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Schistosoma mansoni
cluster # 6887 cluster # 6887       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6887#0 length = 930 sequences # 4  
consensusID : consensus_6887#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 930
fasta sequence 
                              [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTT-AATATCTTGNTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTTTGCATTTTNCGGATTTGC]

[+] EMBL BF936366             [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGGATCACCAACCTTCTGAT                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AI976309             [ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCAATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAATTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATGTGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGCGCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078774             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTTTGTGATTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTT AATATCTTGNTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTTTGCATTTTNCGGAT    ]
[+] EMBL CD078555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTACTTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCCTGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGGTTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAAATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTTGGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGATTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTATGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGCAATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAACAGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTTAAATATCTTGTTGTCGTTACTTTTCACACATTATGCTNTGCATTNTCCGGATTTGC]




>consensus_6887#0
ATCATCTTCATCTTTACCGGTACCATCAGGGTCATGCTTGTCTGATAATCAAATACACCA
ATCATTGGTAGCACCAGTATCACTTCATAAGATGCTTGAACAAACTGAATGCTCTTCTAA
TTCAGAAATTATATCAAAAAATGATAATGATAGTTTGAGCATAATAAAATCCGCTTTATG
TGAGGAAAGTGCTATCAATAAGGGTGGTTGTAGTGATACAAGCCTTGTATCTCATCAAGC
GCTCATTTCTACTCATGATAGTATCAATACAACTAATGCCAATGTTAATGATTTTTGTGA
TTATTTACCTTACGATCGTAATTATTATCCCAATTTTTCCGAGGCTCCACAATCATCTAC
TTCATCAAATCTAGTTTTTTACTCACCAAATTTGTATAAAGCGCCGGATGATGTCAATCC
TGATCCGTTTGTCATGTTAGCATGGAGATGTCAACAATTGTCGCATTTTACACTAATTGG
TTATTGGTTTAATATTGTGGATATGAAAGCTTTTACAGCTCTTCGTGGTACATCACTTAA
ATCTTTTCGTATTCCTAGTTGTTGTGTTTCTATTGATGATCAATCTTGGCCATTTAATTT
GGATGAGAATTTAAATGAAATGTCACGTAATGTAGGCTACAAATGGATACCATTGGAAGA
TTTAAATTTACCCTCTGCTGTTTGGAATCACCAACCTCCTGATCCTACTGCATGTTTCTA
TGAAATTCAAAATTCCTGTGGTCTAGACAATGTTAATGATTAGTAAATATCACTAAAAGC
AATTGTTTTATCCATATTTATCAATGCTAATTATTGTCATTAATTCGATTTCTTTACAAC
AGACCATTTATTCCATATTTATATTTTATTCGTTTAATATCTTGNTGTCGTTACTTTTCA
CACATTATGCTTTGCATTTTNCGGATTTGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)