These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6882#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 585 fasta sequence [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA-ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG-AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC-AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT] [+] EMBL CD061026 [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGGTG AATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAAAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGACGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATNTATTCAAGTAATCTAATG ] [+] EMBL AI390089 [ TATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTCTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAATATGTTATCAGAAGAAGAGATTGTACATGTACTCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGACAAAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTCTGTGTTT ATA TGGATTTACACAAGTAATCTA ] [+] EMBL BF936661 [ TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT] [+] EMBL AI975001 [ TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGCCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTA TGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTATACAAATGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||