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Schistosoma mansoni
cluster # 6750 cluster # 6750       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6750#0 length = 1233 sequences # 4  

consensusID : consensus_6750#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1233
fasta sequence
                              [GCCANAATTTTGCACGAGGCAACAGGAGAGTGTTAATTTCAGTTTTCGTGAGGCATTTTAAAATTTGGAACCATTGGTGGTGGTGGTTGTCTAACCCCAAAAAATGAAAATATTCAAATAAATAAACCTGGACCTTTTGGTACACAATCACTTGGTTTGTTTTCTGGAATTTCACCTCAAAACACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACAACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTTTGGACCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTAACAGTTCTATTATCAGAACAACGTAAAAAAGAAATACATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGACAAAGAGTCAAACAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTCTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGTGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCACAGGATAGAACATTGT]

[+] EMBL CD079596             [GCCANAATTTTGCACGAGGCAACAGGAGAGTGTTAATTTCAGTTTTCGTGAGGCATTTTAAAATTTGGAACCATTGGTGGTGGTGGTTGTCTAACCCCAAAAAATGAAAATATTCAAATAAATAAACCTGGACCTTTTGGTACACAATCACTTGGTTTGTTTTCTGGAATTTCACCTCAAAACACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD081387             [                                                                                                                                                             TGTTTTCTGGAATTT ACCTCAAAA ACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTATTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCGAATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAACTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGACTTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGCACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAATATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTT ATATACCACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTNTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075220             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCTTCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATCAATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATAGATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACAACATTATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTTTGGACCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTAACAGTTCTATTATCAGAACAACGTAAAAAAGAAATACATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGACAAAGAGTCAAACAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTCTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGTGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCACAGGATAGAACATTGT]
[-] EMBL CD076278             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAGTGAAGATTGGATAGATTGTTTACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACACCATTATTTACGATTAACTAAACCATTAATCGATTATTTTGGCCCCCAATTAATACCAAGTGTATGTAATTGTTTACCAGTTCTATTATCAGACCAACGTAAAAAAGAAATCCATTCAAATTCATCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATGAATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGCCAAAGAGTTTACCAAGGAAGGAAGGAAGGAAGAGTTTTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATATTAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGGGGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGGGCATGGTTACTATCAGTTGAGAAATGATCCCAGGATA         ]


>consensus_6750#0 GCCANAATTTTGCACGAGGCAACAGGAGAGTGTTAATTTCAGTTTTCGTGAGGCATTTTA AAATTTGGAACCATTGGTGGTGGTGGTTGTCTAACCCCAAAAAATGAAAATATTCAAATA AATAAACCTGGACCTTTTGGTACACAATCACTTGGTTTGTTTTCTGGAATTTCACCTCAA AACACTGATACAACAGATGCCGGTGTGATTCGTTCAAAACTATGGCCTTCTTCAGGTTTA TTCAATTTTGGTGATAGTGCAAACACAAAAAGAAATTTGTTTTCTCCACCAATTCTATCG AATAAGGCTGTTGGTCAAGTTGTTGATGAAAAGAAATTAGATGAGGATAAACTTAGACAA CTTTTAAATGATGCACTTTCTAATCCAAAACAAGAATCAAGTAGTAATCGTTTGATTGAC TTTCTTGGATCTACTGAATACTTTAAACAACCACCAATACATCCTGTTATAATGTTATGC ACACAAACAGCTTCACCAGAGAATATAGTTCGTTTAAGTTTAATATTATCACGTAGTAAT ATATGTCAAACAAATTCTGTATCTGGTACAATTATGCAATTAGCTATTGGTTTATTAGCT TCAATATTTACAGATATTTATAAAAAGAATACAGATAATTATCGTATTAGTTGTGCAATC AATTGTCTACTTGTTTATTTAGGTGCTATTAAACCAGAAAAAGATAGTGAAGATTGGATA GATTGTTCACCGACTACTACTACTACTAGTGGTAGTAATGTAAAATTTAATATACAACAT TATTTACGATTAACTAAAACATTAATCGATTATTTTGGACCCCAATTAATACCAAGTGTA TGTAATTGTTTAACAGTTCTATTATCAGAACAACGTAAAAAAGAAATACATTCAAATTCA TCATTAATTCATGGTACTCATTTACGAGATGATATTATTGATTCATTAGAGAAACAAATG AATTCAATGAATTTGAAGCGTTAAAAAAAGATGACAAAGAGTCAAACAAGGAAGGAAGGA AGGAAGAGTTCTTCTTTATTCTTTGCATTTCTAACTAGTCTTTTTTTATTATATGTATAT TAGATTGTGTATTGTAATTGGATTCAATCGAAAGAGTTTTATATAAAGAAAGTAGATAGG GGGTGATATTTTTTTTGGATAGTATATATGTATATGTGTGTATGTGTGCATGGTTACTAT CAGTTGAGAAATGATCACAGGATAGAACATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)