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Schistosoma mansoni
cluster # 6694 cluster # 6694       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6694#0 length = 1105 sequences # 4  

consensusID : consensus_6694#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1105
fasta sequence
                              [TCAAATAAATAATCTTAGTTTAAATGATAAACAACTTGTTACAAAATGTACATCAACTCCTGGTGATAATAATAATCATTTAGATGATGAATTTTCTCAATTGTTTAAAACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTNTGAATAAT-NATGGC-GATCAACTGTGGC-AAAACATCAGGA-TAGTCATAGATTCCTCAGAATCTCACCAACACCACCAACAGCAACAACCATCAACATCTAATGGTAGTGGTTTTATTTCAGAGGATATTCATGATTTCTTTGGATTACCTTCTTCACATGAATTAACTTCTCAAGTGTTTGCTGTCACACCATTAAGTTGG-TGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTATATAGATCTCTATTCTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTACTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTCAATGATAT]

[+] EMBL CD077541             [TCAAATAAATAATCTTAGTTTAAATGATAAACAACTTGTTACAAAATGTACATCAACTCCTGGTGATAATAATAATCATTTAGATGATGAATTTTCTCAATTGTTTAAAACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTNTGAATAATNNATGGC GATCAACTGTGGC AAAACATCAGGA TAGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD079910             [                                                                                                             ACAAAATTAACATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATCTAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTTTGAATAAT AATGGCGGATCAACTGTGGCAAAAACATCAGGATTAGTCATAGATTCCTCAGAATCTCACCAACACCACCAACAGCAACAACCATCAACATCTAATGGTAGTGGTTTTATTTCAGAGGATATTCATGATTTCTTTGGATTACCTTCTTCACATGAATTAACTTCTCAAGTGTTTGCTGTCACACCATTAAGTTGG TGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCANAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTG ACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGGATATTGATTGATTG                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074107             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGGNTGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGACATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATGTTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAACAAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTATATAGATCTCTATTCTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTACTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTCAATGATAT]
[-] EMBL AI975137             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATCTTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGGTGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCAGTACATCACTAGAATAGGACATGTTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAAATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTGTTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTAAATAGATCTCTATTTTTATGAATGTTCAATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTAGTAATATTACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTATGATATAAATATAATTC        ]


>consensus_6694#0 TCAAATAAATAATCTTAGTTTAAATGATAAACAACTTGTTACAAAATGTACATCAACTCC TGGTGATAATAATAATCATTTAGATGATGAATTTTCTCAATTGTTTAAAACAAAATTAAC ATTAAATGTTAATTCCTCACTAAATAATACAAGTGATAGGTTGAGTTCAACATCAATATC TAAACATCTACCGGAAAGACAATGTGTTGATGAACAGAATTCTTATGAAACTNTGAATAA TNATGGCGATCAACTGTGGCAAAACATCAGGATAGTCATAGATTCCTCAGAATCTCACCA ACACCACCAACAGCAACAACCATCAACATCTAATGGTAGTGGTTTTATTTCAGAGGATAT TCATGATTTCTTTGGATTACCTTCTTCACATGAATTAACTTCTCAAGTGTTTGCTGTCAC ACCATTAAGTTGGTGTCCTCATTTAATATCTGTTCAAAATAATCCTAATTGGAAACCTGA CATAAATAGTTTGTGTAATTCTTGTAATCATTCCAGTGAAAATTGGGTTTGTCTATCATG TTATTCAGTTTACTGTGGTCGTTATGCTAATTCACATATGATTGAGCATTTTAATACAAC AAAACATTCAATTGTACTTAGTTATGCTGATTTATCAACATGGTGTTATCAATGTGAATC TTATGTGCATAATGAAGTATTATTGAATATGAAACGTGCTGTTTATCAAGCAAAATTTGG TGAAGATATGCCAGGTTCTTCTTGAACACCATCATCACTACATCACTAGAATAGTACATG TTTATCTTATAAACCTATCTATGTATATTGTATATTGATTGATTGATTGTATTACAGAAA ATTCAGATTCCCTTTATTATCTTTTTTTTAACTGTTCACAATGGATACTTCCTTTTTTTG TTCTTATAAAATTGTATTATCACTAACTGTTATATAGATCTCTATTCTTATGAATGTTCA ATTCAATATGGAAATTTTTTTCTTTTTACCTATTTCTATTAACCATACTACTACTAATAT TACTACTATCAGTAGTAGTATCATAACTATCTGTTTTTAAAATGAAACGATTACATTTTA TGATATAAATATAATTCAATGATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)