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Schistosoma mansoni
cluster # 6689 cluster # 6689       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6689#0 length = 1260 sequences # 4  
consensusID : consensus_6689#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1260
fasta sequence 
                              [AAGNAATTTCGGCACGAGGAACATTTTCTAAATATGGACGAGCTACCGGTGCAGAACATTATGCTCTACGTAGATCTGTAAATGAAAATTTACTGGGGAAATTATTCACAGTACAAATTACCGGTTTAGTGATCACTTCACGTACAATAGGTGCTAGGGTTAAACTTCCAAATGATGAAGTCATTCGACATCTCTGGGCTGCCGAAGATCAAGAAGTTGTATTCCCAGATAATATTGGTATAATGCCCGTTAATCGTCCAACTGGCTGTCGTGCTCATGTTACAATGGCTTTAGCAACTGGTGTATCACCAGCGGAAACAGGTCTTGATTTACTACGTGTTGTAGACATGGAGTTGAACAATCGCCCTGGTGATCATGTAGCAATTATTAAAAATGGTTCCGTTCGTCGACTTATCATTCCAAAAGTACATTGTAGTACTTCACCTGAACGCCGTTTAGTCCAGGTACCAAATAACTCAAATTATCATCCACGTAATAATAATAACTTTTACGTTAATGGCATATCATCAGTTCCACCCTCAGATTATGAAACTATTTATGTGTACGATCTTGATTTTCCTCAACACTACCGTGTTACTTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTNTTTTCGTTCTACTTCAAGCTATCGCTGACCATATACATAACCATCTTCTTACCTTTATACATACACATACGCATAATACCTTACATTATTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATACACTCATAAATGAAAATTATCATATATATTAGGGTTCATTGTTTAATGATGAATTTACTATCGTGAGTTCATTTTCTTTTCCACCATGACATATGCTATCTAAGCGTATAAGACACGATACCCTATGTAAAATATATATATATTC]

[+] EMBL CD079806             [AAGNAATTTCGGCACGAGGAACATTTTCTAAATATGGACGAGCTACCGGTGCAGAACATTATGCTCTACGTAGATCTGTAAATGAAAATTTACTGGGGAAATTATTCACAGTACAAATTACCGGTTTAGTGATCACTTCACGTACAATAGGTGCTAGGGTTAAACTTCCAAATGATGAAGTCATTCGACATCTCTGGGCTGCCGAAGATCAAGAAGTTGTATTCCCAGATAATATTGGTATAATGCCCGTTAATCGTCCAACTGGCTGTCGTGCTCATGTTACAATGGCTTTAGCAACTGGTGTATCACCAGCGGAAACAGGTCTTGATTTACTACGTGTTGTAGACATGGAGTTGAACAATCGCCCTGGTGATCATGTAGCAATTATTAAAAATGGTTCCGTTCGTCGACTTATCATTCCAAAAGTACATTGTAGTACTTCACCTGAACGCCGTTTAGTCCAGGTACCAAATAACTCAAATTATCATCCACGTAATAATAATAACTTTTACGTTAATGGCATATCATCAGTTCCACCCTCAGATTATGAAACTATTTATGTGTACGATCTTGATTTTCCTCAACACTACCGTGTTACTTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTNTTTTCGTTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD074064             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTTTTTTCGTTCTACTTCAAGCTATCGCTGACCATATACATAACCATCTTCTTACCTTTATACATACACATACGCATAATACCTTACATTATTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATACACTCATAAATGAAAATTATCATATATATTAGGGTTCATTGTTTAATGATGAATTTACTATCGTGAGTTCATTTTCTTTTCCACCATGACATATGCTATCTAAGCGTATAAGACACGATACCCTATGTAAAATATATATATATTC]
[+] EMBL AA566197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD140028             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATAC                                                                                                                                                ]




>consensus_6689#0
AAGNAATTTCGGCACGAGGAACATTTTCTAAATATGGACGAGCTACCGGTGCAGAACATT
ATGCTCTACGTAGATCTGTAAATGAAAATTTACTGGGGAAATTATTCACAGTACAAATTA
CCGGTTTAGTGATCACTTCACGTACAATAGGTGCTAGGGTTAAACTTCCAAATGATGAAG
TCATTCGACATCTCTGGGCTGCCGAAGATCAAGAAGTTGTATTCCCAGATAATATTGGTA
TAATGCCCGTTAATCGTCCAACTGGCTGTCGTGCTCATGTTACAATGGCTTTAGCAACTG
GTGTATCACCAGCGGAAACAGGTCTTGATTTACTACGTGTTGTAGACATGGAGTTGAACA
ATCGCCCTGGTGATCATGTAGCAATTATTAAAAATGGTTCCGTTCGTCGACTTATCATTC
CAAAAGTACATTGTAGTACTTCACCTGAACGCCGTTTAGTCCAGGTACCAAATAACTCAA
ATTATCATCCACGTAATAATAATAACTTTTACGTTAATGGCATATCATCAGTTCCACCCT
CAGATTATGAAACTATTTATGTGTACGATCTTGATTTTCCTCAACACTACCGTGTTACTT
TTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTT
GCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTNTTTTCGTTCTACT
TCAAGCTATCGCTGACCATATACATAACCATCTTCTTACCTTTATACATACACATACGCA
TAATACCTTACATTATTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTG
AATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACA
TGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTAT
TCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATG
TACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTT
ATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATACACTCATAAATGAAAATTATCATAT
ATATTAGGGTTCATTGTTTAATGATGAATTTACTATCGTGAGTTCATTTTCTTTTCCACC
ATGACATATGCTATCTAAGCGTATAAGACACGATACCCTATGTAAAATATATATATATTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)