These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6705#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1076 fasta sequence [TAACAATGATTCTGAACAGGTCGCTATTGGAAATTCTGATAAAGGACAGTCGTTAGATCCTGATTCCACAGTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGGAATGTTAGAAAGTCTGGGACAATCTATTCAT-GTACCAATAC-TCAAT-GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATA-ATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGTTATATATTTTCATTGTATTTGATCTATCTATTATCTTTTGTTATTCACTTATCTATATTTATGATTAATGACATACTGTATGTATATGAATGATGAATTATGTAATCATCATAAATAAAAATGATCAATCAACTATTCGGTTTCTTTAGTTTATGTTTGATAGATTTTAATTGTCATTCCATTAATTGATAAAATGTGTCCCTTTTTTTTGTAAAATAGTTTTTCTTGTTTTTCATTTACTTATAATATAAATAAACAA] [+] EMBL AW186598 [TAACAATGATTCTGAACAGGTCGCTATTGGAAATTCTGATAAAGGACAGTCGTTAGATCCTGATTCCACAGTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGGAATGTTAGAAAGTCTGGGACAATCTATTCATGGTACCAATACATCAATGGGTGGTGAAAGCGGGATATT ] [+] EMBL CD096900 [ GTATGTCATCGTCGTAGTTTAGTTGAAGAAATGTTAGAAAGTCTGGAACAATCTATTCAT GTACCAATAC TCAAT GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATT ] [+] EMBL CD080350 [ CTATTCAT GTACCAATAC TCAAT GGTGGTGAAAGCGGAATATTAACTAATGACATGCTAGTAGATCTTAGTGTTAACTTCCCTGCACATTGGACTAGTTCTAACTTAAATTCAATCTACAAATCTGAAGATGATGGCTATAGTTTAAACACAGTGTACAGAAAATGTAAAGATGTTGAAGGTAGTGTTCTATTGCTTATACGTGATACAATGGGTGTTGTATTTGGTGCTGTTATGTCGGAAACAATGAAATGTAGTAAACATTTTTATGGGACTGGTGAAACATTTGTCTTTCATTGGAAACCAACATTTAAAAAATATTGTTGGACTAAGAAGAATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATA ATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGT ] [-] EMBL CD074267 [ AATTATTTTTTCATGAGAGGATCTCTTCATTCATTTCATATTGGTGGTCAAAGTGGACGAAATGCAATATGGTTTGATGAATCATTAAAATATGGTTGTAGTGAACCAACAGATACATTTGATANATCCTGTACTTAGTGGAAATTTACCAGATATACAATTTTCTTCTTTATCAATCAATAAATCTGATAAAAATGAAAATGTAATTATACAAAACAATTATCAAAATGTCCATAATAATCATAATTTTAATCCATTAAATCCAACTATAAATTATCCATCTACAATAAGTGACAGTGTCTCATTCATCATTGATACATTTGAATTGTGGCAATTAATCAGTTGTTAGTGATAAAAGTGTTATATATTTTCATTGTATTTGATCTATCTATTATCTTTTGTTATTCACTTATCTATATTTATGATTAATGACATACTGTATGTATATGAATGATGAATTATGTAATCATCATAAATAAAAATGATCAATCAACTATTCGGTTTCTTTAGTTTATGTTTGATAGATTTTAATTGTCATTCCATTAATTGATAAAATGTGTCCCTTTTTTTTGTAAAATAGTTTTTCTTGTTTTTCATTTACTTATAATATAAATAAACAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||