cluster # 6882

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Schistosoma mansoni
cluster # 6882 cluster # 6882 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6882#0 length = 585 sequences # 4

consensusID : consensus_6882#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 585
fasta sequence

                              [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA-ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG-AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC-AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT]

[+] EMBL CD061026             [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGGTG AATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAAAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGACGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATNTATTCAAGTAATCTAATG                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI390089             [                             TATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTCTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAATATGTTATCAGAAGAAGAGATTGTACATGTACTCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGACAAAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTCTGTGTTT ATA TGGATTTACACAAGTAATCTA                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF936661             [                                          TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT]
[+] EMBL AI975001             [                                          TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGCCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTA TGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTATACAAATGA             ]




>consensus_6882#0
ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAA
CCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTA
TTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCA
GAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTC
CTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAAATGTTATCA
GAAGAAGAGATAGTACATGAATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTCAAGAAGCAAAA
GATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCA
ATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTT
AATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATA
TGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case