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Schistosoma mansoni
cluster # 6634 cluster # 6634       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6634#0 length = 806 sequences # 4  

consensusID : consensus_6634#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 806
fasta sequence
                              [GAGGGTCTCAAGGGAACAATTCTCTGTTGCTAACACATGTTATGTCCCAGACAGATACGGGGAGTCGTGGTCGTACAATGGATTTAAATTACGCTCAGTTAGATTTAAACAAGTCAGATTCTGATGATGAATTGGAGGTTAGTTTAGCCTATAATGAAAAAGACGGAATACGAGACCAGCAAGATGATATCAGGGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGAT]

[-] EMBL BG930740             [GAGGGTCTCAAGGGAACAATTCTCTGTTGCTAACACATGTTATGTCCCAGACAGATACGGGGAGTCGTGGTCGTACAATGGATTTAAATTACGCTCAGTTAGATTTAAACAAGTCAGATTCTGATGATGAATTGGAGGTTAGTTTAGCCTATAATGAAAAAGACGGAATACGAGACCAGCAAGATGATATCAGGGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGACCCCCc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD078595             [                                                                                                                                                                                                 GGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTGAATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGA ]
[-] EMBL CD073058             [                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGATAATTTGTCTAACAAGAATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGAATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGCTTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAATATATTCGAT]
[-] EMBL CD073325             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acCCGTTTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCCCTTTATGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTTTGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTAAACTTTATTATTTTCGATTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGATCCCCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACACCAATGTCTCCCTAATCTTTTTGTATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTACCAACGAATAAATGTATGATATTTTACTGATAGTTTGAAAAATATTCGAT]


>consensus_6634#0 GAGGGTCTCAAGGGAACAATTCTCTGTTGCTAACACATGTTATGTCCCAGACAGATACGG GGAGTCGTGGTCGTACAATGGATTTAAATTACGCTCAGTTAGATTTAAACAAGTCAGATT CTGATGATGAATTGGAGGTTAGTTTAGCCTATAATGAAAAAGACGGAATACGAGACCAGC AAGATGATATCAGGGCATCTGCACAACAGAACATAAGTACAAACCTAGATCTCATTTGTG AATCGTTATCGAATGCTAAGAACCATATGAACTGTTTTTCAGATAATTTGTCTAACAAGA ATACGATCCCCTCCAGTATGTTACACTGTGATCTCACCGAATGCCAAACAAGATCTGTGA ATGAAAATATGAGAGAATTAATTGGTTTGCACCCTGAAATGACTGAAGCAACAGCCACGC TTTTACTCACTTTAACGGAGAACCGTCTACATATTTCACATGAAATATGGAAGCACTTTA TGCCTCGTGTTTAGAGAGACTTGTAAGCACTTATTTTCAATAATATGGCTAATGTTATTT TGCTCAGAAATAATGTATTAGGCTTAATGTTAAAATTATTTTATACTTTATTATTTTCGA TTTTACTTATATTGGTTAATGATTATTGTCCTGCAGAGTTCGACTAGATTTTAGGTAGGA TCACCCAATTTTTGTGCTTTCAAGTTGGTACTGACAACAATGTCTACCTAATCTTTTTGT ATATCGTATAAAATTTTCTACTAAAATTTCATTTTAACAACGAATAAATGTATGATATTT TACTGATAGTTTGAAATATATTCGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)