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Schistosoma mansoni
cluster # 6868 cluster # 6868       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6868#0 length = 853 sequences # 4  

consensusID : consensus_6868#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 853
fasta sequence
                              [AATAGTTATTTCGTCATAATAGAGTTGACTTTTTAACTTCACATCAACGTTCATATTTCGGTTGATTAATGGATGTAAAAGTTGGTAAACCGAGAGAAAAGCCTTCATACTACGGTGGGGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTGTATTAATGATTGTCGACAAAAGCAGGCAGCATTGTACCCTCCCTTTTTGTTTAAATCCTCGTCGGCACAGTTGCTTCTCTCACCTCCAGATGCAAGTGAACTTCTTGTTATAACTGGTCAAAGTAGAATTCATCTATATATACAGCAAAATTTAAATGAACCTTCTCTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAAGTCAGCTGATAAAAATGCTCATTCANAAGTATTTTAATGATAACTATCCGGATTGTGGTCGTTGGTTTAGTGAACTAGATAAAGTAACCGGCTGGTTAGAACAGAAATGGAGGCCATTAACACGAAACTTGGGGCATAGTTAATAATGATGAAATCAGTAATAATGATGATTGGATCGAATTGGATAAGAATATATGCATTCGTGGTCTTCCCACAAGTTGCGTTGCTGTAATTTATTTGAAAAACGTTCACACATATGAAAATATGCCAGTTTATAAAAGCTTACTTTACTCCTCGTCTAAATTTACACAGCTTTTCATCATAATCCATACATAGAGACTTGAGACATTA]

[+] EMBL CD077898             [AATAGTTATTTCGTCATAATAGAGTTGACTTTTTAACTTCACATCAACGTTCATATTTCGGTTGATTAATGGATGTAAAAGTTGGTAAACCGAGAGAAAAGCCTTCATACTACGGTGGGGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD120324             [                                                                                                                      GGATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTGTATTAATGATTGTCGACAAAAGCAGGCAGCATTGTACCCTCCCTTTTTGTTTAAATCCTCGTCGGCACAGTTGCTTCTCTCACCTCCAGATGCAAGTGAACTTCTTGTTATAACTGGTCAAAGTAGAATTCATCTATATATACAGCAAAATTTAAATGAACCTTCTCTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCANATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAAGTCAGCTGATAAAAATGCTCATTCANAAGTATTTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI964718             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTCAAAACATGTGDAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGACTTCCTTTACTTGTTTGGCCTAGGTCAGCTGAT AAAATGCTCATTCAAAAGTATTTAAATGATAACTATCCGGATTGTGGTCGTTGGTTTAGTGAACTAGATAAAGTAACCGGCTGGTTAGAACAGAAATGGAGGCCATTAACACGAAACTTGGGGCATAGTTAATAATGATGAAATCAGTAATAATGATGATTGGATCGAATTGGATAAGAATATATGCATTCGTGGTCTTCCCACAAGTTGCGTTGCTGTAATTTATTTGAAAAACGTTCACACATATGAAAATATGCCAGTTTATAAAAGCTTACTTTACTCCTCGTCTAAATTTACACAGCTTTTCATCATAATCCATACATAGAGACTTGAGACATTA]
[+] EMBL AI740272             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATCACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTAGTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]


>consensus_6868#0 AATAGTTATTTCGTCATAATAGAGTTGACTTTTTAACTTCACATCAACGTTCATATTTCG GTTGATTAATGGATGTAAAAGTTGGTAAACCGAGAGAAAAGCCTTCATACTACGGTGGGG ATAAAGTTGATGCTGACGATGAAGAATCTCAAAAGCTTTGTATTAATGATTGTCGACAAA AGCAGGCAGCATTGTACCCTCCCTTTTTGTTTAAATCCTCGTCGGCACAGTTGCTTCTCT CACCTCCAGATGCAAGTGAACTTCTTGTTATAACTGGTCAAAGTAGAATTCATCTATATA TACAGCAAAATTTAAATGAACCTTCTCTCAAAACATGTGAAAATTACAATAACTCTAATC ACTCAGACATCTCAAATCCTACTGAAGTCGATTTGGTTGTTTGCAAACTAAGTAATCTTA GTATTCCATCGTTTCCTCAAAATTTGTCTTCTGAAGTTTCAATATTTCGATCTCATGGAC TTCCTTTACTTGTTTGGCCTAAGTCAGCTGATAAAAATGCTCATTCANAAGTATTTTAAT GATAACTATCCGGATTGTGGTCGTTGGTTTAGTGAACTAGATAAAGTAACCGGCTGGTTA GAACAGAAATGGAGGCCATTAACACGAAACTTGGGGCATAGTTAATAATGATGAAATCAG TAATAATGATGATTGGATCGAATTGGATAAGAATATATGCATTCGTGGTCTTCCCACAAG TTGCGTTGCTGTAATTTATTTGAAAAACGTTCACACATATGAAAATATGCCAGTTTATAA AAGCTTACTTTACTCCTCGTCTAAATTTACACAGCTTTTCATCATAATCCATACATAGAG ACTTGAGACATTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)