cluster # 6793

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Schistosoma mansoni
cluster # 6793 cluster # 6793 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6793#0 length = 707 sequences # 4

consensusID : consensus_6793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 707
fasta sequence

                              [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAATA]

[+] EMBL CD082226             [AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAAATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCACAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTNTTGTTGTC AAAGACTNTTCTGTTTTTGGGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAtna]
[-] EMBL CD076776             [                                                                                                                               CACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTATCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ]
[-] EMBL CD075837             [                                                                                                                                  TATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTACCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTAGTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGATCAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTTCCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAATGAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGTGGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAATGTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAAAAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAAT ]
[+] EMBL CD083201             [                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTAAATATTGATCGATATATTTTGGCAAATGTTTTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]




>consensus_6793#0
AACAAATCCCAAAATAGATTACGATTGTTTACTATTAATTATGAGCTGACATCGTTCAAA
ATGTACGCAAATCAATAGAAGAACAAGTTTGTGGCCTAAAGGTGAGAAATATTGATTCCA
CAATATACACTATAACACGTTACACGTACGCGAAAAGTGCAGGAATAACTCTCTTTTTTA
CCGTGCCGGAATTTTTAGTAAGTTGTTTTGTATTTTCAAGATTATGGATTCCTGAGATTA
GTCCAGCATAAAATAGTAAAAAAACATTTAAATATTGATCGATATATTTTGTCAAATGTT
TTATAAACAATATTCTACACTTTTTATGTACAACGGAGATCAAATATCAACTAAATCGAT
CAATAGGCAATAAATTGTTTTAATTCATTAATGAAACCATATAATGTTATGGTTTTCTTT
CCTTTTTTGCATTGAATAAGATCAGTACCTTTAATGCATTAAAAAGTTAATCTTCTTAAT
GAGATTTGGCATTCGTTATATAACTACTTTAAAGTCTTCAACCATTCTATATCTCTTTGT
GGCTTTGTCTAGAAATTTGGAATTTATACAGCTTAATTATGATTTATAAATAAGAAAAAT
GTAACTAAATTCATTGTAGATGCACTCATTGCATACAAATCAGTTCTTTTTTGTTGTCAA
AAGACTTTTCTGTTTTTGTGTACTTATTTGTTTTATTTTGAATAATA

clustalw multiple alignements is not computed in this case