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Schistosoma mansoni
cluster # 6788 cluster # 6788       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6788#0 length = 1369 sequences # 4  
consensusID : consensus_6788#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1369
fasta sequence 
                              [GGCATTATCTATTCTCTTGTTTAAAAATCTTTATATTCAAATTAGAGGAATACCAAATACTGAAGTGAGTAGCATAAAAATGAAATAAAACGTTTAATAAGATTAATAACTCAACTCATTTGTTATA-CGTTCTAACAAAACAGTTAAAATATTCATTAATATAATAAGATTAAGTTATAGGGTATCAAACTCTGTCATAAGTGAGGAGTACGACAGATAGGTAGATTGAATATGCAAGAAATTATAAAGAAAGAATGATAGAGAGGAGTAGGTAGTATAAGCATATAGTTATTTGTGTATTTATGTGGATGGGTACATAAGCAACTGAAAGTAAATGGGGAAATAAACAAATCGAATAATCTAAACAAGGACAGTACTCATTGCGGCCGGTTATAGATTAAAGGACAGCTGTTATATATATCTTTTGACAGTTTTTTATTTTATTTTATGTTTTACCCAGTCTGTTGAACATTGTGTTGATTAGTTTAACTGAAAATACGAAGTGCCTCTATAATCCTTAGTATGTAGTAGGTTAAATATA-TCTAAAAGATTGTGCTTTTAGCCGTTAGTTCATTATGTATATTCAATGTTCCAATGCTTCTTACCACCTTACAAACTGTTCAATTTAATTCATTGGGTTTTTTTATTCTATTCAAATCTGTTAAGGATTGCGTTCTGTACATTTTCGTCAATCTTTTTATGGCATAGATGTAAATTATAATGACTGACGTCAAGGTAATAACGATCATGTGCAATACAAAAAAGGTTATGGTTTGTCGTTTAGTGAATTGACAATGCAAATGAAAAACGTTAATGAATAAATAGGACACGGAGATACATACTCACACGCATGTTACACAACAGAGAATAGTTAGGTTATATGTATCCCATGAACAAACACTAGAGCATGGATAAAACGACGAATAGGTTATTGTGACTAAAAATATGGAAGACATAAATAAAAAACTAACAATACATAGTTACTATTACGATACTAATATCATTGTGTACTGATAATAACAATGAAAGCATTAATGATTATGATTATCACGTAGCAAATTATTATTAAGTCTATCTATCTATATATATAAATGACAAAATGTTGCATAAAATAACTCTATTCCCTGTAAACTTGATTTTCTGACGAAAGAAAAAGAGAAAAATAAAACCAGTTCATTGAATTTGCAGTTTGCCCAAATCGAAATTTCACTGGTCGCCAACCAGA-TCAGTCTGTATTATTTAGACGATTTGCTTCGATTGTGTTACTACCATTATTATTATTATTACCAATAGTAATATTAGAATTGTTATTCATTTGTCCAAAGGGTGTAATTGTGTTTGAACTCATTGGTATAAATGGCTTTGGTGT]

[+] EMBL CD075750             [GGCATTATCTATTCTCTTGTTTAAAAATCTTTATATTCAAATTAGAGGAATACCAAATACTGAAGTGAGTAGCATAAAAATGAAATAAAACGTTTAATAAGATTAATAACTCAACTCATTTGTTATA CGTTCTAACAAAACAGTTAAAATATTCATTAATATAATAAGATTAAGTTATAGGGTATCAAACTCTGTCATAAGTGAGGAGTACGACAGATAGGTAGATTGAATATGCAAGAAATTATAAAGAAAGAATGATAGAGAGGAGTAGGTAGTATAAGCATATAGTTATTTGTGTATTTATGTGGATGGGTACATAAGCAACTGAAAGTAAATGGGGAAATAAACAAATCGAATAATCTAAACAAGGACAGTACTCATTGCGGCCGGTTATAGATTAAAGGACAGCTGTTATATATATCTTTTGACAGTTTTTTATTTTATTTTATGTTTTACCCAGTCTGTTGAACATTGTGTTGATTAGTTTAACTGAAAATACGAAGTGCCTCTATAATCCTTAGTATGTAGTAGGTTAAATATATTCTAAAAGATTGTGCTTTTAGCCGTTAGTTCATTATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL SMAA40625            [                                                                                                                        tnTTATACCGTTCTAACAAAACAGTTAAAATATTCATTAATATAATAAGATTANGTTATAGGGTATCAAACTCTGTCATAAGTGAGGAGTACGACAGATAGGTAGATTGAATATGCAAGAAATTATAAAGAAAGAATGATAGAGAGGAGTAGGTAGTATAAGCATATAGTTATTTGTGTATTTATGTGGATGGGTACATAAGCAACTGAAAGTAAATGGGGAAATAAACAAATCGAATAATCTAAACAAGGACAGTACTCATTGCGGCCGGTTATAGATTAAAGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD082135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTANATATA