGCATAGTCATGAAGCTGCTGCAGAAATTAAACTAAAGGGTTTAAAAAATAGTCTCATGGATAAGTTGCTCAACGATTATTATTTTGCCCCGATACATTCGTTACTTCCAACCGTATTAGATCCATCTTATATGATCGGTCGTGCTGTTGAACAGGTGGAAGTATTCCTAAACACTGAAGTTGATCCAGCAATTCACTCATACAAAGATTGTTTAGCATTGAACAGCAATATAACAATTTGACATGACAACTTTATAGATCATCAAATCGTAGTTAACTTTTACTTCAGTCGATTTCTCTTGATATGTTTGAATAGTTAACTTTTGTTATGGGGTTGTACTGCAATTTTTCAGTTCTTTTAATTTTAATATTGCTCTGATTTTCCCTTTTTTCTATAATATCCTTTAATTTGATCTAATGTTTATGTGATATCTATAAAATTAATT]

[+] EMBL CD083570             [AGGCGAATCTGTTTTATACTCCAAATGGATGAATTCGAGGAATACAGAAATCCACTTACTAAGCGATATGCAAGCCGTGAAATGGTGTGCAATTTCGGTGAAAAACGAAAAGTAATCCTCTGGCGCCAACTGTGGATATGGCTAGCAGAAACACAAAAAGAGCTTGGA TTCGATATCACAGACGAACAGATTAATGAAATGAAAAGTCAAAGAGATTCAGTGGATTTCGGGACTGCCGCAGCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCTTGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAATGCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGTATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACCCATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACCAGATTTGTTATTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AF448822             [            TTTATACTCCAAATGGATGAATTCGAGGAATACAGAAATCCACTTACTAAGCGATATGCAAGCCGTGAAATGGTGTGCAATTTCGGTGAAAAACGAAAAGTAATCCTCTGGCGCCAACTGTGGATATGGCTAGCAGAAACACAAAAAGAGCTTGGA TTCGATATCACAGACGAACAGATTAATGAAATGAAAAGTCAAAGAGATTCAGTGGATTTCGGGACTGCCGCAGCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCTTGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAATGCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGTATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACCCATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACAAGATTTGTTATTAGATTTAGAAAATCTAGAAAGGTTGAAGAACCACACAATCCGTTTTCGTGGTGCTAAGGGTGCAGTGGGAACTCAAGCATCTTTTATGGATTTATTCCAAGGTGATCATCAAAAGGTTATCAAGTTGGACGAAATCTTAACCAAAAAGTCTGGATTCCAACGTTCTTGGTGTGTAACTGGTCAAACTTATCCAAGAAAAGTGGACATTGAAATCACTAACGCATTGTCGAATATAGGTGCAACTGTCCATAAAATATGCACCGACATACGACTACTGAGTACTTTTCACGAAGTTGAGGAACCTTTTGAAACCAAACAGATCGGTTCAAGTGCAATGCCATATAAACGTAATCCTATTCGATCAGAAAGAGCATGTTCTTTAGCACGTTATCTAATGCATATATCGACTTCCATGGTTTCTACAGTATCTGTTCAGTGGCTCGAACGTTCACTAGATGACTCAGCTATTCGTATAATTGTCCTCCCAGAAGCTTTTCTTGCAGCCGATGCATGTCTTACTTTACTACAAAATATAGCTGAAGGATTAATAGTATACCCGATGGTAATGGAAGCTAATTTAAATTCTGAACTTCCTTTCCTCGTTGTTGAACGTATTTTAGTCAAAATGGTGTCTGAAGGCGCAGCCAACCGTCAAGAATGCCATGAACGCCTTCGTAAGCATAGTCATGAAGCTGCTGCAGAAATTAAACTAAAGGGTTTAAAAAATAGTCTCATGGATAAGTTGCTCAACGATTATTATTTTGCCCCGATACATTCGTTACTTCCAACCGTATTAGATCCATCTTATATGATCGGTCGTGCTGTTGAACAGGTGGAAGTATTCCTAAACACTGAAGTTGATCCAGCAATTCACTCATACAAAGATTGTTTAGCATTGAACAGCAATATAACAATTTGACATGACAACTTTATAGATCATCAAATCGTAGTTAACTTTTACTTCAGTCGATTTCTCTTGATATGTTTGAATAGTTAACTTTTGTTATGGGGTTGTACTGCAATTTTTCAGTTCTTTTAATTTTAATATTGCTCTGATTTTCCCTTTTTTCTATAATATCCTTTAATTTGATCTAATGTTTATGTGATATCTATAAAATTAATT]
