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Schistosoma mansoni
cluster # 6654 cluster # 6654       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6654#0 length = 1295 sequences # 4  
consensusID : consensus_6654#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1295
fasta sequence 
                              [GCAAATCATGTCATTTCGAATACTCGTCTGTTAGTAACAACATTATCACATGGTCCAAACGGTACACGACTTTGTGCTACCTATCAGCACCAGAATACCTATACATTTCAAGATGAAATTGGTGCGGTTGTTGTCAATGCATGCCGTTTAGTACCTGGTGGTGTATTGTGTTTTCTACCATCCTATAGTCTATTGGATAAGCTTATACAAAGATGGGAGTTAACTGGATTACTGAACCATTTAAATATGATAAAACATGTTATGATTGAACCGAGATCATCTGTTGGTTTAGATGATTGGCTTGAAGAGTTTTATACTTCAGTAAATCAAAATGTTCCAAATGCCAAATTGAAATCAAGACGAAAATCAATTGGTCAGGCTAATAATAATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGTAAAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACANAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCANAATGGCCTGTGCAGATAAGCATATACGATCACCATTACAAAGTCTTAATTCATCTATGGAAAAGTATAATGATACAAATGATGACATTACTTCTTCTTCTACCTCTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAAGTCGAAAAACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTCTATTCAACTTCTCAATATTCATCTTCATGATTGATATATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTAGAATTATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA]

[+] EMBL CD079043             [GCAAATCATGTCATTTCGAATACTCGTCTGTTAGTAACAACATTATCACATGGTCCAAACGGTACACGACTTTGTGCTACCTATCAGCACCAGAATACCTATACATTTCAAGATGAAATTGGTGCGGTTGTTGTCAATGCATGCCGTTTAGTACCTGGTGGTGTATTGTGTTTTCTACCATCCTATAGTCTATTGGATAAGCTTATACAAAGATGGGAGTTAACTGGATTACTGAACCATTTAAATATGATAAAACATGTTATGATTGAACCGAGATCATCTGTTGGTTTAGATGATTGGCTTGAAGAGTTTTATACTTCAGTAAATCAAAATGTTCCAAATGCCAAATTGAAATCAAGACGAAAATCAATTGGTCAGGCTAATAATAATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGTAAAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACANAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCANAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD079061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGAAATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGT AAGTTAGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCTTATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACAAAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTATAAATCCTCCTCACCCAAAATGGCCTGTGCAGATAAGCATATACGATCACCATTACAAAGTCTTAATTCATCTATGGAAAAGTATAATGATACAAATGATGACATTACTTCTTCTTCTACCTCTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD073515             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCTNTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCTCAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGGGGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGTATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGTCAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAAGTCGAAAAACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTCTATTCAACTTCTCAATATTCATCTTCATGATTGATATATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTAGAATTATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA]
[-] EMBL CD073496             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACAAGTGGAAGATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACACAGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTNTATTCAACTTCTCCATATTCATTTTCATGATTGATAAATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTTACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTATAAATATCATAATGTACGCACCAGTATCATAGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA]




>consensus_6654#0
GCAAATCATGTCATTTCGAATACTCGTCTGTTAGTAACAACATTATCACATGGTCCAAAC
GGTACACGACTTTGTGCTACCTATCAGCACCAGAATACCTATACATTTCAAGATGAAATT
GGTGCGGTTGTTGTCAATGCATGCCGTTTAGTACCTGGTGGTGTATTGTGTTTTCTACCA
TCCTATAGTCTATTGGATAAGCTTATACAAAGATGGGAGTTAACTGGATTACTGAACCAT
TTAAATATGATAAAACATGTTATGATTGAACCGAGATCATCTGTTGGTTTAGATGATTGG
CTTGAAGAGTTTTATACTTCAGTAAATCAAAATGTTCCAAATGCCAAATTGAAATCAAGA
CGAAAATCAATTGGTCAGGCTAATAATAATGAATCGCCATCGTCTACTACACTGAATGGA
AATTCTCTTGTGTTAAACCAAACAGGGTCAATTATATTTGCAGTTTGTCGTGGTAAAGTT
AGTGAAGGCTTGGATTTTGCTGATTCCTATGCGCGTTTAGTAATTGCCATTGGAATTCCT
TATCCAGCATTCACAAATCCTCAGGTTCAACANAAACGTGAATTTAACGATGCGCTTTAT
AAATCCTCCTCACCCANAATGGCCTGTGCAGATAAGCATATACGATCACCATTACAAAGT
CTTAATTCATCTATGGAAAAGTATAATGATACAAATGATGACATTACTTCTTCTTCTACC
TCTAATGTTTCTTCTCCAAGACCTAGAAAAGTACTCAGTGGGTCGGAATGGTATGATGCT
CAAGCCTATAGAGCATTAAATCAAGCATTAGGACGTTGTATTCGACATGCAAATGATTGG
GGTTCTATAATATTGGCTGATGCACGTTTTGTGGAACAATCATCTCGTTATATGTGTGGT
ATAAGTCGTTGGATCCGGTCCAGAGTGAATCATCATTGTTCATGGGATAGTCTAGAATGT
CAACTTCAATCATTTGTTGCATCACATGAAACTGAAGAGAAAGTCGAAAAACAAGTGGAA
GATTTAGCTGAAATTTTTGCCTAACCCGTTGACTTGAATACATATCCATACTGCTTACAC
AGATGTTATAACAAATTCATTATTTATATTCTACTTAAATTTATGCATTTTCAATTCTAT
TCAACTTCTCAATATTCATCTTCATGATTGATATATCGAAAAACCGTTATTTATTCTTTT
ACAAAAATGAAGTTTTGTATGTACAAATTAGAATTATCATAATGTACGCACCAGTATCAT
AGATATATAATTTTTTTTTTAAAATAAAAGTTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)