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Schistosoma mansoni
cluster # 6822 cluster # 6822       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6822#0 length = 976 sequences # 4  

consensusID : consensus_6822#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 976
fasta sequence
                              [GAGGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTTATTCTGTTTTACCAATCGAAGCATCGAAATATTTT-ATAAAATACAATGTTTCTGTTTCGAAGAACAACGTCTTAATCCTCACGAAAAAGTTGACCTGCCTGTATTTTTCTTCCTTGATCCAGAAATTAGTTCAGATCAGCGGTTAAAAAGATGTTCAGAAATTATATTAAATTATACTTTCTTCGAAGCCAAAAAAGCTAAATTTCATATTCCAGGAATCACAACTCCAGAATATAGTGCTACACAAGAGTCGGAAGTACTACCTGAGGTAATTAGTTAGCCGGTTAAACGATAAACGAACGAACAAAACAATTTCTAGCGTAAAAATCTTTTATACTCTTTAAGAAAATGAACATAGAATTCTTTCCATTCACCTTATTCATGTTTTTGTACATATAAGTTAGCTGCTAAATTAGTCATTTTAAAAGAACCTCATAGAAAGTGGTTTCCCTGGGTTTTTTTGAAATATCCTTTCAATGAAAATGTATGGTACTACTAATCACTAATTACTTCTGTAAGTGTTATCATATATCATGTGGTATTGATTTGTTTGAAATGTAAACATCAGTTTGGTGATTTCATCTCTACTGGTAAGTGTTTGTTAGTCTCTGGATTGTGCATCTTTGCATTACCCTACATTATAATGGCAGATTGCCATAATTCTTCAATGAAGAATTACATTGAAATGAATATCTGTCCCTTTTTTTGTGTACAGTGGTGGGGAATGCTTTCAGCCTAATGATCACATCATATTAGTAATATGTTCATTATGAACACCCCTGCAACCAGTTATTTGGTGAATAAATTACTTATTTTCTTGTTAGTTAAATTGAATGAAACTTACTATTTTTTAAAAACTCAATGTTCACTCTGTAATACTTCCCCCCTTTGGATATGTGTAATTCAGTCTTGATCCCATTGTTTTTTTATAGTTTTTGATAAATCTGTAT]