TCTAAAAGATTGTGCTTTTAGCCGTTAGTTCATTATGTATATTCAATGTTCCAATGCTTCTTACCACCTTACAAACTGTTCAATTTAATTCATTGGGTTTTTTTATTCTATTCAAATCTGTTAAGGATTGCGTTCTGTACATTTTCGTCAATCTTTTTATGGCATAGATGTAAATTATAATGACTGACGTCAAGGTAATAACGATCATGTGCAATACAAAAAAGGTTATGGTTTGTCGTTTAGTGAATTGACAATGCAAATGAAAAACGTTAATGAATAAATAGGACACGGAGATACATACTCACACGCATGTTACACAACAGAGAATAGTTAGGTTATATGTATCCCATGAACAAACACTAGAGCATGGATAAAACGACGAATAGGTTATTGTGACTAAAAATATGGAAGACATAAATAAAAAACTAACAATACATAGTTACTATTACGATACTAATATCATTGTGTACTGATAATAACAATGAAAGCATTAATGATTATGATTATCACGTAGCAAATTATTATTAAGTCTATCTATCTATATATATAAATGACAAAATGTTGCATAAAATAACTCTATTCCCTGTAAACTTGATTTTCTGACGAAAGAAAAAGAGAAAAATAAAACCAGTTCATTGAATTTGCAGTTTGCCCAAATCGAAATTTCACTGGTCGCCAACCAGA TCAGTC                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD130748             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAAACTGTTCAATTTAATTCATTGGGTTTTTTTATTCTATTCAAATCTGTTAAGGATTGCGTTCTGTACATTTTCGTCAATCTTTTTATGGCATAGATGTAAATTATAATGACTGACGTCAAGGTAATAACGATCATGTGCAATACAAAAAAGGTTATGGTTTGTCGTTTAGTGAATTGACAATGCAAATGAAAAACGTTAATGAATAAATAGGACACGGAGATACATACTCACACGCATGTTACACAACAGAGAATAGTTAGGTTATATGTATCCCATGAACAAACACTAGAGCATGGATAAAACGACGAATAGGTTATTGTGACTAAAAATATGGAAGACATAAATAAAAAACTAACAATACATAGTTACTATTACGATACTAATATCATTGTGTACTGATAATAACAATGAAAGCATTAATGATTATGATTATCACGTAGCAAATTATTATTAAGTCTATCTATCTATATATATAAATGACAAAATGTTGCATAAAATAACTCTATTCCCTGTAAACTTGATTTTCTGACGAAAGAAAAAGAGAAAAATAAAACCAGTTCATTTAATTTGCAGTTTGCCCAATTCGAAATTTCACTGGTCGCCAACCAGATTCACT TGTATTATTTAGACGATTTGCTTCGATTGTGTTACTACCATTATTATTATTATTACCAATAGTAATATTAGAATTGTTATTCATTTGTCCAAAGGGTGTAATTGTGTTTGAACTCATTGGTATAAATGGCTTTGGTGT]




>consensus_6788#0
GGCATTATCTATTCTCTTGTTTAAAAATCTTTATATTCAAATTAGAGGAATACCAAATAC
TGAAGTGAGTAGCATAAAAATGAAATAAAACGTTTAATAAGATTAATAACTCAACTCATT
TGTTATACGTTCTAACAAAACAGTTAAAATATTCATTAATATAATAAGATTAAGTTATAG
GGTATCAAACTCTGTCATAAGTGAGGAGTACGACAGATAGGTAGATTGAATATGCAAGAA
ATTATAAAGAAAGAATGATAGAGAGGAGTAGGTAGTATAAGCATATAGTTATTTGTGTAT
TTATGTGGATGGGTACATAAGCAACTGAAAGTAAATGGGGAAATAAACAAATCGAATAAT
CTAAACAAGGACAGTACTCATTGCGGCCGGTTATAGATTAAAGGACAGCTGTTATATATA
TCTTTTGACAGTTTTTTATTTTATTTTATGTTTTACCCAGTCTGTTGAACATTGTGTTGA
TTAGTTTAACTGAAAATACGAAGTGCCTCTATAATCCTTAGTATGTAGTAGGTTAAATAT
ATCTAAAAGATTGTGCTTTTAGCCGTTAGTTCATTATGTATATTCAATGTTCCAATGCTT
CTTACCACCTTACAAACTGTTCAATTTAATTCATTGGGTTTTTTTATTCTATTCAAATCT
GTTAAGGATTGCGTTCTGTACATTTTCGTCAATCTTTTTATGGCATAGATGTAAATTATA
ATGACTGACGTCAAGGTAATAACGATCATGTGCAATACAAAAAAGGTTATGGTTTGTCGT
TTAGTGAATTGACAATGCAAATGAAAAACGTTAATGAATAAATAGGACACGGAGATACAT
ACTCACACGCATGTTACACAACAGAGAATAGTTAGGTTATATGTATCCCATGAACAAACA
CTAGAGCATGGATAAAACGACGAATAGGTTATTGTGACTAAAAATATGGAAGACATAAAT
AAAAAACTAACAATACATAGTTACTATTACGATACTAATATCATTGTGTACTGATAATAA
CAATGAAAGCATTAATGATTATGATTATCACGTAGCAAATTATTATTAAGTCTATCTATC
TATATATATAAATGACAAAATGTTGCATAAAATAACTCTATTCCCTGTAAACTTGATTTT
CTGACGAAAGAAAAAGAGAAAAATAAAACCAGTTCATTGAATTTGCAGTTTGCCCAAATC
GAAATTTCACTGGTCGCCAACCAGATCAGTCTGTATTATTTAGACGATTTGCTTCGATTG
TGTTACTACCATTATTATTATTATTACCAATAGTAATATTAGAATTGTTATTCATTTGTC
CAAAGGGTGTAATTGTGTTTGAACTCATTGGTATAAATGGCTTTGGTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)