cluster # 6825

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Schistosoma mansoni
cluster # 6825 cluster # 6825 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6825#0 length = 882 sequences # 4
consensusID : consensus_6825#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 882
fasta sequence
                              [CAAGTTCTAGCTTTTGACTGTACCTAGCCTCTTAAAAAATGAATAGGTAGCGACTTCTCAGAAGTAAAAAGCCGTAATTATCGGTACTTGTCAGTAAAGTGTATCTGAAGTTTTGAAAACTAACTTCCTCTAAGAATCCCCATAAAAGAATTTCTGTCCGAAAGTTCTAAACGCTTGTTTGCCAGTCATCTTCCACGTAGCTCAAATGACCTTCACTTCCAGTCCATATGGTAGTTTGGAGTTTAAGTTGGTCATTATTCCCGGTTATGAAAAAACCTTTTATTGTTACAACTTCGAATGAAACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCAGTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAATGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGTTTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGTAGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTCCATTTGGGGTCCTGGAGATGATACAACTTGATGGCTTAAGATGTTATCAAATATAGCTCAAAATAGAATCCACCGACGATTACACTGTAGTTTCGTGTCACTTCATAAGTTAAGTGAACTCGACTGGATGGTTTCTTTTTTGGATGTATTAAAAATTGAACTATATCTTACTACATACTATTTTTTATCCATTTATTTAATTATTGTACTGCTATTTCCTACCCTATTTCTTTTGTGATGCGGTTTTTTGTCCTATATTGTACTCGGATTCGTATGCATGCAATGAATAAAAATAAAAT]

[+] EMBL CD082999             [CAAGTTCTAGCTTTTGACTGTACCTAGCCTCTTAAAAAATGAATAGGTAGCGACTTCTCAGAAGTAAAAAGCCGTAATTATCGGTACTTGTCAGTAAAGTGTATCTGAAGTTTTGAAAACTAACTTCCTCTAAGAATCCCCATAAAAGAATTTCTGTCCGAAAGTTCTAAACGCTTGTTTGCCAGTCATCTTCCACGTAGCTCAAATGACCTTCACTTCCAGTCCATATGGTAGTTTGGAGTTTAAGTTGGTCATTATTCCCGGTTATGAAAAAACCTTTTATTGTTACAACTTCGAATGAAACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCAGTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAATGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGTTTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGTAGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTCCATTTGGGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD082964             [CAAGTTCTAGCTTTTGACTGTACCTAGCCTCTTAAAAAATGAATAGGTAGCGACTTCTCAGAAGTAAAAAGCCGTAATTATCGGTACTTGTCAGTAAAGTGTATCTGAAGTTTTGAAAACTAACTTCCTCTAAGAATCCCCATAAAAGAATTTCTGTCCGAAAGTTCTAAACGCTTGTTTGCCAGTCATCTTCCACGTAGCTCAAATGACCTTCACTTCCAGTCCATATGGTAGTTTGGAGTTTAAGTTGGTCATTATTCCCGGTTATGAAAAAACCTTTTATTGTTACAACTTCGAATGAAACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCAGTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAATGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGTTTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGTAGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTNCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD076582             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGAAACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCAGTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAATGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGTTTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGTAGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTCCATTTGGGGTCCTGGAGATGATACAACTTGATGGCTTAAGATGTTATCAAATATAGCTCAAAATAGAATCCACCGACGATTACACTGTAGTTTCGTGTCACTTCATAAGTTAAGTGAACTCGACTGGATGGTTTCTTTTTTGGATGTATTAAAAATTGAACTATATCTTACTACATACTATTTTTTATCCATTTATTTAATTATTGTACTGCTATTTCCTACCCTATTTCTTTTGTGATGCGGTTTTTTGTCCTATATTGTACTCGGATTCGTATGCATGCAATGAATAAAAATAAAAT]
[-] EMBL CD076547             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCAGTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAATGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGTTTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGTAGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTCCATTTGGGGTCCTGGAGATGATACAACTTGATGGCTTAAGATGTTATCAAATATAGCTCAAAATAGAATCCACCGACGATTACACTGTAGTTTCGTGTCACTTCATAAGTTAAGTGAACTCGACTGGATGGTTTCTTTTTTGGATGTATTAAAAATTGAACTATATCTTACTACATACTATTTTTTATCCATTTATTTAATTATTGTACTGCTATTTCCTACCCTATTTCTTTTGTGATGCGGTTTTTTGTCCTATATTGTACTCGGATTCGTATGCATGCAATGAATAAAAATAAAAT]




>consensus_6825#0
CAAGTTCTAGCTTTTGACTGTACCTAGCCTCTTAAAAAATGAATAGGTAGCGACTTCTCA
GAAGTAAAAAGCCGTAATTATCGGTACTTGTCAGTAAAGTGTATCTGAAGTTTTGAAAAC
TAACTTCCTCTAAGAATCCCCATAAAAGAATTTCTGTCCGAAAGTTCTAAACGCTTGTTT
GCCAGTCATCTTCCACGTAGCTCAAATGACCTTCACTTCCAGTCCATATGGTAGTTTGGA
GTTTAAGTTGGTCATTATTCCCGGTTATGAAAAAACCTTTTATTGTTACAACTTCGAATG
AAACATTTGTTTTCCGAACGTCTAACCACACACGAGCCGAAAGAAATCCTTAGACATTCA
GTTCATACAGAGTTTAAGCATTAAATTAGTTCCCGCTAAATTTTTAGATATCTTTGCCAA
TGCACGATATTAACTTTCTTTATTTATCAAACTGACTATTAATTCTACATATTGGTAGGT
TTGGTCAATTAGAAACCATTATATTTGTGGTCAGTTAATGACATGGTACCACGGTATTGT
AGACTACTGAATAGAACTGGCATGTCGAACCATAACGAATCTCCATTTGGGGTCCTGGAG
ATGATACAACTTGATGGCTTAAGATGTTATCAAATATAGCTCAAAATAGAATCCACCGAC
GATTACACTGTAGTTTCGTGTCACTTCATAAGTTAAGTGAACTCGACTGGATGGTTTCTT
TTTTGGATGTATTAAAAATTGAACTATATCTTACTACATACTATTTTTTATCCATTTATT
TAATTATTGTACTGCTATTTCCTACCCTATTTCTTTTGTGATGCGGTTTTTTGTCCTATA
TTGTACTCGGATTCGTATGCATGCAATGAATAAAAATAAAAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case