[+] EMBL CD082909             [GAGGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTTATTCTGTTTTACCAATCGAAGCATCGAAATATTTT ATAAAATACAATGTTTCTGTTTCGAAGAACAACGTCTTAATCCTCACGAAAAAGTTGACCTGCCTGTATTTTTCTTCCTTGATCCAGAAATTAGTTCAGATCAGCGGTTAAAAAGATGTTCAGAAATTATATTAAATTATACTTTCTTCGAAGCCAAAAAAGCTAAATTTCATATTCCAGGAATCACAACTCCAGAATATAGTGCTACACAAGAGTCGGAAGTACTACCTGAGGTAATTAGTTAGCCGGTTAAACGATAAACGAACGAACAAAACAATTTCTAGCGTAAAAATCTTTTATACTCTTTAAGAAAATGAACATAGAATTCTTTCCATTCACCTTATTCATGTTTTTGTACATATAAGTTAGCTGCTAAATTAGTCATTTTAAAAGAACCTCATAGAAAGTGGTTTCCCTGGGTTTTTTTGAAATATCCTTTCAATGAAAATGTATGGTACTACTAATCACTAATTACTTCTGTAAGTGTTATCATATATCATGTGGTATTGATTTGTTTGAAATGTAAACATCAGTTTGGTGATTTCATCTCTACTGGTAAGTGTTTGTTAGTCTCTGGATTGTGCATCTTTGCATTACCCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD137974             [                                     CCAATCGAAGCATCGAAATATTTTCATAAAATACAATGTTTCTGTTTCGAAGAACAACGTCTTAATCCTCACGAAAAAGTTGACCTGCCTGTATTTTTCTTCCTTGATCCAGAAATTAGTTCAGATCAGCGGTTAAAAAGATGTTCAGAAATTATATTAAATTATACTTTCTTCGAAGCCAAAAAAGCTAAATTTCATATTCCAGGAATCACAACTCCAGAATATAGTGCTACACAGGAGTCGGAAGTACTACCTGAGGTAATTAGTTAGCCGGTTAAACGATAAACGAACGAACAAAACAATTTCTAGCGTAAAAATCTTTTATACTCTTTAAGAAAATGAACATAGAATTCTTTCCATTCACCTTATTCATGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD076493             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTCTTTCCATTCACCTTATTCATGTTTTTGTACATATAAGTTAGCTGCTAAATTAGTCATTTTAAAAGAACCTCATAGAAAGTGGTTTCCCTGGGTTTTTTTGAAATATCCTTTCAATGAAAATGTATGGTACTACTAATCACTAATTACTTCTGTAAGTGTTATCATATATCATGTGGTATTGATTTGTTTGAAATGTAAACATCAGTTTGGTGATTTCATCTCTACTGTAAAGTGTTTGTTAGTCTCTGGATTGTGCATCTTTGCATTACCCTACATTATAATGGCAGATTGCCATAATTCTTCAATGAAGAATTACATTGAAATGAATATCTGTCCCTTTTTTTGTGTACAGTGGTGGGGAATGCTTTCAGCCTAATGATCACATCATATTAGTAATATGTTCATTATGAACACCCCTGCAACCAGTTATTTGGTGAATAAATTACTTATTTTCTTGTTAGTTAAATTGAATGAAACTTACTATTTTTTAAAAACTCAATGTTCACTCTGTAATACTTCCCCCCTTTGGATATGTGTAATTCAGTCTTGATCCCATTGTTTTTTTATAGTTTTTGATAAATCTGT  ]
[-] EMBL CD181143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAAATGAATATCTGTCCCTTTTTTTGTGTACAGTGGTGGGGAATGCTTTCAGCCTAATGATTACATCATATTAGTAATATGTTCATTATGAACACCCCTGCAACCAGTTATTTGGTGAATAAATTACTTATTTTCTTGTTAGTTAAATTGAATGAAACTTACTATTTTTTAAAAACTCAATGTTCACTCTGTAATACTTCCACCCTTTGGATATGTGTAATTCAGTCTTGAT CCATTGTTTTTTTATAGTTTTTGATAAATCTGTAT]


>consensus_6822#0 GAGGGCCAGAATTCGGCACGAGGCTTATTCTGTTTTACCAATCGAAGCATCGAAATATTT TATAAAATACAATGTTTCTGTTTCGAAGAACAACGTCTTAATCCTCACGAAAAAGTTGAC CTGCCTGTATTTTTCTTCCTTGATCCAGAAATTAGTTCAGATCAGCGGTTAAAAAGATGT TCAGAAATTATATTAAATTATACTTTCTTCGAAGCCAAAAAAGCTAAATTTCATATTCCA GGAATCACAACTCCAGAATATAGTGCTACACAAGAGTCGGAAGTACTACCTGAGGTAATT AGTTAGCCGGTTAAACGATAAACGAACGAACAAAACAATTTCTAGCGTAAAAATCTTTTA TACTCTTTAAGAAAATGAACATAGAATTCTTTCCATTCACCTTATTCATGTTTTTGTACA TATAAGTTAGCTGCTAAATTAGTCATTTTAAAAGAACCTCATAGAAAGTGGTTTCCCTGG GTTTTTTTGAAATATCCTTTCAATGAAAATGTATGGTACTACTAATCACTAATTACTTCT GTAAGTGTTATCATATATCATGTGGTATTGATTTGTTTGAAATGTAAACATCAGTTTGGT GATTTCATCTCTACTGGTAAGTGTTTGTTAGTCTCTGGATTGTGCATCTTTGCATTACCC TACATTATAATGGCAGATTGCCATAATTCTTCAATGAAGAATTACATTGAAATGAATATC TGTCCCTTTTTTTGTGTACAGTGGTGGGGAATGCTTTCAGCCTAATGATCACATCATATT AGTAATATGTTCATTATGAACACCCCTGCAACCAGTTATTTGGTGAATAAATTACTTATT TTCTTGTTAGTTAAATTGAATGAAACTTACTATTTTTTAAAAACTCAATGTTCACTCTGT AATACTTCCCCCCTTTGGATATGTGTAATTCAGTCTTGATCCCATTGTTTTTTTATAGTT TTTGATAAATCTGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)