These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6888#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 960 fasta sequence [TGTATTGTTTTGGCCAATACTACCGTTTATTCTTGAATTGATTGTTATTGCTCAAGTTTTATTTGTGGCTATTTCATTGCGGACAATAGCTGATCCTATTGGAACTAAAATTACCAATGATGATCTTACCGTAACCCCGGGATTCTCAGATAAGACTAGAAATGATATAAGAGGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTACAGCATTGCCTTTACTCGCGCGCAATGTAGTCAGACTTTTTGTGGTCGATAAAGTGACTGATTTCATTCTATTTATTGGAAAACTTGTTGTTGTCAGTATTGTTGGTGGTGTGGCTTATGTCTATTTGGAAGGTATATTGTTCAAAGGGAATGAAGCTCTAAATGATGCGTTACATTCTCATCTTCATTATTCATTCGTGCCATTAGGTATTATCATACTTTCCTCTTACCTTGNGGCGTCATTATTTTCAAGTGTTTTTGAAATGGGTGTCGATACAATATTTCT] [+] EMBL CD168672 [TGTATTGTTTTGGCCAATACTACCGTTTATTCTTGAATTGATTGTTATTGCTCAAGTTTTATTTGTGGCTATTTCATTGCGGACAATAGCTGATCCTATTGGAACTAAAATTACCAATGATGATCTTACCGTAACCCCGGGATTCTCAGATAAGACTAGAAATGATATAAGAGGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACANATTTT ] [+] EMBL CD134719 [ GGGATTTTTCAACTTATTCCGTGTGATCCTTTACAAAACAATTCAGCTGGCAAAGCTTGTCGTTTTCTGTATTATGGAGACCGAAAATATACTATCTACCTACAATTATTCAATTTGTTCATGTTCTTTTGGTTAATCAATTTTGTCAAATCCTTAACACAAATGACTTTAGCAGGAACATTTGCTGAATACTACTTTTCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTACAGCATTGCCTTTACTCGCGCGCAAT ] [-] EMBL CD181654 [ TCATCTCAAGATAAAAAATCTACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCCTTTATCATACTGGTTCATTAGCATNTGGGTCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTC ] [+] EMBL CD078628 [ ACGTCAAAGTGTCCATTAATAACCAGTTTATTTCGATCAACCTTTTATCATACTGGTTCATTAGCATTTGGATCATTTCTAATTGCTTTATTACAATGGCTACGTGTTACACTAGAATATATCAATACAAAATTGAAGAAAGCTAATAATCCTGTTACAAATTTTCTTTTAAAATGTTTAAGTTGTTGTTTTTGGCTACTTGAGAAACTTCTAAAATTTCTCAATAGAAATGCTTTTATTGTGGTTGCTATCTATGGTCAAAGCTTTTGTTCTGCCTCTCGTTCAGCATTGTCTTTACTCGCGCGCAATGTAGTCAGACTTTTTGTGGTCGATAAAGTGACTGATTTCATTCTATTTATTGGAAAACTTGTTGTTGTCAGTATTGTTGGTGGTGTGGCTTATGTCTATTTGGAAGGTATATTGTTCAAAGGGAATGAAGCTCTAAATGATGCGTTACATTCTCATCTTCATTATTCATTCGTGCCATTAGGTATTATCATACTTTCCTCTTACCTTGNGGCGTCATTATTTTCAAGTGTTTTTGAAATGGGTGTCGATACAATATTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||