These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6689#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1260 fasta sequence [AAGNAATTTCGGCACGAGGAACATTTTCTAAATATGGACGAGCTACCGGTGCAGAACATTATGCTCTACGTAGATCTGTAAATGAAAATTTACTGGGGAAATTATTCACAGTACAAATTACCGGTTTAGTGATCACTTCACGTACAATAGGTGCTAGGGTTAAACTTCCAAATGATGAAGTCATTCGACATCTCTGGGCTGCCGAAGATCAAGAAGTTGTATTCCCAGATAATATTGGTATAATGCCCGTTAATCGTCCAACTGGCTGTCGTGCTCATGTTACAATGGCTTTAGCAACTGGTGTATCACCAGCGGAAACAGGTCTTGATTTACTACGTGTTGTAGACATGGAGTTGAACAATCGCCCTGGTGATCATGTAGCAATTATTAAAAATGGTTCCGTTCGTCGACTTATCATTCCAAAAGTACATTGTAGTACTTCACCTGAACGCCGTTTAGTCCAGGTACCAAATAACTCAAATTATCATCCACGTAATAATAATAACTTTTACGTTAATGGCATATCATCAGTTCCACCCTCAGATTATGAAACTATTTATGTGTACGATCTTGATTTTCCTCAACACTACCGTGTTACTTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTNTTTTCGTTCTACTTCAAGCTATCGCTGACCATATACATAACCATCTTCTTACCTTTATACATACACATACGCATAATACCTTACATTATTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATACACTCATAAATGAAAATTATCATATATATTAGGGTTCATTGTTTAATGATGAATTTACTATCGTGAGTTCATTTTCTTTTCCACCATGACATATGCTATCTAAGCGTATAAGACACGATACCCTATGTAAAATATATATATATTC] [+] EMBL CD079806 [AAGNAATTTCGGCACGAGGAACATTTTCTAAATATGGACGAGCTACCGGTGCAGAACATTATGCTCTACGTAGATCTGTAAATGAAAATTTACTGGGGAAATTATTCACAGTACAAATTACCGGTTTAGTGATCACTTCACGTACAATAGGTGCTAGGGTTAAACTTCCAAATGATGAAGTCATTCGACATCTCTGGGCTGCCGAAGATCAAGAAGTTGTATTCCCAGATAATATTGGTATAATGCCCGTTAATCGTCCAACTGGCTGTCGTGCTCATGTTACAATGGCTTTAGCAACTGGTGTATCACCAGCGGAAACAGGTCTTGATTTACTACGTGTTGTAGACATGGAGTTGAACAATCGCCCTGGTGATCATGTAGCAATTATTAAAAATGGTTCCGTTCGTCGACTTATCATTCCAAAAGTACATTGTAGTACTTCACCTGAACGCCGTTTAGTCCAGGTACCAAATAACTCAAATTATCATCCACGTAATAATAATAACTTTTACGTTAATGGCATATCATCAGTTCCACCCTCAGATTATGAAACTATTTATGTGTACGATCTTGATTTTCCTCAACACTACCGTGTTACTTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTNTTTTCGTTCTA ] [-] EMBL CD074064 [ TTTTGCTGCTTCATATTGAGTTATCTTTTCATTACGTCATGATTAGTTATCAATATCTTCTTGCATATCTGCCTTTCTTTGAATTGGTCCAATTTTTTATCTATCTTTTTTTTCGTTCTACTTCAAGCTATCGCTGACCATATACATAACCATCTTCTTACCTTTATACATACACATACGCATAATACCTTACATTATTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATACACTCATAAATGAAAATTATCATATATATTAGGGTTCATTGTTTAATGATGAATTTACTATCGTGAGTTCATTTTCTTTTCCACCATGACATATGCTATCTAAGCGTATAAGACACGATACCCTATGTAAAATATATATATATTC] [+] EMBL AA566197 [ TTTCTGTTTCCATCCCTTCAATTTTTAGATTTGTTAATTTCATTGAATTTGCATGTTTCGTCTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTA ] [-] EMBL CD140028 [ CTTTGTTACTTTGTACATGGATAAATCAAAATTTGCAGCAAACATGTTGTCTAGTCTTGTTTCTGTACCGGATTATACTGTTTATACTCATTTTTGAAATGTATTCATGATATTGTAACTATGACAGTTTTTAATCTGCGAGTATTATTTAGTAGTTAGTTATGTACTTGTCATCTTATAACCGGTCTAAATTGTTATCCGAATGATTAATTTCTTGTAACTTTATTTTTTCACACTGCATTATTTGTGAACTTCTATAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||