These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6784#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 653 fasta sequence [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT-AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAACTCTTCAAATATTCTACAGGTTTATATTAGTGAACTAAACAYGCGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTACTACATTCTATGCATATCGTACTATTACGGAGTAATACAAACATTCATTATGAAGAATA] [+] EMBL AI976013 [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGTGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAA ] [+] EMBL CD076783 [AGCAATATTCTCAATAATTTAAAACATTAATTTGCATATAATAGAAAACTTTCTAATGATTATGAGATACCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACGCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAGAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGTGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATATTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGAAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAAT ] [+] EMBL CD075675 [ TTAAAACATTAATTTGCATATAATAAAAAACTTTCTAATGATTATGAAATCCCATAAGGAATTTGCTAAAGTTTAAATAACTACCCTTGATTATATTTTTGGGCTAATTTTTCTAAAAAAATTGTACTCTGTTTAAAGTTCATTGTAAATTGGTAAATATTTATATTTAACGTATGAGTCATATGAAAAGCGTTTACTTCAAAATTCGAATAACAATTTATAGGGTTAACAAACGTTTTGAGTAATACATTAAAACTATAGCAAAAAACTGAATACAATACAAAAGGATTAATCTTAAAAGGAT AAAAACTATTTTGTTGTAATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGT GTA AAGGAAA ] [-] EMBL AW061627 [ GTTT AAG TCA TGTAAA TGGTAAATA TTATATTTAACG ATGAGTCATATG AGAGCG TTACTTCAAAA TCGGATAACAA TTATA TGTTAACAAACG TTTGAGTAATACA TAAAACTATAGC GAAAACTGAATACAATACAAAAGGGTT ATCTTAAAAGGATAAAAAACTATATTGTTGTTATAAAACAAAATGGATTTACTTTACTGACAAAGGAGTACACCGATGTCACGTATGTGTGAATAAATAACAGAAGTAGTAGAAGGGAAATAAGTTATGAGACTATGTATACACACATACATATTCTTAATTATAAATTTAAGGATAGCAATTTACTAAATTGTTAACTCTTCAAATATTCTACAGGTTTATATTAGTGAACTAAACAYGCGAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGTACTACATTCTATGCATATCGTACTATTACGGAGTAATACAAACATTCATTATGAAGAATA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||