These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6750#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1233 fasta sequence [GCCANAATTTTGCACGAGGCAACAGGAGAGTGTTAATTTCAGTTTTCGTGAGGCATTTTAAAATTTGGAACCATTGGTGGTGGTGGTTGTCTAACCCCAAAAAATGAAAATATTCAAATAAATAAACCTGGACCTTTTGGTACACAATCACTTGGTTTGTTTTCTGGAATTTCACCTCAAAACACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACAACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTTTGGACCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTAACAGTTCTATTATCAGAACAACGTAAAAAAGAAATACATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGACAAAGAGTCAAACAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTCTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGTGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCACAGGATAGAACATTGT] [+] EMBL CD079596 [GCCANAATTTTGCACGAGGCAACAGGAGAGTGTTAATTTCAGTTTTCGTGAGGCATTTTAAAATTTGGAACCATTGGTGGTGGTGGTTGTCTAACCCCAAAAAATGAAAATATTCAAATAAATAAACCTGGACCTTTTGGTACACAATCACTTGGTTTGTTTTCTGGAATTTCACCTCAAAACACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATT ] [+] EMBL CD081387 [ TGTTTTCTGGAATTT ACCTCAAAA ACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTT ATATACCACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTNTGG ] [-] EMBL CD075220 [ AATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACAACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTTTGGACCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTAACAGTTCTATTATCAGAACAACGTAAAAAAGAAATACATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGACAAAGAGTCAAACAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTCTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGTGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCACAGGATAGAACATTGT] [-] EMBL CD076278 [ TAGTGAAGATTGGATAGATTGTTTACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACACCATTATTTACGATTAACTAAACCATTAATCGATTATTTTGGCCCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTACCAGTTCTATTATCAGACCAACGTAAAAAAGAAATCCATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGCCAAAGAGTTTACCAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTTTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGGGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCCCAGGATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||