These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6694#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1105 fasta sequence [TCAAATAAATAATCTTAGTTTAAATGATAAACAACTTGTTACAAAATGTACATCAACTCCTGGTGATAATAATAATCATTTAGATGATGAATTTTCTCAATTGTTTAAAACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTNTGAATAAT-NATGGC-GATCAACTGTGGC-AAAACATCAGGA-TAGTCATAGATTCCTCAGAATCTCACCAACACCACCAACAGCAACAACCATCAACATCTAATGGTAGTGGTTTTATTTCAGAGGATATTCATGATTTCTTTGGATTACCTTCTTCACATGAATTAACTTCTCAAGTGTTTGCTGTCACACCATTAAGTTGG-TGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTATATAGATCTCTATTCTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTACTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTCAATGATAT] [+] EMBL CD077541 [TCAAATAAATAATCTTAGTTTAAATGATAAACAACTTGTTACAAAATGTACATCAACTCCTGGTGATAATAATAATCATTTAGATGATGAATTTTCTCAATTGTTTAAAACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTNTGAATAATNNATGGC GATCAACTGTGGC AAAACATCAGGA TAGTC ] [+] EMBL CD079910 [ ACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTTTGAATAAT AATGGCGGATCAACTGTGGCAAAAACATCAGGATTAGTCATAGATTCCTCAGAATCTCACCAACACCACCAACAGCAACAACCATCAACATCTAATGGTAGTGGTTTTATTTCAGAGGATATTCATGATTTCTTTGGATTACCTTCTTCACATGAATTAACTTCTCAAGTGTTTGCTGTCACACCATTAAGTTGG TGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCANAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTG ACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGGATATTGATTGATTG ] [-] EMBL CD074107 [ TGGNTGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTATATAGATCTCTATTCTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTACTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTCAATGATAT] [-] EMBL AI975137 [ AATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCAGTACATCACTAGAATAGGACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTAAATAGATCTCTATTTTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTAGTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||