cluster # 6755

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Schistosoma mansoni
cluster # 6755 cluster # 6755 Sequences # 4 consensus # 2

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consensus_6755#0 length = 1204 sequences # 2

consensus_6755#1 length = 477 sequences # 2

consensusID : consensus_6755#0
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Sequences nbr = 2
consensus length = 1204
fasta sequence

                              [CGGCACCAGGAGTTATTACACACTGATATTGGGATTTATCCCACTTACTGATTACTTATGGTATAATACAAGGTTTCGGGTTTGGATTTGGTTATTCAGCTACTATAGCTGCATCAATTGCATGGTTTCAAAATCATCGAGGTTTAATTGTTGGCCTAATTGTTGGTGGCTTTGGGGCTGGTCCCATTATCTTTACACCGATTCAAACAATACATTAATCCAAATAATATCAAAATAGATGACAAAACAAAGCGATTTGAAGATGCTGATTTAATTAATCGTGTTCCTTCTGTGTTTCTACTTATTGGTGGTGTTTTGTTAGTTATCCAGTTAACTGGGTTATATCTGATGAGAGATAAACAAAAGAAGGTGGATCACGACCTCAAGGGTTCGGATAAGTCACATGAATTTCCACCTGTTATAAATTCAGTAAATTTACGACCTTTGGAATTATTGAAACAAAAAGAATTTTATTTTTTATGGATCATTATATTTTGTGCTGGAATACCTTTGACATCGTTGGCGACACTTTTCAAGCTCTTTGGTAAAACTCATATTAACGATGACAGATTTCTTGCTATTATGGGTGTCGTTGCGGCTGTATTCAATTCTGTTGGACGTGCTTTCTGGGGTGCTATCAGTGATCGTATTTCGTTCAAGGTTCCATTGTGCATCATACTTTTATGCTGGTCACTTTTACTAACTTCATTCCCACTTTTACCGTTGATATTTGGGCCTC-AATCAAAGTTGGTTTTGGTATTTGGTTATGTGGTCTTTATTTATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTTTGCACCACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAATTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGCTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTACTATGTGCTGCATGTGTATTTTAGCTTATTAATTGTCCCTGGATACTGATANGAAAATGCCAAATATTTCAGCTTGTTTCCACTTTATCCGCCAAGCCCAGTTGAATTCTCTAATAACTTGTCACCAGTGCTGTTATCTGAAAATTTCATAGTTTTTACCAAGACACAAACTTTCTTTATTAGTGCATTCAAAATAATTTACCTGACACTGCCAAATAAAACATTTTTTTAAATAACAGTTGAAAAAATG]

[+] EMBL CD081496             [CGGCACCAGGAGTTATTACACACTGATATTGGGATTTATCCCACTTACTGATTACTTATGGTATAATACAAGGTTTCGGGTTTGGATTTGGTTATTCAGCTACTATAGCTGCATCAATTGCATGGTTTCAAAATCATCGAGGTTTAATTGTTGGCCTAATTGTTGGTGGCTTTGGGGCTGGTCCCATTATCTTTACACCGATTCAAACAATACATTAATCCAAATAATATCAAAATAGATGACAAAACAAAGCGATTTGAAGATGCTGATTTAATTAATCGTGTTCCTTCTGTGTTTCTACTTATTGGTGGTGTTTTGTTAGTTATCCAGTTAACTGGGTTATATCTGATGAGAGATAAACAAAAGAAGGTGGATCACGACCTCAAGGGTTCGGATAAGTCACATGAATTTCCACCTGTTATAAATTCAGTAAATTTACGACCTTTGGAATTATTGAAACAAAAAGAATTTTATTTTTTATGGATCATTATATTTTGTGCTGGAATACCTTTGACATCGTTGGCGACACTTTTCAAGCTCTTTGGTAAAACTCATATTAACGATGACAGATTTCTTGCTATTATGGGTGTCGTTGCGGCTGTATTCAATTCTGTTGGACGTGCTTTCTGGGGTGCTATCAGTGATCGTATTTCGTTCAAGGTTCCATTGTGCATCATACTTTTATGCTGGTCACTTTTACTAACTTCATTCCCACTTTTACCGTTGATATTTGGGCCTC AATCAAAGTTGGTTTTGGTATTTGGTTATGTGGTCTTTATTTATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTTTGCACCACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAATTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGCTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTACTATGTGCTGCATGTGTATTTTAGCTTATTAATTGTCCCTGGATACTGATANGAAAATGCCAAATATTTCAGCTTGTTTCCACTTTATCCGCCAAGCCCAGTTGAATTCTCTAATAACTTGTCACCAGTGCTGTTATCTGAAAATTTCATAGTTTTTACCAAGACACAAACTTTCTTTATTAGTGCATTCAAAATAATTTACCTGACACTGCCAAATAAAACATTTTTTTAAATAACAGTTGAAAAAATG]
[+] EMBL CD085809             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTATGGATCATTATATTTTGTGCTGGAATACCTTTGACATCGTAGGCGACACTTTTCAAGCTCTTTGGTAAAACTCATATTAACGATGACAGATTTCTTGCTATTATGGGTGTCGTTGCGGCTGTATTCAATTCTGTTGGACGTGCTTTCTGGGGTGCTATCAGTGATCGTATTTCGTTCAAGGTTCCATTGTGCATCATACTTTCATGCTGGTCACTTTTACTAACTTCATTCCCACATTTACCGTTGATATTTGGGCCTCAAATCAAA  TGGTgtgcttgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]




