These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6781#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 700 fasta sequence [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATTAACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGAT-CATTCCACAAAATATTCTGATGGCGATAAATGAGAATTATAAATGGAGAACAAAAAAGATAACAATGCAATGATGGGTGCAGATCACAAAATTGTCAAGCTATCAGACTATGTAGACTCTCTGGACTTCTGAGGCTTCAAATGTTTTCCCTGAACGAGGACATGTTATTGTTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAATATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTAACTATCCACTCCTCCTGT] [+] EMBL CD075635 [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATTAACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGAT CATTCCACAAAATATTCTGATGGCGATAAATGAGAATTATAAATGGAGAACAAAAAAGATAACAATGCAATGATGGGTGCAGATCACAAAATTGTCAAGCTATCAGACTATGTAGACTCTCTGGACTTCTGAGGCTTCAAATGTTTTCCCTGAACGAGGACATGTTATTGTTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCAT ] [+] EMBL AA999499 [TCGGAAGTGGCAGTCTTTATTTAGATTTTCTTGGTATGAAGTTGTACTCAATAATTACAATACATAGCAATGCGGTTAATTTAATGTATACAACTCATAGAAATCATTTGTAAATATT ACGATGTACATGAAAAAACTTTGTACATACCTTGGGTAATTACAATTACCAACCAAAAGATGAAAGATAAGTTATATTCCCCATAATATTC ] [-] EMBL CD086087 [ TTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAATATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTAACTATCCACTCCTCCTGT] [-] EMBL CD086215 [ TTCCATCTGGACGTGTTAACTCAGCGATACCCTTCTGGCTGTAAACATAGCCATTTGGTAATGACATTGGGGGATTTTCATCATTCATAGGAAGGCCAGTTTTGTAACACGTTAATATAGAATGATCATGACGAGCGAATGGTAAATTCACTGCCAATAGGTTGATTAATGGATGACAAACAGCACAGTCTCGATGTTGAGTATTTGGGTTGTAACAGTAATGAGTCTTAATTGCTGTAATTCCAGCATTAACAGCCAGTTGAAATGGAGTGTTAACATTGTAAGCATAAAATTCCATAAGTACTTCATGAGTCCGTTTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||