These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6654#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1295 fasta sequence [GCAAATCATGTCATTTCGAATACTCGTCTGTTAGTAACAACATTATCACATGGTCCAAACGGTACACGACTTTGTGCTACCTATCAGCACCAGAATACCTATACATTTCAAGATGAAATTGGTGCGGTTGTTGTCAATGCATGCCGTTTAGTACCTGGTGGTGTATTGTGTTTTCTACCATCCTATAGTCTATTGGATAAGCTTATACAAAGATGGGAGTTAACTGGATTACTGAACCATTTAAATATGATAAAACATGTTATGATTGAACCGAGATCATCTGTTGGTTTAGATGATTGGCTTGAAGAGTTTTATACTTCAGTAAATCAAAATGTTCCAAATGCCAAATTGAAATCAAGACGAAAATCAATTGGTCAGGCTAATAATAATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGTAAAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACANAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCANAATGGCCTGTGCAGATAAGCATATACGATCACCATTACAAAGTCTTAATTCATCTATGGAAAAGTATAATGATACAAATGATGACATTACTTCTTCTTCTACCTCTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAAGTCGAAAAACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTCTATTCAACTTCTCAATATTCATCTTCATGATTGATATATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTAGAATTATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA] [+] EMBL CD079043 [GCAAATCATGTCATTTCGAATACTCGTCTGTTAGTAACAACATTATCACATGGTCCAAACGGTACACGACTTTGTGCTACCTATCAGCACCAGAATACCTATACATTTCAAGATGAAATTGGTGCGGTTGTTGTCAATGCATGCCGTTTAGTACCTGGTGGTGTATTGTGTTTTCTACCATCCTATAGTCTATTGGATAAGCTTATACAAAGATGGGAGTTAACTGGATTACTGAACCATTTAAATATGATAAAACATGTTATGATTGAACCGAGATCATCTGTTGGTTTAGATGATTGGCTTGAAGAGTTTTATACTTCAGTAAATCAAAATGTTCCAAATGCCAAATTGAAATCAAGACGAAAATCAATTGGTCAGGCTAATAATAATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGTAAAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACANAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCANAA ] [+] EMBL CD079061 [ AATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGT AAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACAAAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCAAAATGGCCTGTGCAGATAAGCATATACGATCACCATTACAAAGTCTTAATTCATCTATGGAAAAGTATAATGATACAAATGATGACATTACTTCTTCTTCTACCTCTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAA ] [-] EMBL CD073515 [ ACCTNTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAAGTCGAAAAACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTCTATTCAACTTCTCAATATTCATCTTCATGATTGATATATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTAGAATTATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA] [-] EMBL CD073496 [ ACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTNTATTCAACTTCTCCATATTCATTTTCATGATTGATAAATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTATAAATATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||