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Schistosoma mansoni
cluster # 6744 cluster # 6744       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6744#0 length = 1149 sequences # 4  
consensusID : consensus_6744#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1149
fasta sequence 
                              [GGAGAATTTATTTATGTATAAATGAGCATGGAACAATTATCCACAATATAAATGTGTATGTATGTGAGGCAATCAAATTATATCACGAAAGAAGTGTGAAAATAAAATTAACAATATAAGTACACATGTAAATGTAAATACACATGCAACTTAGGGAAAGTCTAAGTCTATATACGTATAGAAGGAAGAAAAAATGTTTTCAAGAACGAGAGAGAGAGGGAGGGAAAGAGATTTGTCCTAAAAACAAAACTCGATCTATGTAACAATAAATGTTACTTTTATGAAATCACACTGCTGTTGCAAGGAAATGTTCTAAATATTCTTTATTCCAAATTAAGAAATAAATAAACATCAAAGGAGAAGAAATAGGAAGGATAATAATGATCTTTAAGTATTATAACAATGTTGAGT-GGACAAATAACTT-CAAGATAGTGAGTATAAAGTATGTTTATTATGGAATAATAATAACAGTAATAATGATAATGAGTAATTAATTACAAATTACGAATAAGTATGTATGGGAGAAGACATTGTTGTATCGTTGATCTCTGTCACCTGATTTATTTATTCTCTGAGATGCCAGTGTGATTTTTGTCAACACTTGTTTGATGTATTGGAATGGAGTGAGGGAAATTTGTTTAAACGACAGGAGAAAGTTGCTTGATAAATGTTTGACTAAAATACGCCTATGGAAACAGTTATTGTTGACAATTTTAAACATCACTTCTCTGCATTAATCTTTCGATTGTATGACATATTTGTTTAGCCTTATCACAACGAATTCGTAATAGTGAAACCTGATTATAGCTTGTTTGTTGTTCATTAAAATTTAATGAAATTATTGAATCTTCAAATGATAAATCAATCAGTTGATCATAATTTAATTTTTTGATAATTTCACCTGATAAATTACGAACTGTTAAACATTTACCATAAATCTCTAAAATTGTTGCCTCGTTGGATACATTACTTAGTATTTCAATTTCATAAGATTGAAATACTTTTAATCTAGTCATAGGAGGAAGTAAATCAATTGAATTTCCATCCAAATATTTGACATTATCCAACAGACGACTAGTTATGGCAGCAAAATATGAACCAATACGACATCTTGCCAACAATCGACGCACGTGATTTACTAATATACCT]

[+] EMBL CD075049             [GGAGAATTTATTTATGTATAAATGAGCATGGAACAATTATCCACAATATAAATGTGTATGTATGTGAGGCAATCAAATTATATCACGAAAGAAGTGTGAAAATAAAATTAACAATATAAGTACACATGTAAATGTAAATACACATGCAACTTAGGGAAAGTCTAAGTCTATATACGTATAGAAGGAAGAAAAAATGTTTTCAAGAACGAGAGAGAGAGGGAGGGAAAGAGATTTGTCCTAAAAACAAAACTCGATCTATGTAACAATAAATGTTACTTTTATGAAATCACACTGCTGTTGCAAGGAAATGTTCTAAATATTCTTTATTCCAAATTAAGAAATAAATAAACATCAAAGGAGAAGAAATAGGAAGGATAATAATGATCTTTAAGTATTATAACAATGTTGAGT GGACAAATAACTT CAAGATAGTGAGTATAAAGTATGTTTATTATGGAATAATAATAACAGTAATAATGATAATGAGTAATTAATTACAAATTACGAATAAGTATGTATGGGAGAAGACATTGTTGTATCGTTGATCTCTGTCACCTGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD143412             [               GTATAAATGAGCATGGAACAATTATCCACAATATAAATGTGTATGTATGTGAGGCAATCAAATTATATCACGAAAGAAGTGTGAAAATAAAATTAACAATATAAGTACACATGTAAATGTAAATACACATGCAACTTAGGGAAAGTCTAAGTCTATATACGTATAGAAGGAAGAAAAAATGTTTTCAAGAACGAGAGAGAGAGGGAGGGAAAGAGATTTGTCCTAGAAACAAAACTCGATCTATGTAACAATAAATGTTACTTTTATGAAATCACACTGCTGTTGCAAGGAAATGTTCTAAATATTCTTTATTCCAAATTAAGAAATAAATAAACATCAAAGGAGAAGAAATAGGAAGGATAATAATGATCTTTAAGTATTATAACAATGTTGAGT