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Schistosoma mansoni
cluster # 6889 cluster # 6889       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6889#0 length = 985 sequences # 4  
consensusID : consensus_6889#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 985
fasta sequence 
                              [GTTTTTTAAAATCTATGAATTTTTCCGGAGTTATGTATTGTCCAGTGTCTGGGTTGGTCGGAGCTAACTTAGTACCTCAAAATTTGTCCAGTAGCAGTAAAAACGCTTCAGATACAAGTTCTAACCTGTTTACGTGGTATACGGGACCTTCGTTACTCGAACTTATTGATTCGATTCCACCACCAGAAAGAACTGTTGATGGACCTTTTCGTTTTGTTGTCAGTGATATATTTAAACCTGCTGGTTCCAGTGTACCGATGGTTGCTGGACGGGTTATATCTGGAGCTATTTCTAGCGGTGTAAATATACCTACAAGTAAGGTTATTTGCTTGCCAAGTGATGTACGAACTTGTGTGAAATCTATCAGATCATTGTGTAATACTCGTACAAGTCCACATGATGCTGAAGGTGATCTTGGAGGCAAATTGTTAGATCAAGTTGTTAAATTTGCATTTTCTGGTGATCAAGTGGCATTGATGTTGACAGATATTGATCCATTTCAAACTCTTATTCCTGGTGATTTACTTACTGATCCAGATAATCCAATACAACCATCCACTTGTATTTCAGCTAAATTATTAGTATTCTCTATACAACAACCTATCACAAAAGGTTATCCTGTTATATACTATTATAATTGTGCCAATGTAGCAGCCACTATCACTAAATTAAAATCTATGACTCATCGAGAAAACAAAATAGAAAAAGTCGTTCGAAAACCAAGATGTCTTCTTGGTAATTGTACAGCAAATGTAGAGTTGACATTTGAAAGACCAATTTGTATAGAAGTTTATGAAAAATGTAAACCTCTTGGACGATTTATGCTTCGTGTTGGCGGTGAATCAATTGCTGGTGGTACTGTAACAAAAATCATTCCATCAAAAAAGGAATCATCTAGTTGATCTGTAGAAAACAATCAAACAAATGGTATCTTATGAAGGGAAGAAGAACAAATATGTTCTCTTTGATTGTTTTAATATTTAAC]

[-] EMBL CD128929             [GTTTTTTAAAATCTATGAATTTTTCCGGAGTTATGTATTGTCCAGTGTCTGGGTTGGTCGGAGCTAACTTAGTACCTCAAAATTTGTCCAGTAGCAGTAAAAACGCTTCAGATACAAGTTCTAACCTGTTTACGTGGTATACGGGACCTTCGTTACTCGAACTTATTGATTCGATTCCACCACCAGAAAGAACTGTTGATGGACCTTTTCGTTTTGTTGTCAGTGATATATTTAAACCTGCTGGTTCCAGTGTACCGATGGTTGCTGGACGGGTTATATCTGGAGCTATTTCTAGCGGTGTAAATATACCTACAAGTAAGGTTATTTGCTTGCCAAGTGATGTACGAACTTGTGTGAAATCTATCAGATCATTGTGTAATACTCGTACAAGTCCACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD078640             [                                                                                                                                                                                                                                            CCTGCTGGTTCCAGTGTACCGATGGTTGCTGGACGGGTTATATCTGGAGCTATTTCTAGCGGTGTAAATATACCTACAAGTAAGGTTATTTGCTTGCCAAGTGATGTACGAACTTGTGTGAAATCTATCAGATCATTGTGTAATACTCGTACAAGTCAAAATGATGCTGAAGGTGATCTTGGAGGCAAATTGTTAGATCAAGTTGTTAAATTTGCATTTTCTGGTGATCAAGTGGCATTGATGTTGACAGATATTGATCCATTTCAAACTCTTATTCCTGGTGATTTACTTACTGATCCAGATAATCCAATACAACCATCCACTTGTATTTCAGCTAAATTATTAGTATTCTCTATACAACAACCTATCACAAAAGGTTATCCTGTTATATACTATTATAATTGTGCCAATGTAGCAGCCACTATCACTAAATTAAAATCTATGACTCATCGAGAAAACAAAATAGAAAAAGTCGTTCGAAAACCAAGATGTCTTCTTGGTAATTGTACAGCACATGTAGAGTTGACATTTGAAAG                