Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 67 cluster # 67       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_67#0 length = 794 sequences # 2  

consensusID : consensus_67#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 794
fasta sequence
                              [AGGACATATTGTGGCTAATATGCTATTAAATCTCACAGCTCTTCTCGATTCGAAGGTACCATGAATGTTGATTTAAATGAAATCAGTATGAACTTAGTTCCGTTTCCTCACTTACATTACCTGATTGCTTCACAAAGCCCTTTTTCAACCATCTCTCGCATATCAGCTCCTAGAAAGCTCGACCAAGTATTTTCAGATACATTTACTAGAGATTATCAGTTAATGTCTACTAATCCTTGTAGACATGTTTATCTAGCAGCTGCTCTACTTGTTCGTGGTGCAATTAGTGCATCAGATCTCCGTCGAAATATTGACAAACTTCAATCTCGCTTAAATTTTGTTCCATGGAACCGAGAAGGTTGGAAAGTTGGACATTGTTTAGTTCCACCAGTGGATCATAAATACTGTCTATTAGCTCTAGCTAATAACACTTCTATTCATGAATCATTCACTTTTATTTTGGAACGATTCTATAAACTATATAGAAAAAAGGCACATTTACACCATTATACAACTGTCGACGGTTTCGATACTGGCATGTTTGATTCAAGCGCTAATTCACTTCAGGAATTAATAATTCAATATACAGATTTTGAAAGACAGGCTAATGGANCAGCACTACCAAATTTACCACAGTTAGAGATTATGGATTGAATTAATTCCCGATTGGTAATGCACTTATTTTAGCAGAACTATTTCTTACAGAAAGTACTTTATCGCATTTATTAGCTNTTATGGGTATNC-TGGATATCTAAAGCTGGNATAAATTGNGGCTANNTC-TGNNATGNGATCTC]

[+] EMBL CD079956             [AGGACATATTGTGGCTAATATGCTATTAAATCTCACAGCTCTTCTCGATTCGAAGGTACCATGAATGTTGATTTAAATGAAATCAGTATGAACTTAGTTCCGTTTCCTCACTTACATTACCTGATTGCTTCACAAAGCCCTTTTTCAACCATCTCTCGCATATCAGCTCCTAGAAAGCTCGACCAAGTATTTTCAGATACATTTACTAGAGATTATCAGTTAATGTCTACTAATCCTTGTAGACATGTTTATCTAGCAGCTGCTCTACTTGTTCGTGGTGCAATTAGTGCATCAGATCTCCGTCGAAATATTGACAAACTTCAATCTCGCTTAAATTTTGTTCCATGGAACCGAGAAGGTTGGAAAGTTGGACATTGTTTAGTTCCACCAGTGGATCATAAATACTGTCTATTAGCTCTAGCTAATAACACTTCTATTCATGAATCATTCACTTTTATTTTGGAACGATTCTATAAACTATATAGAAAAAAGGCACATTTACACCATTATACAACTGTCGACGGTTTCGATACTGGCATGTTTGATTCAAGCGCTAATTCACTTCAGGAATTAATAATTCAATATACAGATTTTGAAAGACAGGCTAATGGANCAGCACTACCAAATTTACCACAGTTAGAGATTATGGATTGAATTAATTCCCGATTGGTAATGCACTTATTTTAGCAGAACTATTTCTTACAGAAAGTACTTTATCGCATTTATTAGCTNTTATGGGTATNC TGGATATCTAAAGCTGGNATAAATTGNGGCTANNTC TGNNATGNGATCT ]
[-] EMBL CD074151             [                                                                                                                                                          CTCGCATATCAGCTCCTAGAAAGCTCGACCAAGTATTTTCAGATACATTTACTAGAGATTATCAGTTAATGTCTACTAATCCTTGTAGACATGTTTATCTAGCAGCTGCTCTACTTGTTCGTGGTGCAATTAGTGCATCAGATCTCCGTCGAAATATTGACAAACTTCAATCTCGCTTAAATTTTGTTCCATGGAACCGAGAAGGTTGGAAAGTTGGACATTGTTTAGTTCCACCAGTGGATCATAAATACTGTCTATTAGCTCTAGCTAATAACACTTCTATTCATGAATCATTCACTTTTATTTTGGAACGATTCTATAAACTATATAGAAAAAAGGCACATTTACACCATTATACAACTGTCGACGGTTTCGATACTGGCATGTTTGATTCAAGCGCTAATTCACTTCAGGAATTAATAATTCAATATACAGATTTTGAAAGACAGGCTAATGGACAAGCACTACCAAATTTACCACAGTTAGAGATTATGGATTGAATTAATTCCCGATTGTAAATGCACTTATTTTAGCAGAACTATTTCTTACAGAAAGTACTTTATCGCATTTATTAGCTTTTAT GTTATTCTTGTATATCTAAAGCTTGTATAATTTG TGCTTATTCTTGTAATGTGATCTC]


>consensus_67#0 AGGACATATTGTGGCTAATATGCTATTAAATCTCACAGCTCTTCTCGATTCGAAGGTACC ATGAATGTTGATTTAAATGAAATCAGTATGAACTTAGTTCCGTTTCCTCACTTACATTAC CTGATTGCTTCACAAAGCCCTTTTTCAACCATCTCTCGCATATCAGCTCCTAGAAAGCTC GACCAAGTATTTTCAGATACATTTACTAGAGATTATCAGTTAATGTCTACTAATCCTTGT AGACATGTTTATCTAGCAGCTGCTCTACTTGTTCGTGGTGCAATTAGTGCATCAGATCTC CGTCGAAATATTGACAAACTTCAATCTCGCTTAAATTTTGTTCCATGGAACCGAGAAGGT TGGAAAGTTGGACATTGTTTAGTTCCACCAGTGGATCATAAATACTGTCTATTAGCTCTA GCTAATAACACTTCTATTCATGAATCATTCACTTTTATTTTGGAACGATTCTATAAACTA TATAGAAAAAAGGCACATTTACACCATTATACAACTGTCGACGGTTTCGATACTGGCATG TTTGATTCAAGCGCTAATTCACTTCAGGAATTAATAATTCAATATACAGATTTTGAAAGA CAGGCTAATGGANCAGCACTACCAAATTTACCACAGTTAGAGATTATGGATTGAATTAAT TCCCGATTGGTAATGCACTTATTTTAGCAGAACTATTTCTTACAGAAAGTACTTTATCGC ATTTATTAGCTNTTATGGGTATNCTGGATATCTAAAGCTGGNATAAATTGNGGCTANNTC TGNNATGNGATCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)