>consensus_6755#0
CGGCACCAGGAGTTATTACACACTGATATTGGGATTTATCCCACTTACTGATTACTTATG
GTATAATACAAGGTTTCGGGTTTGGATTTGGTTATTCAGCTACTATAGCTGCATCAATTG
CATGGTTTCAAAATCATCGAGGTTTAATTGTTGGCCTAATTGTTGGTGGCTTTGGGGCTG
GTCCCATTATCTTTACACCGATTCAAACAATACATTAATCCAAATAATATCAAAATAGAT
GACAAAACAAAGCGATTTGAAGATGCTGATTTAATTAATCGTGTTCCTTCTGTGTTTCTA
CTTATTGGTGGTGTTTTGTTAGTTATCCAGTTAACTGGGTTATATCTGATGAGAGATAAA
CAAAAGAAGGTGGATCACGACCTCAAGGGTTCGGATAAGTCACATGAATTTCCACCTGTT
ATAAATTCAGTAAATTTACGACCTTTGGAATTATTGAAACAAAAAGAATTTTATTTTTTA
TGGATCATTATATTTTGTGCTGGAATACCTTTGACATCGTTGGCGACACTTTTCAAGCTC
TTTGGTAAAACTCATATTAACGATGACAGATTTCTTGCTATTATGGGTGTCGTTGCGGCT
GTATTCAATTCTGTTGGACGTGCTTTCTGGGGTGCTATCAGTGATCGTATTTCGTTCAAG
GTTCCATTGTGCATCATACTTTTATGCTGGTCACTTTTACTAACTTCATTCCCACTTTTA
CCGTTGATATTTGGGCCTCAATCAAAGTTGGTTTTGGTATTTGGTTATGTGGTCTTTATT
TATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTTTGCACCACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAAT
TAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGCTCGT
CTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTACTATGT
GCTGCATGTGTATTTTAGCTTATTAATTGTCCCTGGATACTGATANGAAAATGCCAAATA
TTTCAGCTTGTTTCCACTTTATCCGCCAAGCCCAGTTGAATTCTCTAATAACTTGTCACC
AGTGCTGTTATCTGAAAATTTCATAGTTTTTACCAAGACACAAACTTTCTTTATTAGTGC
ATTCAAAATAATTTACCTGACACTGCCAAATAAAACATTTTTTTAAATAACAGTTGAAAA
AATG

consensusID : consensus_6755#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 477
fasta sequence

                              [CTTTATTTATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTNTGCACCAACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAATTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGTTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTATCTATGTGCTGCAATGTGTATTTTAGCTTTATTAATTGTACCATGGATACATGATAGGAAAATGCCCAAATATTTCAGCTTGTTTCGACTTTATCGGCAAAGCCACAGTTGAATTCTCCTAATAACTTGTTCAACAAGTGCTGTTATCCTGAAAAATTATCATAGTTTTTTAGCAGAGAAACACAAAACTTATCTTTCATTAGTGTCATTTCAAAAATATAATTTCACCTGAACAAATGCACAGAATTAATAACATCGTTTTATAAAATTAGCATGTCTGAGAAAATACATGATC]

[-] EMBL CD075320             [CTTTATTTATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTNTGCACCAACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAATTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGTTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTATCTATGTGCTGCAATGTGTATTTTAGCTTTATTAATTGTACCATGGATACATGATAGGAAAATGCCCAAATATTTCAGCTTGTTTCGACTTTATCGGCAAAGCCACAGTTGAATTCTCCTAATAACTTGTTCAACAAGTGCTGTTATCCTGAAAAATTATCATAGTTTTTTAGCAGAGAAACACAAAACTTATCTTTCATTAGTGTCATTTCAAAAATATAATTTCACCTGAACAAATGCACAGAATTAATAACATCGTTTTATAAAATTAGCATGTCTGAGAAAATACATGATC]
[+] EMBL CD077476             [                                                                                             GTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGTTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTATCTATGTGCTGCAATGTGTATTTTAGCTTTATTAATTGTACCA                                                                                                                                                                                                                                                            ]




