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Schistosoma mansoni
cluster # 6769 cluster # 6769       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6769#0 length = 870 sequences # 4  

consensusID : consensus_6769#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 870
fasta sequence
                              [AAACCTTTTTTTTTTGGACTAATTTCATCTTGTAATCTG-AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA-GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAAAATATATTTAATTGGTTCTTATTCATCACTATTTTGAAATAGCTCGTCTTGCATTAATTTCTCACCAACTTTTCGCGAATACACCACCGGTCCCATTCAAATTTGATTTTACGCCCTGATTACTATCATCCGACAGTTTTCTCTTCATTTCTGCAGGATTTTTATGCCAAGTTTTGGGTGTGAAAGTTGGTGCTGCGCTCATTGCGCGTAATCTATCCGTTGACATCGGTTTAGCAACTTTACGAAGAATTGGTTTTTGAAAGTGGCCTTTAATT]

[+] EMBL CD075511             [AAACCTTTTTTTTTTGGACTAATTTCATCTTGTAATCTGCAATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGGTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAAGGGGAAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD077287             [                       acaATCTTGTAATCTG AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTATGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAATTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTACAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AA999433             [                          ATCTTGTAATCTG AATTTATGAGTTTATATATGTGGTACAGGAACGAAAGGTTATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACTCATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGAATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGTTAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAGACATAAGTGCTTATGCAGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD194178             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTGGAGAAAAAAAATGTATAATAAA GGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCTTTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAAAATATATTTAATTGGTTCTTATTCATCACTATTTTGAAATAGCTCGTCTTGCATTAATTTCTCACCAACTTTTCGCGAATACACCACCGGTCCCATTCAAATTTGATTTTACGCCCTGATTACTATCATCCGACAGTTTTCTCTTCATTTCTGCAGGATTTTTATGCCAAGTTTTGGGTGTGAAAGTTGGTGCTGCGCTCATTGCGCGTAATCTATCCGTTGACATCGGTTTAGCAACTTTACGAAGAATTGGTTTTTGAAAGTGGCCTTTAATT]


>consensus_6769#0 AAACCTTTTTTTTTTGGACTAATTTCATCTTGTAATCTGAATTTATGAGTTTATATATGT GGTACAGGAACGAAAGGATATACACTTTAAAATTATATAGCCCACCTGAGAGAAACAACT CATCACTTAAAGTCACACCACCAAATATTTATAAATTCATTTAATTAATCGAAAGGATGA ATAAGGTTAATCAAAGGGTTGTTGGCAAAATAATTGAAGTATTTCACAAAGTATATGAGT TAAAGAATAAAATGAATGATGTTGATAGTCTTTTAAAATGACAAAAAAAATAAGTGCTTA TGCAGTTATTCAATCACAACATTTGAATGGAAATTATAAAATAGACAAGAAAAGTTAAAA TTACATTCATTTTCTCTGGTATAAAAGTATCCATATATAATGGATTCTCTATAATCTCTA CAATTTAAAAGTTACAATACATGCTCATATGATTAAATTGTAGGTGATTTTTCTGCTCTG GAGAAAAAAAATGTATAATAAAGGGAAAATAAGGAAATGAATGTAATATTATTGTTGTCT TTATGGTTGTTATTTTTATTTGGCTTCCAATAAGGTAAATGAATAACAGATAAAAAATAT ATTTAATTGGTTCTTATTCATCACTATTTTGAAATAGCTCGTCTTGCATTAATTTCTCAC CAACTTTTCGCGAATACACCACCGGTCCCATTCAAATTTGATTTTACGCCCTGATTACTA TCATCCGACAGTTTTCTCTTCATTTCTGCAGGATTTTTATGCCAAGTTTTGGGTGTGAAA GTTGGTGCTGCGCTCATTGCGCGTAATCTATCCGTTGACATCGGTTTAGCAACTTTACGA AGAATTGGTTTTTGAAAGTGGCCTTTAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)