These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6830#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 687 fasta sequence [AGCGCTCGCGCACAAATTTAGGCTTGCTGAACAAATAGCCAAAAAGACAAGTGAAGATGGAAAATATCGCAAATGTTAAGTAATATATTTATCTTAATCTATGTTGTTTGTTGTTGTACACTACTCATATAATTAGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTAGTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATTAATTAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATAGAAAGTAACTTAAATACAATATAGCCAATAAATGTT] [+] EMBL CD083124 [AGCGCTCGCGCACAAATTTAGGCTTGCTGAACAAATAGCCAAAAAGACAAGTGAAGATGGAAAATATCGCAAATGTTAAGTAATATATTTATCTTAATCTATGTTGTTTGTTGTTGTACACTACTCATATAATTAGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTNTTCTTAGTAGTTNTTCAAGAACTTCTCATTTAGACANATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAA ] [-] EMBL CD076698 [ AGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCCCAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTTTTAGTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTATGATTAATTAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATAGAAAGTAACTTAAATACAATATAGCCAATAAATGTT] [-] EMBL AI974998 [ ATTATTGGCGATTTATTAATATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAATCGAATCATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTAGTAGTTTTTCAAGATCTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATTAATCAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATACAAAGTAACTTAAATACAATATAGC ] [+] EMBL CD149998 [ TCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTATTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||