cluster # 6676

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Schistosoma mansoni
cluster # 6676 cluster # 6676 Sequences # 4 consensus # 2

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consensus_6676#0 length = 1056 sequences # 3

consensus_6676#1 length = 697 sequences # 1

consensusID : consensus_6676#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1056
fasta sequence

                              [ATCTTTATTTAAATTTTCATTGAGAACATTGGCTTCTCGACTGTTTAACTGTTTCAAATTAATAAAACAGTTAAATTAAATCAATTTCAAACGATTATGATTTAGTAAATTGATTTAAAAGAGGATAAAATATAGCTTTTCAAGTTAAATTATTAAATAACATTCGATGTCAAAGTTTGTGTAGTTGATAAGTATTCAGTTAGTAATTCAAGTAAACGATTTTGTGGTCGAACATCAGGAGTCTGATGTTGGCAGTAATTAGATATCTCAGTTTGTTGAGGATCTAAAGTCTGTGGATGAATTAATGCAGTTGCTTGTGGTGGTGTAGTTAATGCTCCAGAAGAAGCTTGCATTTGTACTGCAGTTAATGCTTGATTCGATGGGACAGCCATACCAGCTGTATTGGCTGATGGAATCTGTGGGAATAATGAATGCAAATTGGAACTGCCACCATTTAAACTATTAATAGATGGTGAATATTGTTGATTAATAGATGCTGTTGGAGAACATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTTGTTTGATTTTGAGCAGCAGCTGCAACAACTGCAGCTGCTGCTTGAGCAATTGAAAATGGTACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGATTTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCACGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTTAAATCTCCACGGTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGTCTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCAGAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTACAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGTTTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCGACATAGTCAGGGTCATCACCTTTATCACGTCCACCA]

[+] EMBL CD073976             [ATCTTTATTTAAATTTTCATTGAGAACATTGGCTTCTCGACTGTTTAACTGTTTCAAATTAATAAAACAGTTAAATTAAATCAATTTCAAACGATTATGATTTAGTAAATTGATTTAAAAGAGGATAAAATATAGCTTTTCAAGTTAAATTATTAAATAACATTCGATGTCAAAGTTTGTGTAGTTGATAAGTATTCAGTTAGTAATTCAAGTAAACGATTTTGTGGTCGAACATCAGGAGTCTGATGTTGGCAGTAATTAGATATCTCAGTTTGTTGAGGATCTAAAGTCTGTGGATGAATTAATGCAGTTGCTTGTGGTGGTGTAGTTAATGCTCCAGAAGAAGCTTGCATTTGTACTGCAGTTAATGCTTGATTCGATGGGACAGCCATACCAGCTGTATTGGCTGATGGAATCTGTGGGAATAATGAATGCAAATTGGAACTGCCACCATTTAAACTATTAATAGATGGTGAATATTGTTGATTAATAGATGCTGTTGGAGAACATACATACACTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD081981             [ TCTTTATTTAAATGTACATTGAGAACATTGGGTTCTCGACTGTTTAACTGTTTCAAATTAATAAAACAGTTAAATTAAATCAATTTCAAACGATTATGATTTAGTAAATTGATTTAAAAGAGGATAAAATATAGCTTTTCAAGTTAAATTATTAAATAACATTCGATGTCAAAGTTTGTGTAGTTGATAAGTATTCAGTTAGTAATTCAAGTAAACGATTTTGTGGTCGAACATCAGGAGTCTGATGTTGGCAGTAATTAGATATCTCAGTTTGTTGAGGATCTAAAGTCTGTGGATGAATTAATGCAGTTGCTTGTGGTGGTGTAGTTAATGCTCCAGAAGAAGCTTGCATTTGTACTGCAGTTAATGCTTGATTCGATGGGACAGCCATACCAGTTGTATTGGCTGATGGAATCTGTGGGAATAATGAATGCAAATTGGAACTGCCACCATTTAAACTATTAATAGATGGTGAATATTGTTGATTAATAGATGCTGTTGGAGAAGATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTTGTTTGATTTTGAGCAGCAGCTGCAACAACTGCAGCTGCTGCTTGAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD096415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATTTTGAGCAGCAGCTGCAACAACTGCAGCTGCTGCTTGAGCAATTGAAAATGGTACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGATTTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCACGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTTAAATCTCCACGGTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGTCTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCAGAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTACAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGTTTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCGACATAGTCAGGGTCATCACCTTTATCACGTCCACCA]




