cluster # 679

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Schistosoma mansoni
cluster # 679 cluster # 679 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_679#0 length = 660 sequences # 2

consensusID : consensus_679#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 660
fasta sequence

                              [CATTTTGTCACCTTGATGATTATATCTTTTTGAGTTCATTCGTTTTGAGTAAACAAACAAACAAACAAACAAACCAAAAAGATCATCAACACCTTAAGCAAACTCTCTAATGTTGAATTTTCCATTAAAAATACAACAAAAAAAAGAGACACATTTTTCTATATGTGAATTAGGGAAATAAATCAA-TAATTTTTTTTCTATTCACTATATTGTTTTTCATTCTATCTTCTAATATTCTGTAATTTTTTATTCTCTCTTGATAGTATGTATTTTTTGTTCCACACGGTTGTGTGTATCTGTGTGTCTAGCATTAATCTCTTATTGCATAATCACATTTTGTGTTTCTTTTCTCTAAGGAAACTATGGTCTCTTCATATTTTCTCTTTCATGCCTTGTGGATTTTAATTCCTTAATCTGCTATCTATTATTATTATTATTATTATTACTATACTAATGTCCACCATGACAAGGTAACATACATTCTCAATTCATAAATGTGCTTTTTCTCTGCTCCATATACAACTTATTGCTATATCGACATATGCAGATACGGATATACATATATTTATGCACACATGCAGTAAGCATTTGAATTCCATGCCTAATGCTTACATTCATGATTGCATGTACGCCAATGATTAAATCCATTGTATTCAATTG]

[-] EMBL CD184876             [CATTTTGTCACCTTGATGATTATATCTTTTTGAGTTCATTCGTTTTGAGTAAACAAACAAACAAACAAACAAACCAAAAAGATCATCAACACCTTAAGCAAACTCTCTAATGTTGAATTTTCCATTAAAAATACAACAAAAAAAAGAGACACATTTTTCTATATGTGAATTAGGGAAATAAATCAA TAATTTTTTTTCTATTCACTATATTGTTTTTCATTCTATCTTCTAATATTCTGTAATTTTTTATTCTCTCTTGATAGTATGTATTTTTTGTTCCACACGGTTGTGTGTATCTGTGTGTCTAGCATTAATCTCTTATTGCATAATCACATTTTGTGTTTCTTTTCTCTAAGGAAACTATGGTCTCTTCATATTTTCTCTTTCATGCCTTGTGGATTTTAATTCCTTAATCTGCTATCTATTATTATTATTATTATTATTACTATACTAATGTCCACCATGACAAGGTA                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD196467             [                                                                                                                                                               TATATGT AATTAGGGAAATAAATCAATTTTTTTTTTTTCTATTCACTATATTGTTTTTCATTCTATCTTCTAATATTCTGTAATTTTTTATTCTCTCTTGATAGTATGTATTTTTTGTTCCACACGGTTGTGTGTATCTGTGTGTCTAGCATTAATCTCTTATTGCATAATCACATTTTGTGTTTCTTTTCTCTAAGGAAACTATGGTCTCTTCATATTTTCTCTTTCATGCCTTGTGGATTTTAATTCCTTAATCTGCTATC   TATTATTATTATTATTATTACTATACTAATGCCCACCATGACAAGGTAACATACATTCTCAATTCATAAATGTGCTTTTTCTCTGCTCCATATACAACTTATTGCTATATCGACATATGCAGATACGGATATACATATATTTATGCACACATGCAGTAAGCATTTGAATTCCATGCCTAATGCTTACATTCATGATTGCATGTACGCCAATGATTAAATCCATTGTATTCAATTG]




>consensus_679#0
CATTTTGTCACCTTGATGATTATATCTTTTTGAGTTCATTCGTTTTGAGTAAACAAACAA
ACAAACAAACAAACCAAAAAGATCATCAACACCTTAAGCAAACTCTCTAATGTTGAATTT
TCCATTAAAAATACAACAAAAAAAAGAGACACATTTTTCTATATGTGAATTAGGGAAATA
AATCAATAATTTTTTTTCTATTCACTATATTGTTTTTCATTCTATCTTCTAATATTCTGT
AATTTTTTATTCTCTCTTGATAGTATGTATTTTTTGTTCCACACGGTTGTGTGTATCTGT
GTGTCTAGCATTAATCTCTTATTGCATAATCACATTTTGTGTTTCTTTTCTCTAAGGAAA
CTATGGTCTCTTCATATTTTCTCTTTCATGCCTTGTGGATTTTAATTCCTTAATCTGCTA
TCTATTATTATTATTATTATTATTACTATACTAATGTCCACCATGACAAGGTAACATACA
TTCTCAATTCATAAATGTGCTTTTTCTCTGCTCCATATACAACTTATTGCTATATCGACA
TATGCAGATACGGATATACATATATTTATGCACACATGCAGTAAGCATTTGAATTCCATG
CCTAATGCTTACATTCATGATTGCATGTACGCCAATGATTAAATCCATTGTATTCAATTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case