cluster # 6838

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Schistosoma mansoni
cluster # 6838 cluster # 6838 Sequences # 4 consensus # 2

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consensus_6838#0 length = 1388 sequences # 3

consensus_6838#1 length = 591 sequences # 1

consensusID : consensus_6838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1388
fasta sequence

                              [AGATTCGGCACGAGGCCGGTTTAATATTTTAGTAATCCTGAAAACTTGTAGATGATTATTCCATCTCAAATTGATTTTCATAGATATTTGATGCCATATCTAGTTTTTGGTAGTCTAATCGTAATTTCGTTCCATTCTTTTCTCAAATGAAGTATTGCGTTGTCTGATTTGTTTGTGTAAGTTCTCATCTAACTGTTATTTGTTTTCTTCGTATTTCTCATTTTTAGAAGGAGACGGAACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAATTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTGATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAAAAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTTTACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAACCTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTTTTCCTGGTCTTCAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGNTTGANGGC-AGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAAATGCTCAAGCTTTGGGTAATGCTCTTACATCCATCGGGATCCGCCTTTGTGCCAGTGCCACTTATTGTCCATTCCATTCTAATTGATTATTTTAAATCACCTGGTAACCCAAAATTAAGTCGGGGAGATGGAGCACAAGTTCAAATGATTGGTGATCTTGTTGGTATTGTTCTACACACAAATACAGTTGTTGGTGATTCTAGTGCACAGCAGCCGTCTGGTTTAAGAATTGGTACGCCAGCGTTAACTACTCGTGGGTTTAAGGAAAAAGATTTTGAAAAAGCTGCTTCATTTATTGACGAATTACTTGACCTGACAGTTGTGGTTAAGTCTGTCTCAAAAAATCTTAAATCTTTTCAACTTGTCCTTCAAGAAGATGAACACATAAAATCCAAGATTAAGGATTTACGTCATCGTGTTGCTGATTTTGCATCTAGTTTCCCAATTCCTGGAATGGAAGATATTTAAGTACATCTATGCACAAATAACATCGATTTTCATCTGCTAGTTTGTATTCCAAATATTAGTTTAATACTGCTGCCCAAACTGTGATTGGATTTATTTGTGTTCTGTTAACTTTTGTATCACTTATGGTGTGACAATTAGGATTTTCTTATGCTTTTTTAGATTAATATTTGACTATGTTTTATTTGTATAATCACTCAATAAATAAATTGTCTA]

[+] EMBL CD083163             [AGATTCGGCACGAGGCCGGTTTAATATTTTAGTAATCCTGAAAACTTGTAGATGATTATTCCATCTCAAATTGATTTTCATAGATATTTGATGCCATATCTAGTTTTTGGTAGTCTAATCGTAATTTCGTTCCATTCTTTTCTCAAATGAAGTATTGCGTTGTCTGATTTGTTTGTGTAAGTTCTCATCTAACTGTTATTTGTTTTCTTCGTATTTCTCATTTTTAGAAGGAGACGGAACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAATTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTGATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAAAAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTTTACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAACCTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTTTTCCTGGTCTTCAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGNTTGANGGC AGTAAACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD134340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGTTTGA GGCAAGTAAACTTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAAATGCTCAAGCTTTGGGTAATGCTCTTACATCCATCGGGATCCGCCTTTGTGCCAGTGCCACTTATTGTCCATTCCATTCTAATTGATTATTTTAAATCACCTGGTAACCCAAAATTAAGTCGGGGAGATGGAGCACAAGTTCAAATGATTGGTGATCTTGTTGGTATTGTTCTACACACAAATACAGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD076736             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGTAAACCAAAATTAAGTCGGGGAGATGGAGCACGAGTTCAAATGATTGGTGATCTTGTTGGTATTGTTCTAAACAAAAATACAGTTGTTGGTGATTCTAGTGCACAGCAGCCGTCTGGTTTAAGAATTGGTACGCCAGCGTTAACTACTCGTGGGTTTAAGGAAAAAGATTTTGAAAAAGCTGCTTCATTTATTGACGAATTACTTGACCTGACAGTTGTGGTTAAGTCTGTCTCAAAAAATCTTAAATCTTTTCAACTTGTCCTTCAAGAAGATGAACACATAAAATCCAAGATTAAGGATTTACGTCATCGTGTTGCTGATTTTGCATCTAGTTTCCCAATTCCTGGAATGGAAGATATTTAAGTACATCTATGCACAAATAACATCGATTTTCATCTGCTAGTTTGTATTCCAAATATTAGTTTAATACTGCTGCCCAAACTGTGATTGGATTTATTTGTGTTCTGTTAACTTTTGTATCACTTATGGTGTGACAATTAGGATTTTCTTATGCTTTTTTAGATTAATATTTGACTATGTTTTATTTGTATAATCACTCAATAAATAAATTGTCTA]