>consensus_6676#0
ATCTTTATTTAAATTTTCATTGAGAACATTGGCTTCTCGACTGTTTAACTGTTTCAAATT
AATAAAACAGTTAAATTAAATCAATTTCAAACGATTATGATTTAGTAAATTGATTTAAAA
GAGGATAAAATATAGCTTTTCAAGTTAAATTATTAAATAACATTCGATGTCAAAGTTTGT
GTAGTTGATAAGTATTCAGTTAGTAATTCAAGTAAACGATTTTGTGGTCGAACATCAGGA
GTCTGATGTTGGCAGTAATTAGATATCTCAGTTTGTTGAGGATCTAAAGTCTGTGGATGA
ATTAATGCAGTTGCTTGTGGTGGTGTAGTTAATGCTCCAGAAGAAGCTTGCATTTGTACT
GCAGTTAATGCTTGATTCGATGGGACAGCCATACCAGCTGTATTGGCTGATGGAATCTGT
GGGAATAATGAATGCAAATTGGAACTGCCACCATTTAAACTATTAATAGATGGTGAATAT
TGTTGATTAATAGATGCTGTTGGAGAACATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTT
GTTTGATTTTGAGCAGCAGCTGCAACAACTGCAGCTGCTGCTTGAGCAATTGAAAATGGT
ACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGAT
TTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCA
CGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTT
AAATCTCCACGGTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGT
CTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCA
GAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTACAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGT
TTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCG
ACATAGTCAGGGTCATCACCTTTATCACGTCCACCA

consensusID : consensus_6676#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 697
fasta sequence

                              [TAGATGCTGTGGAGAAGATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTTGTTTGATTTTGAGCAATTGAAAATGGTACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGATTTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCACGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTTAAATCTCCACGCTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGTCTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCAGAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTAGAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGTTTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCGACATAGTCAGGGTCATCACCTTCATCACGTCCACCATATTCTTCGCTTAGAANTAGATGTTGGAGAAACATTTGATAGAGGTCGTGTGCTTTGAATTATGAAACGACGGTTATTAGGATGTTGTGGAAAGTATCGGTGGATAGTTCGACGAAATTTTCGTTTTCCGAATTCTCGATTTCGGCCTCGTGCCGAATTNTTGGC]

[-] EMBL CD079718             [TAGATGCTGTGGAGAAGATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTTGTTTGATTTTGAGCAATTGAAAATGGTACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGATTTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCACGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTTAAATCTCCACGCTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGTCTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCAGAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTAGAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGTTTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCGACATAGTCAGGGTCATCACCTTCATCACGTCCACCATATTCTTCGCTTAGAANTAGATGTTGGAGAAACATTTGATAGAGGTCGTGTGCTTTGAATTATGAAACGACGGTTATTAGGATGTTGTGGAAAGTATCGGTGGATAGTTCGACGAAATTTTCGTTTTCCGAATTCTCGATTTCGGCCTCGTGCCGAATTNTTGGC]




