Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6830 cluster # 6830       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6830#0 length = 687 sequences # 4  

consensusID : consensus_6830#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 687
fasta sequence
                              [AGCGCTCGCGCACAAATTTAGGCTTGCTGAACAAATAGCCAAAAAGACAAGTGAAGATGGAAAATATCGCAAATGTTAAGTAATATATTTATCTTAATCTATGTTGTTTGTTGTTGTACACTACTCATATAATTAGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTAGTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATTAATTAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATAGAAAGTAACTTAAATACAATATAGCCAATAAATGTT]

[+] EMBL CD083124             [AGCGCTCGCGCACAAATTTAGGCTTGCTGAACAAATAGCCAAAAAGACAAGTGAAGATGGAAAATATCGCAAATGTTAAGTAATATATTTATCTTAATCTATGTTGTTTGTTGTTGTACACTACTCATATAATTAGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTNTTCTTAGTAGTTNTTCAAGAACTTCTCATTTAGACANATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAA                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD076698             [                                                                                                                                      AGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATGTATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATAAGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAGCATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCCCAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTTTTAGTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTATGATTAATTAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATAGAAAGTAACTTAAATACAATATAGCCAATAAATGTT]
[-] EMBL AI974998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTATTGGCGATTTATTAATATATGCAACATTTTAATTTGATATTTGTGAATATTACAAAGAATCGAATCATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCTCTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTAGTAGTTTTTCAAGATCTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATTAATCAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATACAAAGTAACTTAAATACAATATAGC           ]
[+] EMBL CD149998             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAGTTTTTCTTATTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATTTTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATT                                                                                        ]


>consensus_6830#0 AGCGCTCGCGCACAAATTTAGGCTTGCTGAACAAATAGCCAAAAAGACAAGTGAAGATGG AAAATATCGCAAATGTTAAGTAATATATTTATCTTAATCTATGTTGTTTGTTGTTGTACA CTACTCATATAATTAGTACCGCTGTGATATTTTTACAAAATCTTAGTGATAATAATGATG TATCACTATCGCTTGTTGATTAATTTAACACTTATCTACTTCCTTATTCTTTTGTACATA AGCAATATTAACATACATATACCTCTGTAGATATATATATATACTACTGATAGCAAAGAG CATAAATCACGACAAATTATTGACGATTTATTAAAATATGCAACATTTTAATTTGATATT TGTGAATATTACAAAGAAACGAAACATCACAATGAGAAATAGAATTCAGATACTCCCTCT CTTTGTTTTCCGATAAAAAGAGTCCATTATAATTCCTTTACATAGAAACATCACTCGAAG TTTTTCTTAGTAGTTTTTCAAGAACTTTTCATTTAGACAAATGAATTGGCTTATTCTATT TTTATTTGGAATAAACATGTAATGATTGAAATTCACATTAATATCCCCATATTTAGATTA ATTAACCGCACATGGCTGTTTCTTGTTGCTTTTTTTCCTCTTTAATTAATAGAAAGTAAC TTAAATACAATATAGCCAATAAATGTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)