>consensus_6838#0
AGATTCGGCACGAGGCCGGTTTAATATTTTAGTAATCCTGAAAACTTGTAGATGATTATT
CCATCTCAAATTGATTTTCATAGATATTTGATGCCATATCTAGTTTTTGGTAGTCTAATC
GTAATTTCGTTCCATTCTTTTCTCAAATGAAGTATTGCGTTGTCTGATTTGTTTGTGTAA
GTTCTCATCTAACTGTTATTTGTTTTCTTCGTATTTCTCATTTTTAGAAGGAGACGGAAC
TGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAATTG
CTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTGATT
CAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAAAAG
TTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTTTAC
GTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAACCTA
AAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTTTTC
CTGGTCTTCAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGNTTGA
NGGCAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAAATGCTCAAGCTTT
GGGTAATGCTCTTACATCCATCGGGATCCGCCTTTGTGCCAGTGCCACTTATTGTCCATT
CCATTCTAATTGATTATTTTAAATCACCTGGTAACCCAAAATTAAGTCGGGGAGATGGAG
CACAAGTTCAAATGATTGGTGATCTTGTTGGTATTGTTCTACACACAAATACAGTTGTTG
GTGATTCTAGTGCACAGCAGCCGTCTGGTTTAAGAATTGGTACGCCAGCGTTAACTACTC
GTGGGTTTAAGGAAAAAGATTTTGAAAAAGCTGCTTCATTTATTGACGAATTACTTGACC
TGACAGTTGTGGTTAAGTCTGTCTCAAAAAATCTTAAATCTTTTCAACTTGTCCTTCAAG
AAGATGAACACATAAAATCCAAGATTAAGGATTTACGTCATCGTGTTGCTGATTTTGCAT
CTAGTTTCCCAATTCCTGGAATGGAAGATATTTAAGTACATCTATGCACAAATAACATCG
ATTTTCATCTGCTAGTTTGTATTCCAAATATTAGTTTAATACTGCTGCCCAAACTGTGAT
TGGATTTATTTGTGTTCTGTTAACTTTTGTATCACTTATGGTGTGACAATTAGGATTTTC
TTATGCTTTTTTAGATTAATATTTGACTATGTTTTATTTGTATAATCACTCAATAAATAA
ATTGTCTA

consensusID : consensus_6838#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 591
fasta sequence

                              [GATCAAAATGGCTTCCTATTATCAGTTCACCACATAATNTACGCTCAATGTAAATAAAGGAGACGGAACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAATTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTGATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAAAAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTTTACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAACCTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTTTTCCTGGTCTTCAAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGTTTGAGGCAAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAGATGCTCAAGCTTTGGCTAATGCTCTTACATCACTCGGTATCCGCCTTGTGACAG]

[-] EMBL CD116278             [GATCAAAATGGCTTCCTATTATCAGTTCACCACATAATNTACGCTCAATGTAAATAAAGGAGACGGAACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAATTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTGATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAAAAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTTTACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAACCTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTTTTCCTGGTCTTCAAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGTTTGAGGCAAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAGATGCTCAAGCTTTGGCTAATGCTCTTACATCACTCGGTATCCGCCTTGTGACAG]




>consensus_6838#1
GATCAAAATGGCTTCCTATTATCAGTTCACCACATAATNTACGCTCAATGTAAATAAAGG
AGACGGAACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAAC
TTATAATTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAA
TCTGTGATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTG
CTTCAAAAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATA
AAACTTTACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGG
AGAAACCTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATG
CGGTTTTTCCTGGTCTTCAAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTA
TGGCGTTTGAGGCAAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAGATG
CTCAAGCTTTGGCTAATGCTCTTACATCACTCGGTATCCGCCTTGTGACAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6838#0      AGATTCGGCACGAGGCCGGTTTAATATTTTAGTAATCCTGAAAACTTGTAGATGATTATT 60
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      CCATCTCAAATTGATTTTCATAGATATTTGATGCCATATCTAGTTTTTGGTAGTCTAATC 120
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      GTAATTTCGTTCCATTCTTTTCTCAAATGAAGTATTGCGTTGTCTGATTTGTTTGTGTAA 180
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------GATCAA 6
                                                                            *   **

