These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6742#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 995 fasta sequence [ATAATACAAAAAGAACACCAACAAAAACGTCTGCATCTGTACTTCGTCTAGTGCTTTTACTGTTTTCTTTTATGCCAGTTGATCTCAACTATAATTTATGACACTACAGTAATTATTATTAATTTATCTCTTTCATTTTACTAATTTCACCGTATTGCTGTTTTTATCTCATACATCCTCTCGTTTTTGTAGCTTAGTTTGTCCAGCACATTGTCGTTGTGATGTCTCTTTACTTTTATCTTTGTTGTGAGTGAGAAATACAAATAATGATGATGATTAGTTTCAATTATGAATCTCTGTAATACAGTATGTTTTTATTTGTTTTCCTACATGTTCATATCAAACATATTTGTTAACGTCGGCCTAAATATTTCAGTTTAGCTTCTTCAATGCAACACTGAACAGTTCAGCATTCAAAAAAAAAACAATGAAAGAAGAGTGTACTCATTAAAAAATATGAATGTATTGTTTGTTTCTCGTCGTTAACTTTATCTTTCGAATGATTTTCTCATGTGAATAAAATAAGGACAATTGTTGACTGACTTTAAAGAATAATATTTGTTGTGAACTATTCTGTGTTCAGAATGTCTTGCTTTCATTAACTTCTTTTAATAAACTAACAGAATANATTTAAGGAGTCGTGAGACGTTTTACTGGGCTNTTGTACGAACCATGTATAGAAATCAATCTATTATTTTAAATCGAATAAATGACTGATATCATAACTCATTTCATTAGTTGGAATTTGGNCTTGNTTTTATGGTTAAGGGCNTNNGATCTATGCCTATATATTGACTGACGTATATAANNTAGCTTATATTTTTATGTCTCTAGTTNNCTCACTATAAAGATAAGTATACAANTTTTCCCCTCTGATACGTCCAGCTTTGTTAATTTTCTTCTCATAATGATGGGTCTTTTATAGCTCGCTCATTCTGATGATGGNTGATCCNGNCACAGTAAAGCTCTGATTACAAGGATAGTTGATCATTCTA] [-] EMBL CD192185 [ATAATACAAAAAGAACACCAACAAAAACGTCTGCATCTGTACTTCGTCTAGTGCTTTTACTGTTTTCTTTTATGCCAGTTGATCTCAACTATAATTTATGACACTACAGTAATTATTATTAATTTATCTCTTTCATTTTACTAATTTCACCGTATTGCTGTTTTTATCTCATACATCCTCTCGTTTTTGTAGCTTAGTTTGTCCAGCACAT ] [+] EMBL CD081196 [ TTCGTCTAGTGCTTTTACTGTTTTCTTTTATGCCAGTTGATCTCAACTATAATTTATGACACTACAGTAATTATTATTAATTTATCTCTTTCATTTTACTAATTTCACCGTATTGCTGTTTTTATCTCATACATCCTCTCGTTTTTGTAGCTTAGTTTGTCCAGCACATTGTCGTTGTGATGTCTCTTTACTTTTATCTTTGTTGTGAGTGAGAAATACAAATAATGATGATGATTAGTTTCAATTATGAATCTCTGTAATACAGTATGTTTTTATTTGTTTTCCTACATGTTCATATCAAACATATTTGTTAACGTCGGCCTAAATATTTCAGTTTAGCTTCTTCAATGCAACACTGAACAGTTCAGCATTCAAAAAAAAAACAATGAAAGAAGAGTGTACTCATTAAAAAATATGAATGTATTGTTTGTTTCTCGTCGTTAACTTTATCTTTCGAATGATTTTCTCATGTGAATAAAATAAGGACAATTGTTGACTGACTTTAAAGAATAATATTTGTTGTGAACTATTCTGTGTTCAGAATGTCTTGCTTTCATTAACTTCTTTTAATAAACTAACAGAATANATTTAAGGAGTCGTGAGACGTTTTACTGGGCTNTTGTACGAACCATGTATAGAAATCAATCTATTATTTTAAATCGAATAAATGACTGATATCATAACTCATTTCATTAGTTGGAATTTGGNCTTGNTTTTATGGTTAAGGGCNTNNGATCTATGCCTATATATTGACTGACGTATATAANNTAGCTTATATTTTTATGTCTCTAGTTNNCTCACTATAAAGATAAGTATACAANTTTTCCCCTCTGATACGTCCAGCTTTGTTAATTTTCTTCTCATAATGATGGGTCTTTTATAGCTCGCTCATTCTGATGATGGNTGATCCNGNCACAGTAAAGCTCTGATTACAAGGATAGTTGATCATTCTA] consensusID : consensus_6742#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! 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alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_6742#0 ATAATACAAAAAGAACACCAACAAAAACGTCTGCATCTGTACTTCGTCTAGTGCTTTTAC 60 consensus_6742#1 ------------------------------------------------------------ consensus_6742#0 TGTTTTCTTTTATGCCAGTTGATCTCAACTATAATTTATGACACTACAGTAATTATTATT 120 consensus_6742#1 ------------------------------------------------------------ consensus_6742#0 AATTTATCTCTTTCATTTTACTAATTTCACCGTATTGCTGTTTTTATCTCATACATCCTC 180 consensus_6742#1 ------------------------------------------------------------ consensus_6742#0 TCGTTTTTGTAGCTTAGTTTGTCCAGCACATTGTCGTTGTGATGTCTCTTTACTTTTATC 240 consensus_6742#1 ------------------------------------------------------------ consensus_6742#0 TTTGTTGTGAGTGAGAAATACAAATAATGATGATGATTAGTTTCAATTATGAATCTCTGT 300 consensus_6742#1 ---------AGTGAGAAATACAAATAATGATGATGATTAGTTTCAATTATGAATCTCTGT 51 *************************************************** consensus_6742#0 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Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||