[-] EMBL CD072624             [                                                                                                                                                GCAGAACCACAAAAGGAGC TGGATTTCGATATCACAGCCGACCAGATTAATGAAATGAAAAGTCANAGAGATTCAGTGGATTTCGGGACTGCCGCAGCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCTTGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAATGCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGTATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACCCATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACAAGATTTGTTATTAGATTTAGAAAATCTAGAAAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD201473             [                                                                                                                                                                                                                          CAGTGGATTTCGGGACTGCCGCAGCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCTTGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAATGCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGTATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACCCATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACAAGATTTGTTATTAGATTTAGAAAATCTAGAAAGGTTGAAGAACCACACAATCCGTTTTCGTGGTGCTAAGGGTGCAGTGGGAACTCAAGCATCTTTTATGGATTTATTCCAAGGTGATCATCAAAAGGTTATCAAGTTGGACGAAATCTTAACCAAAAAGTCTGGATTCCAACGTTCTTGGTGTGTAACTGGTCAAACTTATCCCAGAAAAGTGGACATTGAAATCACTAACGCATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_6624#0 AGGCGAATCTGTTTTATACTCCAAATGGATGAATTCGAGGAATACAGAAATCCACTTACT AAGCGATATGCAAGCCGTGAAATGGTGTGCAATTTCGGTGAAAAACGAAAAGTAATCCTC TGGCGCCAACTGTGGATATGGCTAGCAGAAACACAAAAAGAGCTTGGATTCGATATCACA GACGAACAGATTAATGAAATGAAAAGTCAAAGAGATTCAGTGGATTTCGGGACTGCCGCA GCTGAAGAAAAGGCTCGACGACATGACGTTATGGCGCATGTATATACTTTTGCTTTAGCT TGTCCAAAAGCTGCACCAATCATTCACCTCGGTGCAACATCTTGTTTTGTTGGTGATAAT GCCGATTTAATTATGCTTAAGGATGGTTTAAATATACTTTTACCGAAGGTTGCTAGGTGT ATTGACCGGTTAGCTAAAAAAGCTATGTTGCACAAAAGTTTAATATGTCTCGCTCGCACC CATTTGCAACCCGCTCAACCTACTACAATGGGCCGTAGAATATGTATGTGGATACAAGAT TTGTTATTAGATTTAGAAAATCTAGAAAGGTTGAAGAACCACACAATCCGTTTTCGTGGT GCTAAGGGTGCAGTGGGAACTCAAGCATCTTTTATGGATTTATTCCAAGGTGATCATCAA AAGGTTATCAAGTTGGACGAAATCTTAACCAAAAAGTCTGGATTCCAACGTTCTTGGTGT GTAACTGGTCAAACTTATCCAAGAAAAGTGGACATTGAAATCACTAACGCATTGTCGAAT ATAGGTGCAACTGTCCATAAAATATGCACCGACATACGACTACTGAGTACTTTTCACGAA GTTGAGGAACCTTTTGAAACCAAACAGATCGGTTCAAGTGCAATGCCATATAAACGTAAT CCTATTCGATCAGAAAGAGCATGTTCTTTAGCACGTTATCTAATGCATATATCGACTTCC ATGGTTTCTACAGTATCTGTTCAGTGGCTCGAACGTTCACTAGATGACTCAGCTATTCGT ATAATTGTCCTCCCAGAAGCTTTTCTTGCAGCCGATGCATGTCTTACTTTACTACAAAAT ATAGCTGAAGGATTAATAGTATACCCGATGGTAATGGAAGCTAATTTAAATTCTGAACTT CCTTTCCTCGTTGTTGAACGTATTTTAGTCAAAATGGTGTCTGAAGGCGCAGCCAACCGT CAAGAATGCCATGAACGCCTTCGTAAGCATAGTCATGAAGCTGCTGCAGAAATTAAACTA AAGGGTTTAAAAAATAGTCTCATGGATAAGTTGCTCAACGATTATTATTTTGCCCCGATA CATTCGTTACTTCCAACCGTATTAGATCCATCTTATATGATCGGTCGTGCTGTTGAACAG GTGGAAGTATTCCTAAACACTGAAGTTGATCCAGCAATTCACTCATACAAAGATTGTTTA GCATTGAACAGCAATATAACAATTTGACATGACAACTTTATAGATCATCAAATCGTAGTT AACTTTTACTTCAGTCGATTTCTCTTGATATGTTTGAATAGTTAACTTTTGTTATGGGGT TGTACTGCAATTTTTCAGTTCTTTTAATTTTAATATTGCTCTGATTTTCCCTTTTTTCTA TAATATCCTTTAATTTGATCTAATGTTTATGTGATATCTATAAAATTAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)