Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6781 cluster # 6781       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6781#0 length = 700 sequences # 4  

consensusID : consensus_6781#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 700
fasta sequence
                              [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATTAACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGAT-CATTCCACAAAATATTCTGATGGCGATAAATGAGAATTATAAATGGAGAACAAAAAAGATAACAATGCAATGATGGGTGCAGATCACAAAATTGTCAAGCTATCAGACTATGTAGACTCTCTGGACTTCTGAGGCTTCAAATGTTTTCCCTGAACGAGGACATGTTATTGTTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAATATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTAACTATCCACTCCTCCTGT]

[+] EMBL CD075635             [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATTAACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGAT CATTCCACAAAATATTCTGATGGCGATAAATGAGAATTATAAATGGAGAACAAAAAAGATAACAATGCAATGATGGGTGCAGATCACAAAATTGTCAAGCTATCAGACTATGTAGACTCTCTGGACTTCTGAGGCTTCAAATGTTTTCCCTGAACGAGGACATGTTATTGTTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCAT                                                                                         ]
[+] EMBL AA999499             [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATT ACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGTTATATTCCCCATAATATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD086087             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAATATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTAACTATCCACTCCTCCTGT]
[-] EMBL CD086215             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAACATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTA                  ]


>consensus_6781#0 TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAA TACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATTAA CGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGAT GAAAGATAAGATCATTCCACAAAATATTCTGATGGCGATAAATGAGAATTATAAATGGAG AACAAAAAAGATAACAATGCAATGATGGGTGCAGATCACAAAATTGTCAAGCTATCAGAC TATGTAGACTCTCTGGACTTCTGAGGCTTCAAATGTTTTCCCTGAACGAGGACATGTTAT TGTTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGG TAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATAT AGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACA AACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGT AATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAATATTGTAAGCATAAAATTCCAT AAGTACTTCATGAGTCCGTTTAACTATCCACTCCTCCTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)