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Schistosoma mansoni
cluster # 6888 cluster # 6888       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6888#0 length = 960 sequences # 4  
consensusID : consensus_6888#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 960
fasta sequence 
                              [TGTATTGTTTTGGCCAATACTACCGTTTATTCTTGAATTGATTGTTATTGCTCAAGTTTTATTTGTGGCTATTTCATTGCGGACAATAGCTGATCCTATTGGAACTAAAATTACCAATGATGATCTTACCGTAACCCCGGGATTCTCAGATAAGACTAGAAATGATATAAGAGGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTACAGCATTGCCTTTACTCGCGCGCAATGTAGTCAGACTTTTTGTGGTCGATAAAGTGACTGATTTCATTCTATTTATTGGAAAACTTGTTGTTGTCAGTATTGTTGGTGGTGTGGCTTATGTCTATTTGGAAGGTATATTGTTCAAAGGGAATGAAGCTCTAAATGATGCGTTACATTCTCATCTTCATTATTCATTCGTGCCATTAGGTATTATCATACTTTCCTCTTACCTTGNGGCGTCATTATTTTCAAGTGTTTTTGAAATGGGTGTCGATACAATATTTCT]

[+] EMBL CD168672             [TGTATTGTTTTGGCCAATACTACCGTTTATTCTTGAATTGATTGTTATTGCTCAAGTTTTATTTGTGGCTATTTCATTGCGGACAATAGCTGATCCTATTGGAACTAAAATTACCAATGATGATCTTACCGTAACCCCGGGATTCTCAGATAAGACTAGAAATGATATAAGAGGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACANATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD134719             [                                                                                                                                                                            GGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTACAGCATTGCCTTTACTCGCGCGCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD181654             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCCTTTATCATACTGGTTCATTAGCATNTGGGTCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD078628             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTTCAGCATTGTCTTTACTCGCGCGCAATGTAGTCAGACTTTTTGTGGTCGATAAAGTGACTGATTTCATTCTATTTATTGGAAAACTTGTTGTTGTCAGTATTGTTGGTGGTGTGGCTTATGTCTATTTGGAAGGTATATTGTTCAAAGGGAATGAAGCTCTAAATGATGCGTTACATTCTCATCTTCATTATTCATTCGTGCCATTAGGTATTATCATACTTTCCTCTTACCTTGNGGCGTCATTATTTTCAAGTGTTTTTGAAATGGGTGTCGATACAATATTTCT]




>consensus_6888#0
TGTATTGTTTTGGCCAATACTACCGTTTATTCTTGAATTGATTGTTATTGCTCAAGTTTT
ATTTGTGGCTATTTCATTGCGGACAATAGCTGATCCTATTGGAACTAAAATTACCAATGA
TGATCTTACCGTAACCCCGGGATTCTCAGATAAGACTAGAAATGATATAAGAGGGATTTT
TCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCT
GTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTT
TTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGA
ATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTT
ATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTT
ATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAA
TCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACT
TCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTG
TTCTGCCTCTCGTACAGCATTGCCTTTACTCGCGCGCAATGTAGTCAGACTTTTTGTGGT
CGATAAAGTGACTGATTTCATTCTATTTATTGGAAAACTTGTTGTTGTCAGTATTGTTGG
TGGTGTGGCTTATGTCTATTTGGAAGGTATATTGTTCAAAGGGAATGAAGCTCTAAATGA
TGCGTTACATTCTCATCTTCATTATTCATTCGTGCCATTAGGTATTATCATACTTTCCTC
TTACCTTGNGGCGTCATTATTTTCAAGTGTTTTTGAAATGGGTGTCGATACAATATTTCT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)