These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6769#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 870 fasta sequence [AAACCTTTTTTTTTTGGACTAATTTCATCTTGTAATCTG-AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA-GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAAAATATATTTAATTGGTTCTTATTCATCACTATTTTGAAATAGCTCGTCTTGCATTAATTTCTCACCAACTTTTCGCGAATACACCACCGGTCCCATTCAAATTTGATTTTACGCCCTGATTACTATCATCCGACAGTTTTCTCTTCATTTCTGCAGGATTTTTATGCCAAGTTTTGGGTGTGAAAGTTGGTGCTGCGCTCATTGCGCGTAATCTATCCGTTGACATCGGTTTAGCAACTTTACGAAGAATTGGTTTTTGAAAGTGGCCTTTAATT] [+] EMBL CD075511 [AAACCTTTTTTTTTTGGACTAATTTCATCTTGTAATCTGCAATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGGTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAAGGGGAAAATA ] [+] EMBL CD077287 [ acaATCTTGTAATCTG AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAA ] [+] EMBL AA999433 [ ATCTTGTAATCTG AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGTTATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAGACATAAGTGCTTATGCAGTT ] [-] EMBL CD194178 [ TTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAAAATATATTTAATTGGTTCTTATTCATCACTATTTTGAAATAGCTCGTCTTGCATTAATTTCTCACCAACTTTTCGCGAATACACCACCGGTCCCATTCAAATTTGATTTTACGCCCTGATTACTATCATCCGACAGTTTTCTCTTCATTTCTGCAGGATTTTTATGCCAAGTTTTGGGTGTGAAAGTTGGTGCTGCGCTCATTGCGCGTAATCTATCCGTTGACATCGGTTTAGCAACTTTACGAAGAATTGGTTTTTGAAAGTGGCCTTTAATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||