>consensus_6755#1
CTTTATTTATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTNTGCACCAACTGCTACAGAAACCTTATTT
GGATCAATTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGT
CTGTTCGTCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTT
TATCTATGTGCTGCAATGTGTATTTTAGCTTTATTAATTGTACCATGGATACATGATAGG
AAAATGCCCAAATATTTCAGCTTGTTTCGACTTTATCGGCAAAGCCACAGTTGAATTCTC
CTAATAACTTGTTCAACAAGTGCTGTTATCCTGAAAAATTATCATAGTTTTTTAGCAGAG
AAACACAAAACTTATCTTTCATTAGTGTCATTTCAAAAATATAATTTCACCTGAACAAAT
GCACAGAATTAATAACATCGTTTTATAAAATTAGCATGTCTGAGAAAATACATGATC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6755#0      CGGCACCAGGAGTTATTACACACTGATATTGGGATTTATCCCACTTACTGATTACTTATG 60
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      GTATAATACAAGGTTTCGGGTTTGGATTTGGTTATTCAGCTACTATAGCTGCATCAATTG 120
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      CATGGTTTCAAAATCATCGAGGTTTAATTGTTGGCCTAATTGTTGGTGGCTTTGGGGCTG 180
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      GTCCCATTATCTTTACACCGATTCAAACAATACATTAATCCAAATAATATCAAAATAGAT 240
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      GACAAAACAAAGCGATTTGAAGATGCTGATTTAATTAATCGTGTTCCTTCTGTGTTTCTA 300
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      CTTATTGGTGGTGTTTTGTTAGTTATCCAGTTAACTGGGTTATATCTGATGAGAGATAAA 360
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      CAAAAGAAGGTGGATCACGACCTCAAGGGTTCGGATAAGTCACATGAATTTCCACCTGTT 420
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      ATAAATTCAGTAAATTTACGACCTTTGGAATTATTGAAACAAAAAGAATTTTATTTTTTA 480
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      TGGATCATTATATTTTGTGCTGGAATACCTTTGACATCGTTGGCGACACTTTTCAAGCTC 540
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      TTTGGTAAAACTCATATTAACGATGACAGATTTCTTGCTATTATGGGTGTCGTTGCGGCT 600
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      GTATTCAATTCTGTTGGACGTGCTTTCTGGGGTGCTATCAGTGATCGTATTTCGTTCAAG 660
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      GTTCCATTGTGCATCATACTTTTATGCTGGTCACTTTTACTAACTTCATTCCCACTTTTA 720
consensus_6755#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6755#0      CCGTTGATATTTGGGCCTCAATCAAAGTTGGTTTTGGTATTTGGTTATGTGGTCTTTATT 780
consensus_6755#1      -----------------------------------------------------CTTTATT 7
                                                                           *******

consensus_6755#0      TATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTTTGCACCA-CTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAA 839
consensus_6755#1      TATTAATTAGTGGTGTGCTTGTCTNTGCACCAACTGCTACAGAAACCTTATTTGGATCAA 67
                      ************************ ******* ***************************

consensus_6755#0      TTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGCTCG 899
consensus_6755#1      TTAATATGGCTGTAAACTACGGATTAGTTTTCAATGCTTTTGTATTCGGTGGTCTGTTCG 127
                      ******************************************************** ***

consensus_6755#0      TCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTA-CTAT 958
consensus_6755#1      TCTCACTATTGTCCATCGTAACTCCACAGTTTCATGAATGGGATAATCTATTTTATCTAT 187
                      ******************************************************* ****

consensus_6755#0      GTGCTGCA-TGTGTATTTTAGCTT-ATTAATTGTCCC-TGGATAC-TGATANGAAAATGC 1014
consensus_6755#1      GTGCTGCAATGTGTATTTTAGCTTTATTAATTGTACCATGGATACATGATAGGAAAATGC 247
                      ******** *************** ********* ** ******* ***** ********

consensus_6755#0      C-AAATATTTCAGCTTGTTTCCACTTTATCCGCCAAGCC-CAGTTGAATTCTC-TAATAA 1071
consensus_6755#1      CCAAATATTTCAGCTTGTTTCGACTTTATCGGCAAAGCCACAGTTGAATTCTCCTAATAA 307
                      * ******************* ******** ** ***** ************* ******

consensus_6755#0      CTTGTC--ACCAGTGCTGTTATC-TGAAAATTT--CATAGTTTTT----ACCAAGACACA 1122
consensus_6755#1      CTTGTTCAACAAGTGCTGTTATCCTGAAAAATTATCATAGTTTTTTAGCAGAGAAACACA 367
                      *****   ** ************ ****** **  **********    *   * *****

consensus_6755#0      AACTTT---CTTTATTAGTG-CATTCAAAA----TAATTT-ACCTGAC--ACTGCC---A 1168
consensus_6755#1      AAACTTATCTTTCATTAGTGTCATTTCAAAAATATAATTTCACCTGAACAAATGCACAGA 427
                      **  **    ** ******* ****  ***    ****** ******   * ***    *

consensus_6755#0      AATAA-AACATTTTTTTAAATAACAG------TTGAAAAAATG------- 1204
consensus_6755#1      ATTAATAACATCGTTTTATAAAATTAGCATGTCTGAGAAAATACATGATC 477
                      * *** *****  ***** * **          *** *****