These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6786#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 897 fasta sequence [GAGGACCAATATGCTTCCCGATGTTGAAAATAAACGTTTGTTTTCATGTATAGTATCTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGANAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATTAGTTCACCACCACNCACCACCACCACCAATATCACATACTTCTATATTAAATGAACCAAATTATTATACAGAACCACGTTATATACCTGATCTACCACAATCAGCATTAAGTTATATTGATAGTTCAAATAAAAATTGGCATATAAAAGATTCTGAAATTACACATAATTTAAATAAACAAAATGATCATTTTAATAATTCAACAAATTCATATTTGAATACTTGATCTTATTGAA] [+] EMBL CD082085 [GAGGACCAATATGCTTCCCGATGTTGAAAATAAACGTTTGTTTTCATGTATAGTATCTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGANAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATT ] [+] EMBL CD083866 [ acgaggcTCCCGATGTTGAAAATAAACG TTGTTTTCATGTATAGTATTTTTTACTGCTTTCGGATTTTGCTCAAACTTCATTTCTTTTGTCTCACCTTATTGGATCCAGTCAGTTCCAGAAGCTAACAGCCAATTCCAGAGAATAGGTCTTTGGACTGTTTGTTTTGATGGATATATGCGACCTGGGTTATATGATAAGGCATATTTCGGCTGCTACTACATTTATTATGTGATCTATGACCGTATAAGAGATTGGCTAAATCCAATATGGTTATATACAATACAAGTTACTTCATCTTGTGGAGTTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAA ] [-] EMBL CD075700 [ TTTTGGTACAGTTTTTGGTAATGTTTATCGTCCTGAGTCAAGTAGCCGGTGCAATTTCTAAATCTGACCTCAAAAGTCTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATTTATCGGTTTCATAATAAGTTTTATTACATATATTAAATTGAGTGATTTAATGAATCAACAGAATACAAATGAAAATCTACTAAATGATGAAGAGAAAATGGGTATTAGTTCACCACCACNCACCACCACCACCAATATCACATACTTCTATATTAAATGAACCAAATTATTATACAGAACCACGTTATATACCTGATCTACCACAATCAGCATTAAGTTATATTGATAGTTCAAATAAAAATTGGCATATAAAAGATTCTGAAATTACACATAATTTAAATAAACAAAATGATCATTTTAATAATTCAACAAATTCATATTTGAATACTTGATCTTATTGAA] [-] EMBL CD168397 [ AAAAGTGTAAGATTTATCGCTTCAGGACATTTCTTCACAAGTTTAACACTAGCTGCTGCATTAGTAGCATTTGCTGTAGCTAGATATGATAGTCGTTGGATGCCTTATCCTGAATTGAATACATTATCATGGTCTTATGCTTTCGGAGTTTTAAGTTTTATTTGTACATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||