Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 6882 cluster # 6882       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6882#0 length = 585 sequences # 4  

consensusID : consensus_6882#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 585
fasta sequence
                              [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA-ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG-AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC-AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT]

[+] EMBL CD061026             [ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGGTG AATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAAAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGACGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATNTATTCAAGTAATCTAATG                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI390089             [                             TATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTCTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAATATGTTATCAGAAGAAGAGATTGTACATGTACTCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGACAAAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTCTGTGTTT ATA TGGATTTACACAAGTAATCTA                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF936661             [                                          TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT]
[+] EMBL AI975001             [                                          TATAAAATGTCAAAGAAACCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTATTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCAGAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTCCTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAA ATGTTATCAGAAGAAGAGATAGTACATG AATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTC AAGAAGCAAAAGATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCAATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGCCATAATATTTTCATTTAATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTA TGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATATGTATTATTTTAAACATACCGTATACAAATGA             ]


>consensus_6882#0 ATTATTACTATAGAAAACTAGTTAGAAACTATTGTAAAATTTTATAAAATGTCAAAGAAA CCCAGTAATAATCAAGATGTTTCATTATCTTCAAAAAGTGTTCAGTTCATAATAGCATTA TTTGGAATATCTACATTTATGATACTCAACATCACACTTATTGTGAGACAATTTCATCCA GAGTCGAAAAATTCCCCAACTTTGATGATATTTCAAACTGGAATAACTTTGCTTGGTTTC CTTATAATTATATTTCTTGTTGTAATAAGTCAATTGAATAAAACGTCTGAAATGTTATCA GAAGAAGAGATAGTACATGAATCGATAAATAAAGAAGCATTGGCTCGTCAAGAAGCAAAA GATGATACATACATACTATCAGTTTAATATTGGATTTATTCAAGTAATCTAATGTGTTCA ATTACCTTCAAAGAATTAGGTTTCTTAATAACGGTTCTCGCAGTCATAATATTTTCATTT AATTATGGGTAGCTTACATTCATAGTATTGTGTGTAATTATCATTAAGATTTATTATATA TGTATTATTTTAAACATACCGTAAACAAATGAATCAATAAACTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)