consensus_6838#0      GTTCTCATCTAACTGTTATTTGTTTTCTTCGTATTT-CTCATTTTTAG--AAGGAGACGG 237
consensus_6838#1      AATGGCTTCCTATTATCAGTTCACCACATAATNTACGCTCAATGTAAATAAAGGAGACGG 66
                        *  * **  * * * * **     * *  * *   **** * * *   **********

consensus_6838#0      AACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAA 297
consensus_6838#1      AACTGATCGATTATGATGCACTACAGCAAGATGCTCTTAATGTATTCCCAAAACTTATAA 126
                      ************************************************************

consensus_6838#0      TTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTG 357
consensus_6838#1      TTGCTGGAATTACCGCCTATCCACGATTGCTGGATTACAAGCGTTTTCGTCAAATCTGTG 186
                      ************************************************************

consensus_6838#0      ATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAA 417
consensus_6838#1      ATTCAATTGGAGCTGTATTACTAGCTGATATGGCCCATATTTCAGGTTTAGTTGCTTCAA 246
                      ************************************************************

consensus_6838#0      AAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTT 477
consensus_6838#1      AAGTTGTCCCATCGCCATTTGAATATGCAGATGTTGTGAGTTCTACAACACATAAAACTT 306
                      ************************************************************

consensus_6838#0      TACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAAC 537
consensus_6838#1      TACGTGGACCGCGCTCTGGAATCATTTTTTATCGCAAAAAAGAGAGACCTATGGAGAAAC 366
                      ************************************************************

consensus_6838#0      CTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTT 597
consensus_6838#1      CTAAAGTAAATTGTAGCATTCCTGTTGATCAGTTGGAAACAAGAATAAATAATGCGGTTT 426
                      ************************************************************

consensus_6838#0      TTCCTGGTCTTCA-GGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGN 656
consensus_6838#1      TTCCTGGTCTTCAAGGTGGACCACATGAAAATACAATAGCTGCTATTGCTGCTATGGCGT 486
                      ************* ********************************************* 

consensus_6838#0      TTGANGGCAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAAATGCTCAAG 716
consensus_6838#1      TTGAGGCAAGTAAACCTGAATTTCAAGATTATGCTCGTCAAGTTTTAGCAGATGCTCAAG 546
                      **** *  ****************************************** *********

consensus_6838#0      CTTTGGGTAATGCTCTTACATCCATCGGGATCCGCCTTTGTGCCAGTGCCACTTATTGTC 776
consensus_6838#1      CTTTGGCTAATGCTCTTACATCACTCGGTATCCGCCTT-GTGACAG-------------- 591
                      ****** ***************  **** ********* *** ***              

consensus_6838#0      CATTCCATTCTAATTGATTATTTTAAATCACCTGGTAACCCAAAATTAAGTCGGGGAGAT 836
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      GGAGCACAAGTTCAAATGATTGGTGATCTTGTTGGTATTGTTCTACACACAAATACAGTT 896
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      GTTGGTGATTCTAGTGCACAGCAGCCGTCTGGTTTAAGAATTGGTACGCCAGCGTTAACT 956
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      ACTCGTGGGTTTAAGGAAAAAGATTTTGAAAAAGCTGCTTCATTTATTGACGAATTACTT 1016
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      GACCTGACAGTTGTGGTTAAGTCTGTCTCAAAAAATCTTAAATCTTTTCAACTTGTCCTT 1076
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      CAAGAAGATGAACACATAAAATCCAAGATTAAGGATTTACGTCATCGTGTTGCTGATTTT 1136
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      GCATCTAGTTTCCCAATTCCTGGAATGGAAGATATTTAAGTACATCTATGCACAAATAAC 1196
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      ATCGATTTTCATCTGCTAGTTTGTATTCCAAATATTAGTTTAATACTGCTGCCCAAACTG 1256
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      TGATTGGATTTATTTGTGTTCTGTTAACTTTTGTATCACTTATGGTGTGACAATTAGGAT 1316
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      TTTCTTATGCTTTTTTAGATTAATATTTGACTATGTTTTATTTGTATAATCACTCAATAA 1376
consensus_6838#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6838#0      ATAAATTGTCTA 1388
consensus_6838#1      ------------