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Schistosoma mansoni
cluster # 6661 cluster # 6661       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6661#0 length = 804 sequences # 4  
consensusID : consensus_6661#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 804
fasta sequence 
                              [AGTTTGTTGATACCATGCAGATAAATTACCAGTTAATGATGTTGATGCTGGATTTGTTGTTGCCATAGGATTTGATGATTGTAATAAACGTTGTTGTTGTTGTTGTGCTAAGCGTGCAACAGCTAATGCTGTCGCTACACCAGGATTTTCTCCTGTAGTACTTGTGGCTATTACACTACTATTGTTATTATCACTACTATCACTACTTCTAACATTACCCGGATTAGTTGTACCACTGCTAGCTGATGTAAAAATACTAACCGAAGTTGGGGCACCTGGTGCACTCCCACTTGAACATAAATAGGCAGCTAATGCTGATGCAGTAGTAGTACTGATACTACTACTGCTAGTAGTAGTTGTTGCTGTCGCGATAGTTGTACTGGTTGTAATCTCTTCACCA-GGTGTATGAGCATAAGATGAAGCAGACAGAGTGGAAATGGTTACAGTCGATATAGATGTGGTACTAGTTTCATGTGGNGTAGTGACTGTACTTAGTGGTATGTCAGCAGTATCTGCTGTAGTATTTGTATTATTAGACGACGTATTTGAACAAACCAAACCAAATCTAAATAGTCGAATTCTATGTAGGCTGTCTGCAACTAACAATTGGTCAATTTGATTTTCTGAACGATTATTCACTGCATCGTTTGTGGAACCATTTTGAAGTAACCCATTTGCTGGCGAATCTGGTGCACCTGGAGTAGATCTATCTGGTGGAGGGTTGACTTGGACAGATTCTGTGCCATTAGGCAAAAGCATACTTGGTATCGGTGGGAATATAGCCGCCATACTTTGTACACGATA]

[+] EMBL CD059799             [AGTTTGTTGATACCATGCAGATAAATTACCAGTTAATGATGTTGATGCTGGATTTGTTGTTGCCATAGGATTTGATGATTGTAATAAACGTTGTTGTTGTTGTTGTGCTAAGCGTGCAACAGCTAATGCTGTCGCTACACCAGGATTTTCTCCTGTAGTACTTGTGGCTATTACACTACTATTGTTATTATCACTACTATCACTACTTCTAACATTACCCGGATTAGTTGTACCACTGCTAGCTGATGTAAAAATACTAACCGAAGTTGGGGCACCTGGTGCACTCCCACTTGAACATAAATAGGCAGCTAATGCTGATGCAGTAGTAGTACTGATACTACTACTGCTAGTAGTAGTTGTTGCTGTCGCGATAGTTGTACTGGTTGTAATCTCTTCACCA GGTGTATGAGCATAAGATGAAGCAGACAGAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD133234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTTGAACATAAATAGGCAGCTAATGCTGATGCAGTAGTAGTACTGATACTACTACTGCTAGTAGTAGTTGTTGCTGTCGCGATAGTTGTACTGGTTGTAATCTCTTC CCACGGTGTATGAGCATAAGATGAAGCAGACAGAGTGGAAATGGTTACAGTCGATATAGATGTGGTACTAGTTTCATGTGGNGTAGTGACTGTACTTAGAGGTATGTCAGCAGTATCTGCTGTAGTATTTGTATTATTAGACGACGTGTTTGTGCACACCAAACCACATCTAAATAGTCGAATTCTATGTAGGCTGTCTG                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD132924             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCACCA GGTGTATGAGCATAAGATGAAGCAGACAGAGTGGAAATGGTTACAGTCGATATAGATGTGGTACTAGTTTCATGTGGTGTAGTGACTGTACTTAGTGGTATGTCAGCAGTATCTGCTGTAGTATTTGTATTATTAGACGACGTATTTGAACAAACCAAACCAAATCTAAATAGTCGAATTCTATGTAGGCTGTCTGCAACTAACAATTGGTCAATTTGATTTTCTGAACGATTATTCACTGCATCGTTTGTGGAACCATTTTGAAGTAACCCATTTGCTGGCGAATCTGGTGCACCTGGAGTAGATCTATCTGGTGGAGGGTTGACTTGGACAGATTCTGTGCCATTAGGCAAAAGCATACTTGGTATCGGTGGGAATATAGCCGCCATACTTTGTACACGATA]
[+] EMBL CD188646             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTCACCA GGTGTATGAGCATAAGATGAAGCAGACAGAGTGGAAATGGTTACAGTCGATATAGATGTGGTACTAGCTTCATGTGGAGAAGTGACTGTACTTAGTGGTATGTCAGCAGTATCTGCTGTAGTATTTGTATTATTAGACGACGTATTTGAACAAACCAAACCAAATCTAAATAGTCGAATTCTATGTAGGCTGTCTGCAACTAACAATTGGTCAATTTGATTTTCTGAACGATTATTCACTGCATCGTTTGTGGAACCATTTTGAAGTAACCCATTTGCTGG                                                                                                                           ]




>consensus_6661#0
AGTTTGTTGATACCATGCAGATAAATTACCAGTTAATGATGTTGATGCTGGATTTGTTGT
TGCCATAGGATTTGATGATTGTAATAAACGTTGTTGTTGTTGTTGTGCTAAGCGTGCAAC
AGCTAATGCTGTCGCTACACCAGGATTTTCTCCTGTAGTACTTGTGGCTATTACACTACT
ATTGTTATTATCACTACTATCACTACTTCTAACATTACCCGGATTAGTTGTACCACTGCT
AGCTGATGTAAAAATACTAACCGAAGTTGGGGCACCTGGTGCACTCCCACTTGAACATAA
ATAGGCAGCTAATGCTGATGCAGTAGTAGTACTGATACTACTACTGCTAGTAGTAGTTGT
TGCTGTCGCGATAGTTGTACTGGTTGTAATCTCTTCACCAGGTGTATGAGCATAAGATGA
AGCAGACAGAGTGGAAATGGTTACAGTCGATATAGATGTGGTACTAGTTTCATGTGGNGT
AGTGACTGTACTTAGTGGTATGTCAGCAGTATCTGCTGTAGTATTTGTATTATTAGACGA
CGTATTTGAACAAACCAAACCAAATCTAAATAGTCGAATTCTATGTAGGCTGTCTGCAAC
TAACAATTGGTCAATTTGATTTTCTGAACGATTATTCACTGCATCGTTTGTGGAACCATT
TTGAAGTAACCCATTTGCTGGCGAATCTGGTGCACCTGGAGTAGATCTATCTGGTGGAGG
GTTGACTTGGACAGATTCTGTGCCATTAGGCAAAAGCATACTTGGTATCGGTGGGAATAT
AGCCGCCATACTTTGTACACGATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)