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Schistosoma mansoni
cluster # 6867 cluster # 6867       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6867#0 length = 1080 sequences # 4  

consensusID : consensus_6867#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1080
fasta sequence
                              [TGACAACACAATCATTGACAACAACTAATGGACAAAATGAAATGTATTCTAATCAATCTGTACAAAATCAATTGAAATTAGCTCAAGCTCAAGTGAAACGATTAGAAATAGAAATTAATCAATTAAAACGTCAAGCTATACCAGTAATGGGTAGTTCAATGAATGGATTAGTTTATCCAACAAATTATACTAATATTGAACCAGGAATATCAATGGATAATGTTGATAGTCCTGATCTACGATGTGGTATTTCACGTTTGGAATTAGATGGTACTAATGGCGGTGGAGGTGCCGGTGTTAATAGTAATGGAGAATGGATAAACGAATTGAGCATTAATAATAAACCTAAACCAGTTGGTACCATTCATCCTTCGTTGGTACAAGGTAATCAAAACAGACTATTATGGATGGATCGCGCATCACAAGATACCGTACGATCATTGCATATACGTTTAGGAAATGTATTAAAAGAAGCCTTAGAAATTCATAGTCGTTTAAGTTCTCTCCTATCGATTCCATCAGTAGAGTAGAAATTTTGTGTTCACTACACTCACTGACTGGCTACTTTTTTTCCGTCTTCCTGTATACATGACTTTTAAAATATTTTTTTTCATAATTTAGTTTAGATTTCTTAATGTGTTGTCAAGTTGTTTATTCTTCCGAAACTAATGTTTCTCTTCTAAGATGATGAAATTTTCCCTTTAACAACAATACAAGCATCTTCAGTTTATTCATTTTGGTAATAACGGATACTGTTAAATGCCTGTTACTATTTTAGTCATCATCTATGCTGTTGTACAGCTCATGTAATCTACTTTTTTTGCTATGCTGGTGAAATGTAAATTCCTTTTCAATTTGTTACATAAAATATAATTGACTCGAAAAATAAATAGGAAGAACTAAGTACTATCACTACTATTATTCGGACATAATAATGACAAGGCCATAATTATCTATCCTAATGCATGATGTTTACTTTATTTCTCTTAACTGATGTCTCTTTATTCCCTGCGAATTTCCTTTTCTTCTACCTTTTAAAAAAAATTTGAGAATAATTTTACCAAAACCCTTTATACAGGG]