GGACAAATAACTT CAAGATAGTGAGTATAAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD141274             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTGAGTGGGACAAAT ACTTNCAAGATAGTGAGTATAAAGTATGTTTATTATGGAATAATAATAACAGTAATAATGATAATGAGTAATTAATTACAAATTACGAATAAGTATGTATGGGAGAAGACATTGTTGTATCGTTGATCTCTGTCACCTGATTTATTTATTCTCTGAGATGCCAGTGTGATTTTTGTCAACACTTGTTTGATGTATTGGAATGGAGTGAGGGAAATTTGTTTAAACGACAGGAGAAAGTTGCTTGATAAATGTTTGACTAAAATACGCCTATGGAAACAGTTATTGTTGACAATTTTAAACATCACTTCTCTGCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD081218             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGACTAAAATACGCCTATGGAAACAGTTATTGTTGACAATTTTCAACATCACTTCTCTGCATTAATCTTTCGATTGTATGACATATTTGTTTAGCCTTATCACAACGAATTCGTAATAGTGAAACCTGATTATAGCTTGTTTGTTGTTCATTAAAATTTAATGAAATTATTGAATCTTCAAATGATAAATCAATCAGTTGATCATAATTTAATTTTTTGATAATTTCACCTGATAAATTACGAACTGTTAAACATTTACCATAAATCTCTAAAATTGTTGCCTCGTTGGATACATTACTTAGTATTTCAATTTCATAAGATTGAAATACTTTTAATCTAGTCATAGGAGGAAGTAAATCAATTGAATTTCCATCCAAATATTTGACATTATCCAACAGACGACTAGTTATGGCAGCAAAATATGAACCAATACGACATCTTGCCAACAATCGACGCACGTGATTTACTAATATACCT]




>consensus_6744#0
GGAGAATTTATTTATGTATAAATGAGCATGGAACAATTATCCACAATATAAATGTGTATG
TATGTGAGGCAATCAAATTATATCACGAAAGAAGTGTGAAAATAAAATTAACAATATAAG
TACACATGTAAATGTAAATACACATGCAACTTAGGGAAAGTCTAAGTCTATATACGTATA
GAAGGAAGAAAAAATGTTTTCAAGAACGAGAGAGAGAGGGAGGGAAAGAGATTTGTCCTA
AAAACAAAACTCGATCTATGTAACAATAAATGTTACTTTTATGAAATCACACTGCTGTTG
CAAGGAAATGTTCTAAATATTCTTTATTCCAAATTAAGAAATAAATAAACATCAAAGGAG
AAGAAATAGGAAGGATAATAATGATCTTTAAGTATTATAACAATGTTGAGTGGACAAATA
ACTTCAAGATAGTGAGTATAAAGTATGTTTATTATGGAATAATAATAACAGTAATAATGA
TAATGAGTAATTAATTACAAATTACGAATAAGTATGTATGGGAGAAGACATTGTTGTATC
GTTGATCTCTGTCACCTGATTTATTTATTCTCTGAGATGCCAGTGTGATTTTTGTCAACA
CTTGTTTGATGTATTGGAATGGAGTGAGGGAAATTTGTTTAAACGACAGGAGAAAGTTGC
TTGATAAATGTTTGACTAAAATACGCCTATGGAAACAGTTATTGTTGACAATTTTAAACA
TCACTTCTCTGCATTAATCTTTCGATTGTATGACATATTTGTTTAGCCTTATCACAACGA
ATTCGTAATAGTGAAACCTGATTATAGCTTGTTTGTTGTTCATTAAAATTTAATGAAATT
ATTGAATCTTCAAATGATAAATCAATCAGTTGATCATAATTTAATTTTTTGATAATTTCA
CCTGATAAATTACGAACTGTTAAACATTTACCATAAATCTCTAAAATTGTTGCCTCGTTG
GATACATTACTTAGTATTTCAATTTCATAAGATTGAAATACTTTTAATCTAGTCATAGGA
GGAAGTAAATCAATTGAATTTCCATCCAAATATTTGACATTATCCAACAGACGACTAGTT
ATGGCAGCAAAATATGAACCAATACGACATCTTGCCAACAATCGACGCACGTGATTTACT
AATATACCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)