Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6876 cluster # 6876       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6876#0 length = 613 sequences # 4  

consensusID : consensus_6876#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 613
fasta sequence
                              [GGTAATTATTGAAATATGAAACCAAATCTGATTTAAAAGTGGTGTGGGAATGTAAGTAACAATTGAGAAATGTAAGTAGTATATATATATATGATTGATGAATCTGTAAATTCTTATAGCAGTAACAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGACAGATAAGAGAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAATTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTAT-TAATCCATTCATCACGAATTTGATTCATAATTAAATTACATTCAGCTTGAATAGAACGTGTAATCAATAATGCACCAGATTGAATTCGATTCACATCGGATTGACATAGTTTTTGTTCATCGGTATTACAACGATTTAATTCATCAACAGTAAGACATGCAGCTTTAGCTAGACTGGTAATAGTTGATGTATTAGGCAGTAGACGAGTGAATTCTTTTAAGCATTCTTGGAGATTGGTTGTTGCTTCTGACTGGATTGCATGGATGCATGATACGTTTCTGAATGTATTGCCAGTAGCAGTTAGTGAAGCACATAATTTTGTATT]

[-] EMBL AI976018             [GGTAATTATTGAAATATGAAACCAAATCTGATTTAAAAGTGGTGTGGGAATGTAAGTAACAATTGAGAAATGTAAGTAGTATATATATATATGATTGATGAATCTGTAAATTCTTATAGCAGTAACAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGCCAGATAAGAGAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAATTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTAT TAATCCATTCATCACGAATTTGATTCATAATTAAATTACATTCAGCTTGAATAGAACGTGTAATCAATAATGCACCAGATTGAATTCGATTCACATCGGATTGACATAGTTTTTGTTCATCGGTATTACAACGATTTAATTCATCAACAGTAAGACATGCAGCTTTAGCTAGACTGGTAATAGTTGATGTATTAGGCAGTAGACGAGTGAATTCTTTTAAGCATTCTTGGAGATTGGTTGTTGCTTCTGACTGG                                                                       ]
[-] EMBL CD078179             [                                            TGGGAATGTAAGTAACAATTGAGAAATGTAAGTAGTATATATATATATGATTGATGAATCTGTAATTTCTTATAGCAGTAACAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGACAGATAAGAAAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAATTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTATCTAAgctc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD147129             [                                                      AGTAACAATTGAGAAATGTAAGTAGTATATATATATATGATTGATGAATCTGTAAATTCTTATAACAGTAACAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGACAGATAAGAGAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAATTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTAT TAATCCATTCATCACGAATTTGATTCATAATTAAATTACATTCAGCTTGAATAGAACGTGTAATCAATAATGCACCAGATTGAATTCGATTCACATCGGATTGACATAGTTTTTGTTCATCGGTATTACAACGATTTAATTCATCAACAGTAAGACATGCAGCTTTAGCTAGACTGGTAATAGTTGATGTATTAGGCAGTAGACGAGTGAATTCTTTTAAGCATTCTTGGAGATTGGTTGTTGCTTCTGACTGGATTGCATGGATGCATGATACGTTTCTGAATGTATTGCCAGTAGCAGTTAGTGAAGCACATAATTTTGTATT]
[-] EMBL CD168728             [                                                                                              TTGATGAATCTGTAAATTCTTATAGCAGTAGCAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGACAGATAAGAGAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAATTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTAT TAATCCATTCATCACGAATTTGATTCATAATTAAATTACATTCAGCTTGAATAGAACGTGTAATCAATAATGCACCAGATTGAATTCGATTCACATCGGATTGACATAGTTTTTGTTCATCGGTATTACAACGATTTAATTCATCAACAGTAAGACATGCAGCTTTAGCTAGACTGGTAATAGTTGATGTATTAGGCAGTActtgggt                                                                                                                     ]


>consensus_6876#0 GGTAATTATTGAAATATGAAACCAAATCTGATTTAAAAGTGGTGTGGGAATGTAAGTAAC AATTGAGAAATGTAAGTAGTATATATATATATGATTGATGAATCTGTAAATTCTTATAGC AGTAACAATATTAATATTAGTATTATGAGTGTTAATACGCGGATACATATGATAGACAGA TAAGAGAGAGAGATCAGTTGATTTCAAAAGATTGCGCGGCCCGTTCTATTTGTTCCGCAA TTTGATGATAAAAACGTGCTTGATCATGAAGATAGTCTTTGATTTTATTAATCCATTCAT CACGAATTTGATTCATAATTAAATTACATTCAGCTTGAATAGAACGTGTAATCAATAATG CACCAGATTGAATTCGATTCACATCGGATTGACATAGTTTTTGTTCATCGGTATTACAAC GATTTAATTCATCAACAGTAAGACATGCAGCTTTAGCTAGACTGGTAATAGTTGATGTAT TAGGCAGTAGACGAGTGAATTCTTTTAAGCATTCTTGGAGATTGGTTGTTGCTTCTGACT GGATTGCATGGATGCATGATACGTTTCTGAATGTATTGCCAGTAGCAGTTAGTGAAGCAC ATAATTTTGTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)