[+] EMBL CD156575             [TGACAACACAATCATTGACAACAACTAATGGACAAAATGAAATGTATTCTAATCAATCTGTACAAAATCAATTGAAATTAGCTCAAGCTCAAGTGAAACGATTAGAAATAGAAATTAATCAATTAAAACGTCAAGCTATACCAGTAATGGGTAGTTCAATGAATGGATTAGTTTATCCAACAAATTATACTAATATTGAACCAGGAATATCAATGGATAATGTTGATAGTCCTGATCTACGATGTGGTATTTCACGTTTGGAATTAGATGGTACTAATGGCGGTGGAGGTGCCGGTGTTAATAGTAATGGAGAATGGATAAACGAATTGAGCATTAATAATAAACCTAAACCAGTTGGTACCATTCATCCTTCGTTGGTACAAGGTAATCAAAACAGACTATTATGGATGGATCGCGCATCACAAGATACCGTACGATCATTGCATATACGTTTAGGAAATGTATTAAAAGAAGCCTTAGAAATTCATAGTCGTTTAAGTTCTCTCCTATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD077842             [                                                                                                                   TAATCAATTAAGACGTCAAGCTATACCAGTAATGGGTAGTTCAATGAATGGATTAGTTTATCCAACANATTATACTAATATTGAACCAGGAATATCAATGGATAATGTTGATAGTCCTGATCTACGATGTGGTATTTCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD137156             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTGGTACCATTCATCCTTCGTTGGTACAAGGTAATCAAAACAGACTATTATGGATGGATCGCGCATCACAAGATACCGTACGATCATTGCATATACGTTTAGGAAATGTATTAAAAGAAGCCTTAGAAATTCATAGTCGTTTAAGTTCTCTCCTATCGATTCCATCAGTAGAGTAGAAATTTTGTGTTCACTACACTCACTGACTGGCTACTTTTTTTCCGTCTTCCTGTATACATGACTTTTAAAATATTTTTTTTCATAATTTAGTTTAGATTTCTTAATGTGTTGTCAAGTTGTTTATTCTTCCGAAACTAATGTTTCTCTTCTAAGATGATGAAATTTTCCCTTTAACAACAATACAAGCATCTTCAGTTTATTCATTTTGGTAATAACGGATACTGTTAAATGCCTGTTACTATTTTAGTCATCATCTATGCTGTTGTACAGCTCATGTAATCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI977782             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGTATACATGACTTTTAAAATATTTTTTTTCATAATTTAGTTTAGATTTCTTAATGTGTTGTCAAGTTGTTTTTTCTTCCGAAACTAATGTTTCTCTTCTAAGATGATGAAATTTTCCCTTTAACAACAATACAAGCATCTTCAGTTTATTCATTTTGGTAATAACGGATACTGTTAAATGCCTGTTACTATTTTAGTCATCATCTATGCTGTTGTACAGCTCATGTAATCTACTTTTTTTGCTATGCTGGTGAAATGTAAATTCCTTTTCAATTTGTTACATAAAATATAATTGACTCGAAAAATAAATAGGAAGAACTAAGTACTATCACTACTATTATTCGGACATAATAATGACAAGGCCATAATTATCTATCCTAATGCATGATGTTTACTTTATTTCTCTTAACTGATGTCTCTTTATTCCCTGCGAATTTCCTTTTCTTCTACCTTTTAAAAAAAATTTGAGAATAATTTTACCAAAACCCTTTATACAGGG]


>consensus_6867#0 TGACAACACAATCATTGACAACAACTAATGGACAAAATGAAATGTATTCTAATCAATCTG TACAAAATCAATTGAAATTAGCTCAAGCTCAAGTGAAACGATTAGAAATAGAAATTAATC AATTAAAACGTCAAGCTATACCAGTAATGGGTAGTTCAATGAATGGATTAGTTTATCCAA CAAATTATACTAATATTGAACCAGGAATATCAATGGATAATGTTGATAGTCCTGATCTAC GATGTGGTATTTCACGTTTGGAATTAGATGGTACTAATGGCGGTGGAGGTGCCGGTGTTA ATAGTAATGGAGAATGGATAAACGAATTGAGCATTAATAATAAACCTAAACCAGTTGGTA CCATTCATCCTTCGTTGGTACAAGGTAATCAAAACAGACTATTATGGATGGATCGCGCAT CACAAGATACCGTACGATCATTGCATATACGTTTAGGAAATGTATTAAAAGAAGCCTTAG AAATTCATAGTCGTTTAAGTTCTCTCCTATCGATTCCATCAGTAGAGTAGAAATTTTGTG TTCACTACACTCACTGACTGGCTACTTTTTTTCCGTCTTCCTGTATACATGACTTTTAAA ATATTTTTTTTCATAATTTAGTTTAGATTTCTTAATGTGTTGTCAAGTTGTTTATTCTTC CGAAACTAATGTTTCTCTTCTAAGATGATGAAATTTTCCCTTTAACAACAATACAAGCAT CTTCAGTTTATTCATTTTGGTAATAACGGATACTGTTAAATGCCTGTTACTATTTTAGTC ATCATCTATGCTGTTGTACAGCTCATGTAATCTACTTTTTTTGCTATGCTGGTGAAATGT AAATTCCTTTTCAATTTGTTACATAAAATATAATTGACTCGAAAAATAAATAGGAAGAAC TAAGTACTATCACTACTATTATTCGGACATAATAATGACAAGGCCATAATTATCTATCCT AATGCATGATGTTTACTTTATTTCTCTTAACTGATGTCTCTTTATTCCCTGCGAATTTCC TTTTCTTCTACCTTTTAAAAAAAATTTGAGAATAATTTTACCAAAACCCTTTATACAGGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)