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD133036             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TACTGATCCAGATAATCCAATACAACCATCCACTTGTATTTCAGCTAAATTATTAGTATTCTCTATACAACAACCTATCACAAAAGGTTATCCTGTTATATACTATTATAATTGTGCCAATGTAGCAGCCACTATCACTAAATTAAAATCTATGACTCATCGAGAAAACAAAATAGAAAAAGTCGTTCGAAAACCAAGATGTCTTCTTGGTAATTGTACAGCAAATGTAGAGTTGACATTTGAAAGACCAATTTGTATAGAAGTTTATGAAAAATGTAAACCTCTTGGACGATTTATGCTTCGTGTTGGCGGTGAATCAATTGCTGGTGGTACTGTAACAAAAATCATTCCATCAAAAAAGGAATCATCTAGTTGATCTGTAGAAAACAATCAAACAAATGGTATCTTATGAAGGGAAGAAGAACAAATATGTTCTCTTTGATTGTTTTAATATTTAAC]
[-] EMBL CD196852             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATATACTATTATAATTGTGCCAATGTAGCAGCCACTATCACTAAATTAAAATCTATGACTCATCGAGAAAACAAAATAGAAAAAGTCGTTCGAAAACCAAGATGTCTTCTTGGTAATTGTACAGCAAATGTAGAGTTGACATTTGAAAGACCAATTTGTATAGAAGTTTATGAAAAATGTAAACCTCTTGGACGATTTATGCTTCGTGTTGGCGGTGAATCAATTGCTGGTGGTACTGTAACAAAAATCATTCCATCAAAAAAGGAATCATCTAGTTGATCTGTAGAAAACAATCAAACAAATGGTATCTCATGAAGGGAAGAAGAAC                                  ]




>consensus_6889#0
GTTTTTTAAAATCTATGAATTTTTCCGGAGTTATGTATTGTCCAGTGTCTGGGTTGGTCG
GAGCTAACTTAGTACCTCAAAATTTGTCCAGTAGCAGTAAAAACGCTTCAGATACAAGTT
CTAACCTGTTTACGTGGTATACGGGACCTTCGTTACTCGAACTTATTGATTCGATTCCAC
CACCAGAAAGAACTGTTGATGGACCTTTTCGTTTTGTTGTCAGTGATATATTTAAACCTG
CTGGTTCCAGTGTACCGATGGTTGCTGGACGGGTTATATCTGGAGCTATTTCTAGCGGTG
TAAATATACCTACAAGTAAGGTTATTTGCTTGCCAAGTGATGTACGAACTTGTGTGAAAT
CTATCAGATCATTGTGTAATACTCGTACAAGTCCACATGATGCTGAAGGTGATCTTGGAG
GCAAATTGTTAGATCAAGTTGTTAAATTTGCATTTTCTGGTGATCAAGTGGCATTGATGT
TGACAGATATTGATCCATTTCAAACTCTTATTCCTGGTGATTTACTTACTGATCCAGATA
ATCCAATACAACCATCCACTTGTATTTCAGCTAAATTATTAGTATTCTCTATACAACAAC
CTATCACAAAAGGTTATCCTGTTATATACTATTATAATTGTGCCAATGTAGCAGCCACTA
TCACTAAATTAAAATCTATGACTCATCGAGAAAACAAAATAGAAAAAGTCGTTCGAAAAC
CAAGATGTCTTCTTGGTAATTGTACAGCAAATGTAGAGTTGACATTTGAAAGACCAATTT
GTATAGAAGTTTATGAAAAATGTAAACCTCTTGGACGATTTATGCTTCGTGTTGGCGGTG
AATCAATTGCTGGTGGTACTGTAACAAAAATCATTCCATCAAAAAAGGAATCATCTAGTT
GATCTGTAGAAAACAATCAAACAAATGGTATCTTATGAAGGGAAGAAGAACAAATATGTT
CTCTTTGATTGTTTTAATATTTAAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)