>consensus_6676#1
TAGATGCTGTGGAGAAGATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTTGTTTGATTTTG
AGCAATTGAAAATGGTACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGA
TTGGACTAGTTGAGATTTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACG
TGCAACTGCAGAAGCACGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCAT
TTCATTTGCAGCTCTTAAATCTCCACGCTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAA
ACGAGCATTTTCAAGTCTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGAC
ATTAGATGTAGAGGCAGAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTAGAATATTTCGTTAT
ACCATGTGATGAACGTTTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATC
GTCATAATCGGGATCGACATAGTCAGGGTCATCACCTTCATCACGTCCACCATATTCTTC
GCTTAGAANTAGATGTTGGAGAAACATTTGATAGAGGTCGTGTGCTTTGAATTATGAAAC
GACGGTTATTAGGATGTTGTGGAAAGTATCGGTGGATAGTTCGACGAAATTTTCGTTTTC
CGAATTCTCGATTTCGGCCTCGTGCCGAATTNTTGGC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6676#0      ATCTTTATTTAAATTTTCATTGAGAACATTGGCTTCTCGACTGTTTAACTGTTTCAAATT 60
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      AATAAAACAGTTAAATTAAATCAATTTCAAACGATTATGATTTAGTAAATTGATTTAAAA 120
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      GAGGATAAAATATAGCTTTTCAAGTTAAATTATTAAATAACATTCGATGTCAAAGTTTGT 180
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      GTAGTTGATAAGTATTCAGTTAGTAATTCAAGTAAACGATTTTGTGGTCGAACATCAGGA 240
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      GTCTGATGTTGGCAGTAATTAGATATCTCAGTTTGTTGAGGATCTAAAGTCTGTGGATGA 300
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      ATTAATGCAGTTGCTTGTGGTGGTGTAGTTAATGCTCCAGAAGAAGCTTGCATTTGTACT 360
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      GCAGTTAATGCTTGATTCGATGGGACAGCCATACCAGCTGTATTGGCTGATGGAATCTGT 420
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      GGGAATAATGAATGCAAATTGGAACTGCCACCATTTAAACTATTAATAGATGGTGAATAT 480
consensus_6676#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6676#0      TGTTGATTAATAGATGCTGTTGGAGAACATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTT 540
consensus_6676#1      ----------TAGATGCTGT-GGAGAAGATACATACACTCCAGTTAGATTAGGTGTATTT 49
                                ********** ****** ********************************

consensus_6676#0      GTTTGATTTTGAGCAGCAGCTGCAACAACTGCAGCTGCTGCTTGAGCAATTGAAAATGGT 600
consensus_6676#1      GTTTGATTTTGAGCA---------------------------------ATTGAAAATGGT 76
                      ***************                                 ************

consensus_6676#0      ACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGAT 660
consensus_6676#1      ACGGTCGATTGACATGAACCAGAATTTGATGGGAAACTATTAGATTGGACTAGTTGAGAT 136
                      ************************************************************

consensus_6676#0      TTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCA 720
consensus_6676#1      TTATTATGTGCTTCTATGATTTTTGTAGCAGATTCCGCCATACGTGCAACTGCAGAAGCA 196
                      ************************************************************

consensus_6676#0      CGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTT 780
consensus_6676#1      CGTTTACTAGACTGACGTAATCTTGCATTCTGCTCTAGAAGCATTTCATTTGCAGCTCTT 256
                      ************************************************************

consensus_6676#0      AAATCTCCACGGTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGT 840
consensus_6676#1      AAATCTCCACGCTGTCGCATTAAATCGATTAGTTTACGGCGTAAACGAGCATTTTCAAGT 316
                      *********** ************************************************

consensus_6676#0      CTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCA 900
consensus_6676#1      CTAAGTGCATATTGTTGTTTAATCGATGGTGGGGCAAGGTGGACATTAGATGTAGAGGCA 376
                      ************************************************************

consensus_6676#0      GAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTACAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGT 960
consensus_6676#1      GAAGAATACAGAGAGCGTTTTCTCTTCGTAGAATATTTCGTTATACCATGTGATGAACGT 436
                      ****************************** *****************************

consensus_6676#0      TTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCG 1020
consensus_6676#1      TTAATGGATGTTCGCGGAACGGATAATTCATAGAGATCTTCATCGTCATAATCGGGATCG 496
                      ************************************************************

consensus_6676#0      ACATAGTCAGGGTCATCACCTTTATCACGTCCACCA------------------------ 1056
consensus_6676#1      ACATAGTCAGGGTCATCACCTTCATCACGTCCACCATATTCTTCGCTTAGAANTAGATGT 556
                      ********************** *************                        

consensus_6676#0      ------------------------------------------------------------
consensus_6676#1      TGGAGAAACATTTGATAGAGGTCGTGTGCTTTGAATTATGAAACGACGGTTATTAGGATG 616
                                                                                  

consensus_6676#0      ------------------------------------------------------------
consensus_6676#1      TTGTGGAAAGTATCGGTGGATAGTTCGACGAAATTTTCGTTTTCCGAATTCTCGATTTCG 676
                                                                                  

consensus_6676#0      ---------------------
consensus_6676#1      GCCTCGTGCCGAATTNTTGGC 697