cluster # 668

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Schistosoma mansoni
cluster # 668 cluster # 668 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_668#0 length = 868 sequences # 2

consensusID : consensus_668#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 868
fasta sequence

                              [GTTTTGCTAGTAATAAATTAACCCAAGTTGTATTTCGTTCATCAAATGGATTAAAAAGAGAACGTTTACCACCTAAACCACTTGATATTCATCATACAACAGAATTTCAAAGTGATGAAGAAGTTCAACCATGTCCATTTATTGTTCAACATAAACCAGCTAATATTACATCAAATGTAGATTGTCAATTTTCACCAGGTGGTTTACCAACTACATCGGATAAAGTTAGCTCACATCAAGCATTAGAACGTTGCCCATTTCGTCGACTAACAACAAATACATTACAGACAAGACGAAGAAAGACTAATAATCCAATGGAAGAAGAGATATATTTACCA-CCTTCTGTATTATCAGCTTGTTTATTAATTGTTGTACTATTATTAACAATTGGTATAATTATTGCATTTTGTATAATTAATCATGAAAAATTAATGTTATGTAAATCACGTAGTAGAAAACGACGTGAACGAGAAGCTGCACTTGCACAAGAAATGGATGAAAAAGCTGCTAAAGAAGCTGCAGCCGCCGCTACTGCAGCAGAAGCTGAACGACAACAACAACAACAACAAGCATCAACAATACGACATCCTATTTATGCTAGATATGGTATGATACCACCAAATATGGGTGGTGCATTCGGTGCATTTGCTCC-ACATATCANAC-ATGACAGTTAACATGAATATACCTAGTAATGTGGTAAGACANAATCANGGATNTAATGGACCNNATGT-AAATACACGGAANGGACTAGCAGACAGTTTCAACCNNAT-ATCACTTAGATTTCCAATGTC-TG-ACAGATA-TCATATT-ACATTA-TTAGCAGTCTT-ACTCATTTA-TGTAAAATAC--AATAC-TAAAATATACCTGATATGAC]

[+] EMBL CD081298             [GTTTTGCTAGTAATAAATTAACCCAAGTTGTATTTCGTTCATCAAATGGATTAAAAAGAGAACGTTTACCACCTAAACCACTTGATATTCATCATACAACAGAATTTCAAAGTGATGAAGAAGTTCAACCATGTCCATTTATTGTTCAACATAAACCAGCTAATATTACATCAAATGTAGATTGTCAATTTTCACCAGGTGGTTTACCAACTACATCGGATAAAGTTAGCTCACATCAAGCATTAGAACGTTGCCCATTTCGTCGACTAACAACAAATACATTACAGACAAGACGAAGAAAGACTAATAATCCAATGGAAGAAGAGATATATTTACCA CCTTCTGTATTATCAGCTTGTTTATTAATTGTTGTACTATTATTAACAATTGGTATAATTATTGCATTTTGTATAATTAATCATGAAAAATTAATGTTATGTAAATCACGTAGTAGAAAACGACGTGAACGAGAAGCTGCACTTGCACAAGAAATGGATGAAAAAGCTGCTAAAGAAGCTGCAGCCGCCGCTACTGCAGCAGAAGCTGAACGACAACAACAACAACAACAAGCATCAACAATACGACATCCTATTTATGCTAGATATGGTATGATACCACCAAATATGGGTGGTGCATTCGGTGCATTTGCTCC ACATATCANAC ATGACAGTTAACATGAATATACCTAGTAATGTGGTAAGACANAATCANGGATNTAATGGACCNNATGT AAATACACGGAANGGACTAGCAGACAGTTTCAACCNNAT ATCACTTAGATTTCCAATGTC TG ACAGATA TCATATT ACATTA TTAGCAGTCTT ACTCATTTA TGTAAAATAC  AATAC TAAAATATACCTGATA    ]
[-] EMBL CD075128             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAGACTAATAATCCAATGGAAGAAGAGATATATTTACCACCCTTCTGTATTATCAGCTTGTTTATTAATTGTTGTACTATTATTAACAATTGGTATAATTATTGCATTTTGTATAATTAATCATGAAAAATTAATGTTATGTAAATCACGTAGTAGAAAACGACGTGAACGAGAAGCTGCACTTGCACAAGAAATGGATGAAAAAGCTGCTAAAGAAGCTGCAGCCGCCGCTACTGCAGCAGAAGCTGAACGACAACAACAACAACAACAAGCATCAACAATACGACATCCTATTTATGCTAGATATGGTATGATACCACCAAATATGGGTGGTGCATTCGGTGCATTTGCTCCAACATATCAAACAATGACAGTTAACATGAATATACCTAGTAATGTGGTAAGACAAAATCAAGGATTTAATGGACC AATGTAAAATACACGGAAGGAACTAGCAGACAGTTTCAAACCAATAATCACTTAGATTTCCAATGTCTTGCACAGATATTCATATTAACATTATTTAGCAGTCTTAACTCATTTATTGTAAAATACAAAATACTTAAAATATACCTGATATGAC]




>consensus_668#0
GTTTTGCTAGTAATAAATTAACCCAAGTTGTATTTCGTTCATCAAATGGATTAAAAAGAG
AACGTTTACCACCTAAACCACTTGATATTCATCATACAACAGAATTTCAAAGTGATGAAG
AAGTTCAACCATGTCCATTTATTGTTCAACATAAACCAGCTAATATTACATCAAATGTAG
ATTGTCAATTTTCACCAGGTGGTTTACCAACTACATCGGATAAAGTTAGCTCACATCAAG
CATTAGAACGTTGCCCATTTCGTCGACTAACAACAAATACATTACAGACAAGACGAAGAA
AGACTAATAATCCAATGGAAGAAGAGATATATTTACCACCTTCTGTATTATCAGCTTGTT
TATTAATTGTTGTACTATTATTAACAATTGGTATAATTATTGCATTTTGTATAATTAATC
ATGAAAAATTAATGTTATGTAAATCACGTAGTAGAAAACGACGTGAACGAGAAGCTGCAC
TTGCACAAGAAATGGATGAAAAAGCTGCTAAAGAAGCTGCAGCCGCCGCTACTGCAGCAG
AAGCTGAACGACAACAACAACAACAACAAGCATCAACAATACGACATCCTATTTATGCTA
GATATGGTATGATACCACCAAATATGGGTGGTGCATTCGGTGCATTTGCTCCACATATCA
NACATGACAGTTAACATGAATATACCTAGTAATGTGGTAAGACANAATCANGGATNTAAT
GGACCNNATGTAAATACACGGAANGGACTAGCAGACAGTTTCAACCNNATATCACTTAGA
TTTCCAATGTCTGACAGATATCATATTACATTATTAGCAGTCTTACTCATTTATGTAAAA
TACAATACTAAAATATACCTGATATGAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case