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Schistosoma mansoni
cluster # 6880 cluster # 6880       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6880#0 length = 1024 sequences # 4  

consensusID : consensus_6880#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1024
fasta sequence
                              [GTGATAATCCTATACGTATCCCGCTTAAACGATTAGATCCAAGCATGGTATTAGGTTTCTTATGCTCAACTGAAAAAGAATTTGATGATTTATGTCATAATTTAAAGGAAGAAGTTCTACATCCTTCAGTAGCCAATTCATGGCCTCTAGTAGAAATTCATACAACAAGACCGTCTAACCTACCACCACTTCCTTCATCCAATATTCCAAATGATCTATTAATTTCTGTATATCCTTCAGACCAGGATAATCTTGGTCATGGTGTTAATGAGAATGCAGATAATTCAATTCACAATACTAATAGTAAAGATGATGTAGAACATGAAGGTAAATTAAGTG-AAGC-ATGGGTGCAGTANAAGCTCTATGGTCTAAATGTAATCAAGTAGCTGGTGATACCGTTCGTACTTTAGCAAATGTACCACAACGATTTGTAAAAGGTCCTGAATATGAAGTTAGTTAA-TTAAAATGATCGACCTCAGTGTTTTGTTATGTATTATTAATAATTAATTATTATCCAATGTAGTTCTACTGGTTATTTATTTATTTGTTTGTTTTAAATGTCGAGTACACACAGCCAGAATTGATTAACAAGATGGGGAAGACGAAAACAATTATTGAAGATTTATCTGTTCTATAAAATGTTTTCCTTTTCCACACATACACACAAACACAGATACAGAGAGATTGAATGATGATGGCAGTTAATGTCGATACCAGAGACTACAATTATTATTTATATTACTATTGTTTTTTCTTTGTTGTCGCCATTGTTTTGTTTTGTGTTTCTCCTTTTGGATTCCAAATTTCACTTTATATCTTTTGTTAGTTATTGACATAGTTTATATTTTTAAAGAGAAAAATTTAACATTTATCAACTGTGATTGTATGGTGTTGATAGTCTGTTAATCGACTGTAATGTTTACTTATCTTGGTAATAACAATAATTGATATTATTATTATTATTATTATTATTACTGATGTCTACTGTTGNTATCATTAACAGCAGTACTAGTAAGATACCAAC]

[+] EMBL CD171469             [GTGATAATCCTATACGTATCCCGCTTAAACGATTAGATCCAAGCATGGTATTAGGTTTCTTATGCTCAACTGAAAAAGAATTTGATGATTTATGTCATAATTTAAAGGAAGAAGTTCTACATCCTTCAGTAGCCAATTCATGGCCTCTAGTAGAAATTCATACAACAAGACCGTCTAACCTACCACCACTTCCTTCATCCAATATTCCAAATGATCTATTAATTTCTGTATATCCTTCAGACCAGGATAATCTTGGTCATGGTGTTAATGAGAATGCAGATAATTCAATTCACAATACTAATAGTAAAGATGATGTAGAACATGAAGGTAAATTAAGTGAAAGC ATGGGTGCAGTANAAGCTCTATGGTCTAAATGTAATCAAGTAGCTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD171127             [                                                                                                                                          CATGGCCTCTAGTAGAAATTCATACAACAAGACCGTCTAACCTACCACCACTTCCTTCATCCAATATTCCAAATGATCTATTAATTTCTGTATATCCTTCAGACCAGGATAATCTTGGTCATGGTGTTAATGAGAATGCAGATAATTCAATTCACAATACTAATAGTAAAGATGATGTAGAACATGAAGGTAAATTAAGTG AAGCAATGGGTGCAGTAAAAGCTCTATGGTCTAAATGTAATCAAGTAGCTGGTGATACCGTTCGTACTTTAGCAAATGTACCACAACGATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078305             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTGGTGATACCGTTCGTACTTTAGCAAATGTACCACAACGATTTGTAAAAGGTCCTGAATATGAAGTTAGTTAA TTAAAATGATCGACCTCAGTGTTTTGTTATGTATTATTAATAATTAATTATTATCCAATGTAGTTCTACTGGTTATTTATTTATTTGTTTGTTTTAAATGTCGAGTACACACAGCCAGAATTGATTAACAAGATGGGGAAGACGAAAACAATTATTGAAGATTTATCTGTTCTATAAAATGTTTTCCTTTTCCACACATACACACAAACACAGATACAGAGAGATTGAATGATGATGGCAGTTAATGTCGATACCAGAGACTACAATTATTATTTATATTACTATTGTTTTTTCTTTGTTGTCGCCATTGTTTTGTTTTGTGTTTCTCCTTTTGGATTCCAAATTTCACTTTATATCTTTTGTTAGTTATTGACATAGTTTATATTTTTAAAGAGAAAAATTTAACATTTATCAACTGTGATTGTATGGTGTTGATAGTCTGTTAATCGACTGTAATGTTTACTTATCTTGGTAATAACAATAATTGATATTATTATTATTATTATTATTATTACTGATGTCTACTGTTGNTATCATTAACAGCAGTACTAGTAAGATACCAAC]
[+] EMBL CD078393             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acgaggGCTGGTGATACCGTTCGTACTTTAGCAAATGTACCACAACGATTTGTAAAAGGTCCTGAATATGAAGCTAGTTAATTTAAAATGATCGACCTCAGgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_6880#0 GTGATAATCCTATACGTATCCCGCTTAAACGATTAGATCCAAGCATGGTATTAGGTTTCT TATGCTCAACTGAAAAAGAATTTGATGATTTATGTCATAATTTAAAGGAAGAAGTTCTAC ATCCTTCAGTAGCCAATTCATGGCCTCTAGTAGAAATTCATACAACAAGACCGTCTAACC TACCACCACTTCCTTCATCCAATATTCCAAATGATCTATTAATTTCTGTATATCCTTCAG ACCAGGATAATCTTGGTCATGGTGTTAATGAGAATGCAGATAATTCAATTCACAATACTA ATAGTAAAGATGATGTAGAACATGAAGGTAAATTAAGTGAAGCATGGGTGCAGTANAAGC TCTATGGTCTAAATGTAATCAAGTAGCTGGTGATACCGTTCGTACTTTAGCAAATGTACC ACAACGATTTGTAAAAGGTCCTGAATATGAAGTTAGTTAATTAAAATGATCGACCTCAGT GTTTTGTTATGTATTATTAATAATTAATTATTATCCAATGTAGTTCTACTGGTTATTTAT TTATTTGTTTGTTTTAAATGTCGAGTACACACAGCCAGAATTGATTAACAAGATGGGGAA GACGAAAACAATTATTGAAGATTTATCTGTTCTATAAAATGTTTTCCTTTTCCACACATA CACACAAACACAGATACAGAGAGATTGAATGATGATGGCAGTTAATGTCGATACCAGAGA CTACAATTATTATTTATATTACTATTGTTTTTTCTTTGTTGTCGCCATTGTTTTGTTTTG TGTTTCTCCTTTTGGATTCCAAATTTCACTTTATATCTTTTGTTAGTTATTGACATAGTT TATATTTTTAAAGAGAAAAATTTAACATTTATCAACTGTGATTGTATGGTGTTGATAGTC TGTTAATCGACTGTAATGTTTACTTATCTTGGTAATAACAATAATTGATATTATTATTAT TATTATTATTATTACTGATGTCTACTGTTGNTATCATTAACAGCAGTACTAGTAAGATAC CAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)