cluster # 6818

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Schistosoma mansoni
cluster # 6818 cluster # 6818 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6818#0 length = 594 sequences # 4

consensusID : consensus_6818#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 594
fasta sequence

                              [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT]

[+] EMBL AW017345             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTTTTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT]
[+] EMBL CD076447             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAAATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAAAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAAAAAATATTGGGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGGGTATGGGGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAAACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAAATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAAAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGACCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTCTTGATAAGTTTTCTATTGta                                  ]
[+] EMBL AI976868             [AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGATATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTCTTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGCTAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATCAATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTCTTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGT                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD158578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCCAAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTTTTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTGTATGAGCTTTATATTCTTTAGTTC                                                                                          ]




>consensus_6818#0
AATTATTATTTTCTTTTATTGATACATTTACACTTTATATTGTAGTTATTGGCTGAAGAT
ATTCGTAAAGAACGTAATCAACTTATGCAATGTATTCGTTATATTGTTAAAGAGAATTTC
TTTCAATAATAATAATGATATTCAAATGACATTGATATATTTTATGTATAATACGAGAGC
TAAGAAATAAAGTGTATATAATATATATGAAGAAAATATTGTGTAAAGTTTGATCTGATC
AATGTTTTGTGTATGGTGTCCATTCTGGATCTTTAAAATTAATATAGACTTGTTTTTTTC
TTGGGCGACCGGCTTTACGTTGTACATTGATAGGATTAATATTATTAGATTGTTTAACCC
AAATTGAAGTTCCTTGAGGAAGATGTCGTTTTATACGAGTAAACTTATGATTTTTTCGTT
TTCTTTTACGTCCATCTGATTTAAGTTCACCTGATGCAGAAAGTAATGGAAGTGATCTTG
TATGAGCTTTATATTCTTTAGTTCTTCTTGATTGTTGAAAATCAGGGGGACATAAACTTT
TTGATAAGTTTTCTATTGGATAAATTTTGGCTTGTTCTATTGACTTGGACTCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case